| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,024 | T→C | 12.5% | A436A (GCA→GCG) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,024 | 0 | T→C | 12.5% | 86.8 0.0 ‑0.0 | 288 | A436A (GCA→GCG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (19/17): ref base (135/117): total (154/134) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.96e-01 | ||||||||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
CGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGC > NC_007779/3449924‑3450124 | cGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAAt < 1:12627365/101‑1 (MQ=255) aaCAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCt < 1:5402878/101‑1 (MQ=255) gCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGAt < 1:732062/101‑1 (MQ=255) cATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAc > 1:8340509/1‑101 (MQ=255) cATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAc < 1:12457827/101‑1 (MQ=255) aTCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGGGCAGCTGGATTACTTTACCTTCGACCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGGTAcc > 1:1638288/1‑101 (MQ=255) tCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAccc > 1:9155370/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg > 1:4607769/1‑101 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg < 1:4926266/101‑1 (MQ=255) tGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAg < 1:1272394/101‑1 (MQ=255) ggTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGa < 1:2553902/101‑1 (MQ=255) aTCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCa > 1:7605950/1‑101 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga < 1:2910205/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:4491888/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:13577874/101‑1 (MQ=255) aaGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGt < 1:5180968/101‑1 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:15091180/101‑1 (MQ=255) aGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTc < 1:11565574/101‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg > 1:9191169/1‑101 (MQ=255) cGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCa < 1:175614/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:13458896/101‑1 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:13133897/101‑1 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:13726820/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc < 1:8854709/101‑1 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc < 1:3113360/101‑1 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:13544872/1‑101 (MQ=255) tGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTca > 1:8313103/1‑101 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag < 1:12822703/101‑1 (MQ=255) cctcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATAACCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagc < 1:1276056/92‑1 (MQ=255) ccGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagc < 1:1330395/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca > 1:8513733/1‑101 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:9404666/101‑1 (MQ=255) tcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagcag > 1:13917989/8‑101 (MQ=255) tcacatgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTcagcag < 1:1126240/94‑1 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag < 1:6844096/101‑1 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag > 1:2722219/1‑101 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt < 1:7687136/101‑1 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt > 1:10547314/1‑101 (MQ=255) atgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGAcc < 1:14500406/98‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:9746698/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:1013217/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:1113714/1‑101 (MQ=255) tgccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGGGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCg > 1:6209776/3‑101 (MQ=255) gccAGTGGGTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCgg > 1:6976686/2‑101 (MQ=255) aCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCgg < 1:6508448/101‑1 (MQ=255) ccAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCggg > 1:14910288/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt < 1:375531/101‑1 (MQ=255) agtgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtg > 1:1289029/4‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:4151599/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:2005814/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:12978495/1‑101 (MQ=255) tgggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGgtgtc < 1:8138492/100‑2 (MQ=255) gggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTc > 1:7872731/1‑101 (MQ=255) gggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTc > 1:7131804/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg > 1:12293018/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcg < 1:4429537/101‑1 (MQ=255) gCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCgg > 1:6291514/1‑101 (MQ=255) gCAGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggta > 1:9635272/1‑98 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:14355311/1‑101 (MQ=255) aGCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaat > 1:9330708/1‑96 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:872408/101‑1 (MQ=255) gCTGAATTGCCTTACCCTCAACCAGGACCGGCTCGAACGCCTGAATACCCAGGCGGTGCAGCGTAGGTGCACGGTTCAGCAGGACCGGGTGTCcggtaatg > 1:825016/1‑95 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:6710135/1‑101 (MQ=255) gATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt < 1:5527381/101‑1 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc > 1:4231297/1‑101 (MQ=255) tAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCg > 1:10993516/1‑101 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt < 1:3057380/101‑1 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:4298765/1‑101 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:11400884/1‑101 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc < 1:1870735/101‑1 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGGTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc < 1:14074522/101‑1 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa < 1:479064/101‑1 (MQ=255) tACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAgg > 1:14724341/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGa > 1:5042574/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGa > 1:2352637/1‑101 (MQ=255) ccTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGat < 1:637350/101‑1 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:2107830/1‑101 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:1037445/1‑101 (MQ=255) tCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa > 1:1292970/1‑101 (MQ=255) cAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa > 1:3975275/1‑101 (MQ=255) cAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa < 1:348420/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:8627023/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:5822447/101‑1 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc < 1:10015238/101‑1 (MQ=255) gTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACg > 1:3287384/1‑101 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:7693872/1‑101 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:14422744/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAc < 1:6743704/101‑1 (MQ=255) ccGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACa < 1:12519699/101‑1 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg < 1:15049769/101‑1 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg > 1:11957619/1‑101 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg > 1:9226869/1‑101 (MQ=255) gTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGct > 1:5578229/1‑101 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt > 1:986986/1‑101 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:14210995/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTGCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct > 1:10868111/1‑101 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt > 1:3498119/1‑101 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt > 1:8395124/1‑101 (MQ=255) aaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCttcttc < 1:9286763/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc > 1:13262027/1‑101 (MQ=255) | CGTGAACAGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGC > NC_007779/3449924‑3450124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |