| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 190,464 | C→T | 7.7% | D197D (GAC→GAT) | rpsB → | 30S ribosomal protein S2 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 190,464 | 0 | C→T | 7.7% | 39.6 ‑1.6 ‑0.0 | 232 | D197D (GAC→GAT) | rpsB | 30S ribosomal protein S2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (8/10): ref base (131/83): total (139/93) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.11e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.74e-01 | ||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGCTT > NC_007779/190365‑190564 | cGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACt > 1:14934277/1‑101 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc < 1:5851671/101‑1 (MQ=255) aTGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTc < 1:11296207/101‑1 (MQ=255) gCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGt > 1:3351010/1‑101 (MQ=255) gCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGt < 1:11464060/101‑1 (MQ=255) tGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGATGGTGTTGACTTCGTTa > 1:11993806/1‑101 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt < 1:4249921/101‑1 (MQ=255) gACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTAt > 1:8807457/1‑101 (MQ=255) aCCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATc < 1:5230496/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg < 1:15081985/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg < 1:5734043/101‑1 (MQ=255) cGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCgg > 1:4276840/1‑101 (MQ=255) gAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCggg < 1:35326/101‑1 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt > 1:14703352/1‑101 (MQ=255) aaCACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGGATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGt > 1:2235224/1‑101 (MQ=255) cacaTTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTaa < 1:13685240/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:4476840/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgac < 1:5616389/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac < 1:12637330/101‑1 (MQ=255) cTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgac > 1:14353828/1‑101 (MQ=255) tATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAacgacgacg < 1:3715526/101‑1 (MQ=255) aTCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGc > 1:7418774/1‑101 (MQ=255) aTCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGc < 1:9863383/101‑1 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:12881828/1‑101 (MQ=255) cAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCaa > 1:6652732/1‑101 (MQ=255) aagaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATc < 1:11599486/101‑1 (MQ=255) agaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATcc > 1:14907199/1‑101 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:10714879/1‑101 (MQ=255) gaagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCg > 1:2174551/1‑101 (MQ=255) aagCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCgc > 1:6676699/1‑100 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc > 1:6901545/1‑101 (MQ=255) gCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGc < 1:530876/101‑1 (MQ=255) aaaCAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCtg > 1:313353/1‑101 (MQ=255) agaagcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgct > 1:8451824/6‑99 (MQ=255) caacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGa < 1:3724505/101‑1 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:13160845/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:12720561/1‑101 (MQ=255) aacCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAc > 1:1795182/1‑101 (MQ=255) agcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttcc < 1:10527753/99‑6 (MQ=255) agcTGGGCATTCCCGTTGTTGCCATCCTGGACCCCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttcc < 1:14994643/99‑6 (MQ=255) acCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAcc < 1:168818/101‑1 (MQ=255) gcTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccg > 1:6786113/2‑95 (MQ=255) ccTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGAccc > 1:12099241/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:9172778/1‑101 (MQ=255) cTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCt > 1:13299316/1‑101 (MQ=255) cTGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgt < 1:10411045/101‑8 (MQ=255) tGGGCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtg < 1:1564809/101‑9 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt > 1:623828/1‑101 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt > 1:10468013/1‑101 (MQ=255) gggTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGt < 1:14197964/101‑1 (MQ=255) gggCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtgc < 1:13465286/101‑10 (MQ=255) gggCATTCCGGTTGTTGCCATCCTGGACACCAACTGCGACCCGGATGACGTTGATTTCCCGATCCCGGGCAACGACGACGCAATCCGCGCtgcttccgtgc < 1:1408661/101‑10 (MQ=255) gTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAc > 1:4634705/1‑101 (MQ=255) gTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTAc < 1:7225267/101‑1 (MQ=255) tCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTgg < 1:10971980/101‑1 (MQ=255) ccGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTggg > 1:11743174/1‑101 (MQ=255) cGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgc < 1:7577104/101‑1 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg > 1:6448019/1‑101 (MQ=255) ggTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGgcg > 1:3814078/1‑101 (MQ=255) tATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCt > 1:13380674/1‑101 (MQ=255) aTTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTg > 1:6091747/1‑101 (MQ=255) aTTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTACGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTg > 1:9062159/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt > 1:2656732/1‑101 (MQ=255) tttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGt < 1:10697632/101‑1 (MQ=255) ttGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGtt < 1:6957646/101‑1 (MQ=255) tGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtg > 1:707159/1‑101 (MQ=255) gCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgc > 1:8371268/1‑101 (MQ=255) aTCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctgc > 1:8081805/1‑101 (MQ=255) aTCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTtgctgc < 1:8508462/101‑1 (MQ=255) tCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCa < 1:6323766/101‑1 (MQ=255) tCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCa > 1:6176662/1‑101 (MQ=255) cGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCaa > 1:8248264/1‑101 (MQ=255) gTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAc < 1:8197576/101‑1 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc < 1:14589450/101‑1 (MQ=255) ttGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAAcc > 1:2560978/1‑101 (MQ=255) tGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCg < 1:10191383/101‑1 (MQ=255) tGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCg < 1:7149111/101‑1 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc > 1:2722770/1‑101 (MQ=255) tACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTAc > 1:11979092/1‑101 (MQ=255) ccAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGt < 1:211207/101‑1 (MQ=255) cAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTg > 1:19219/1‑101 (MQ=255) aaCTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGa > 1:11385028/1‑101 (MQ=255) aaCTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGa < 1:10067314/101‑1 (MQ=255) aCTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGaa < 1:14025485/101‑1 (MQ=255) ctGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGc > 1:4898903/1‑101 (MQ=255) tGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGcc > 1:12216065/1‑101 (MQ=255) tGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGcc > 1:12301252/1‑101 (MQ=255) tCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGtt > 1:10853225/1‑101 (MQ=255) ccGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTtc > 1:10039024/1‑101 (MQ=255) cGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTtct < 1:7986520/101‑1 (MQ=255) ggACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTtctc > 1:7526852/1‑101 (MQ=255) aCGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAg < 1:9433667/101‑1 (MQ=255) ggTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGa > 1:9561973/1‑101 (MQ=255) gtgtTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGAt < 1:12384767/101‑1 (MQ=255) tgtTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATc > 1:1068658/1‑101 (MQ=255) tGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTgg < 1:9756231/101‑1 (MQ=255) gACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGc < 1:7827573/101‑1 (MQ=255) aCTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGCt < 1:1405274/101‑1 (MQ=255) aCTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGCt < 1:9515293/101‑1 (MQ=255) cTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGCtt < 1:14632468/101‑1 (MQ=255) | CGATGCTGACCACGAACACATTGCTATCAAAGAAGCAAACAACCTGGGTATTCCGGTATTTGCTATCGTTGATACCAACTCTGATCCGGACGGTGTTGACTTCGTTATCCCGGGTAACGACGACGCAATCCGTGCTGTGACCCTGTACCTGGGCGCTGTTGCTGCAACCGTACGTGAAGGCCGTTCTCAGGATCTGGCTT > NC_007779/190365‑190564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |