Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 190,446 | T→C | 7.6% | S191S (TCT→TCC) | rpsB → | 30S ribosomal protein S2 |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 190,446 | 0 | T→C | 7.6% | 40.5 ‑1.1 ‑0.0 | 236 | S191S (TCT→TCC) | rpsB | 30S ribosomal protein S2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/10): ref base (128/90): total (136/100) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.21e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCC > NC_007779/190346‑190546 | cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct > 1:14972579/1‑101 (MQ=255) cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct < 1:12678285/101‑1 (MQ=255) cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct < 1:11050775/101‑1 (MQ=255) cGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAActct > 1:699714/1‑101 (MQ=255) gACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGa > 1:8901974/1‑101 (MQ=255) gACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGa < 1:7152006/101‑1 (MQ=255) cGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACATATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATc < 1:4392921/101‑1 (MQ=255) cGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATc > 1:11316350/1‑101 (MQ=255) gCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATcc < 1:8746376/101‑1 (MQ=255) gCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATcc < 1:4509589/101‑1 (MQ=255) gTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACg > 1:9912422/1‑101 (MQ=255) gTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACg < 1:9643852/101‑1 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt > 1:4455151/1‑101 (MQ=255) ttGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgt > 1:6926403/1‑101 (MQ=255) tGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGgtg < 1:598369/101‑1 (MQ=255) tAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGtt < 1:6172963/101‑1 (MQ=255) tAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGtt < 1:9355990/101‑1 (MQ=255) aaTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTg < 1:4552238/101‑1 (MQ=255) aaTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTg > 1:4015979/1‑101 (MQ=255) aTCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGa > 1:13578929/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc < 1:8082523/101‑1 (MQ=255) gCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGt > 1:3351010/1‑101 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGtt < 1:4887866/101‑1 (MQ=255) cTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGtt < 1:14675796/101‑1 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa < 1:8517790/101‑1 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa > 1:1909059/1‑101 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTa > 1:10360553/1‑101 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt < 1:637050/101‑1 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt < 1:4249921/101‑1 (MQ=255) gACCACAAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt < 1:11474243/101‑1 (MQ=255) cACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATccc > 1:2817799/1‑101 (MQ=255) cACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATccc > 1:11994643/1‑101 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg < 1:6595857/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg < 1:5734043/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg > 1:4276840/1‑101 (MQ=255) gAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCggg > 1:6219535/1‑101 (MQ=255) gAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCggg < 1:35326/101‑1 (MQ=255) aTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacga < 1:3782188/101‑1 (MQ=255) aTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacga < 1:7269694/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:5616389/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac < 1:14820907/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac < 1:12637330/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac > 1:14353828/1‑101 (MQ=255) tATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgacg < 1:9223252/101‑1 (MQ=255) tATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgacg < 1:3715526/101‑1 (MQ=255) aTCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGc > 1:7418774/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa < 1:12142031/101‑1 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:159329/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:12881828/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAAt > 1:12302194/1‑101 (MQ=255) aagaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATc > 1:521149/1‑101 (MQ=255) aagaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATc < 1:11599486/101‑1 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:10714879/1‑101 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:1523335/1‑101 (MQ=255) aagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCgc > 1:6676699/1‑100 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:6901545/1‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:13455414/1‑101 (MQ=255) aacaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgt > 1:2240171/1‑101 (MQ=255) aacaacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtgt > 1:8270873/1‑101 (MQ=255) agaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgct > 1:7719501/6‑99 (MQ=255) gaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgctt < 1:179273/97‑4 (MQ=255) caacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGa > 1:2209481/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:13160845/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:6091049/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:6286970/1‑101 (MQ=255) agcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttcc > 1:8397391/3‑96 (MQ=255) acCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAcc > 1:5259587/1‑101 (MQ=255) gcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccg > 1:6786113/2‑95 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:13299316/1‑101 (MQ=255) cTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgt < 1:13381843/101‑8 (MQ=255) cTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgt < 1:10411045/101‑8 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTg > 1:10531859/1‑101 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt < 1:14197964/101‑1 (MQ=255) gggCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtgc < 1:10174072/101‑10 (MQ=255) gggCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtgc < 1:1408661/101‑10 (MQ=255) tATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAcc > 1:1493259/1‑101 (MQ=255) 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tATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCt > 1:2012775/1‑101 (MQ=255) tATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCt > 1:15069189/1‑101 (MQ=255) aTTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTACGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTg > 1:9062159/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt > 1:2656732/1‑101 (MQ=255) tGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtg > 1:9685232/1‑101 (MQ=255) cTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgct > 1:10062368/1‑101 (MQ=255) cTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgct < 1:1142578/101‑1 (MQ=255) gTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAc < 1:8197576/101‑1 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc > 1:2560978/1‑101 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc < 1:14589450/101‑1 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc > 1:11979092/1‑101 (MQ=255) ccAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGt > 1:845456/1‑101 (MQ=255) ccAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGt < 1:211207/101‑1 (MQ=255) aCTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGaa < 1:14025485/101‑1 (MQ=255) ctctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAg < 1:10691632/101‑1 (MQ=255) tGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGcc > 1:12967061/1‑101 (MQ=255) tGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGcc > 1:12216065/1‑101 (MQ=255) | CGGACGCTCTGTTTGTAATCGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCC > NC_007779/190346‑190546 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |