| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,884,461 | G→C | 7.3% | A186A (GCG→GCC) | aldB → | aldehyde dehydrogenase B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,884,461 | 0 | G→C | 7.3% | 43.5 ‑0.8 ‑0.1 | 232 | A186A (GCG→GCC) | aldB | aldehyde dehydrogenase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (11/6): ref base (116/99): total (127/105) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.55e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.58e-01 | ||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTG > NC_007779/3884361‑3884560 | tGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTggcg > 1:13498798/1‑101 (MQ=255) ggCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTggcgg < 1:4657051/101‑1 (MQ=255) gCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTggcggc > 1:1021205/1‑101 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg > 1:4311849/1‑101 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg < 1:14289123/101‑1 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg > 1:9811192/1‑101 (MQ=255) ccTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGgcggcg > 1:11353546/1‑101 (MQ=255) cTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGcggcgg < 1:10066353/101‑1 (MQ=255) aTCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGc > 1:9395571/1‑101 (MQ=255) aTCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGc < 1:3935804/101‑1 (MQ=255) aTTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAAc > 1:7726022/1‑101 (MQ=255) aTTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGATGGCGGCGGGCAAc > 1:12390223/1‑101 (MQ=255) tttCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACt > 1:7344990/1‑101 (MQ=255) tCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgt < 1:9587400/101‑1 (MQ=255) tCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgt > 1:8821154/1‑101 (MQ=255) ccATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGGTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtg < 1:14126345/101‑1 (MQ=255) ccATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtg > 1:3908512/1‑101 (MQ=255) ccATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtg > 1:14355686/1‑101 (MQ=255) ccATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtg > 1:6696923/1‑101 (MQ=255) cATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACtgtgt > 1:8311780/1‑101 (MQ=255) tGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtgg < 1:2667354/101‑1 (MQ=255) gAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtggt > 1:7126905/1‑101 (MQ=255) aaCCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTgtggtg < 1:8574192/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt < 1:6575340/101‑1 (MQ=255) ccGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCt < 1:10564491/101‑1 (MQ=255) cGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTg < 1:1764620/101‑1 (MQ=255) ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa > 1:8153971/1‑101 (MQ=255) ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa > 1:11807493/1‑101 (MQ=255) ttAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGaa < 1:13747242/101‑1 (MQ=255) gCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAGAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAAccc < 1:13293473/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCg < 1:11011731/101‑1 (MQ=255) gtggtgGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGc > 1:14488580/1‑101 (MQ=255) gtcgtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGc < 1:9172243/92‑1 (MQ=255) gtcgtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGc > 1:1893280/10‑101 (MQ=9) tggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCa > 1:4587439/1‑101 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:9845867/101‑1 (MQ=255) ggtggGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCAc < 1:1609179/101‑1 (MQ=255) cgtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCag > 1:5978775/8‑100 (MQ=2) gtcggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCaga < 1:256630/95‑3 (MQ=255) cggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagc > 1:2098756/5‑97 (MQ=9) ggccAGATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagca > 1:4076464/4‑96 (MQ=9) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:2871664/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCtt < 1:1206839/101‑1 (MQ=255) ggCAGATTATCCCGTGCAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACATCtt < 1:12676790/101‑1 (MQ=255) gCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTa > 1:11586590/1‑101 (MQ=255) gCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTa < 1:3386316/101‑1 (MQ=255) aGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcc > 1:5889502/1‑101 (MQ=255) gATCATCCCGTGGAACTTCCCCCTCCTGATGGCCGCGTGGAAAATCGCCCCGGCCCTGGCCGCCGGCAACTGCATCGTACTCAAGCCCGCagagcagaccc < 1:7535973/101‑11 (MQ=2) aTTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAcccc < 1:8689558/101‑1 (MQ=255) ttATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAccccc > 1:5692022/1‑100 (MQ=255) tATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGc < 1:2335482/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc > 1:13259223/1‑101 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc < 1:1371788/101‑1 (MQ=255) ccGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTc > 1:9712280/1‑101 (MQ=255) gTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTg < 1:12757562/101‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTAct < 1:8481443/101‑1 (MQ=255) aaCTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTAACCCGCTTTCTGTAct > 1:4165157/1‑101 (MQ=255) aCTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActg < 1:4511119/101‑1 (MQ=255) ttCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgct > 1:11222587/1‑101 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:5552035/101‑1 (MQ=255) tCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTActgctg < 1:11929255/101‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGATGGGGGGGTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTCCTGAAACCCGCCCGGCTTACCCCGCTTTCTGTACTgctgct < 1:15027491/101‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTgctgct > 1:3505149/1‑101 (MQ=255) gctgctGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTaa > 1:13647201/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt > 1:6845770/1‑101 (MQ=255) ctgctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAAt < 1:9090877/101‑1 (MQ=255) tgctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:7866557/1‑101 (MQ=255) tgctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg > 1:10395892/1‑101 (MQ=255) tgctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATg < 1:4485687/101‑1 (MQ=255) gctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATgg > 1:307652/1‑101 (MQ=255) gctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATgg < 1:6950246/101‑1 (MQ=255) gctgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATgg > 1:7972643/1‑101 (MQ=255) tgATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaa > 1:7526011/1‑101 (MQ=255) gATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGaaa < 1:13005131/101‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:12500804/101‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCATACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTg < 1:10940354/101‑1 (MQ=255) gCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGt < 1:526962/101‑1 (MQ=255) cGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTc < 1:5030358/101‑1 (MQ=255) gAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg > 1:5403963/1‑101 (MQ=255) gAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg < 1:14779601/101‑1 (MQ=255) gAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCg < 1:14203924/101‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTg < 1:6661234/101‑1 (MQ=255) tGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGa > 1:13329446/1‑101 (MQ=255) ggAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGCGAt > 1:479393/1‑101 (MQ=255) aaaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGAttt < 1:3272994/101‑1 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa > 1:6272574/1‑101 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:2437855/101‑1 (MQ=255) aaaTGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTa < 1:5085640/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg < 1:13170664/101‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg > 1:12882726/1‑101 (MQ=255) tGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTg < 1:9463357/101‑1 (MQ=255) ggCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgc < 1:15159597/101‑1 (MQ=255) ggCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgc < 1:3635840/101‑1 (MQ=255) gCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTgcc > 1:11879293/1‑101 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg > 1:5180734/1‑101 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCggg > 1:12596659/1‑101 (MQ=255) gcTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCg > 1:11487300/1‑101 (MQ=255) tGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtg > 1:5638311/1‑101 (MQ=255) ggcggcGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtgg > 1:14567277/1‑101 (MQ=255) cggcggGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCgtggtg < 1:4057382/101‑1 (MQ=255) | TGGCCTATCATTTCCATGAACCGTTAGGCGTGGTGGGGCAGATTATCCCGTGGAACTTCCCGCTGCTGATGGCGAGCTGGAAAATGGCTCCCGCGCTGGCGGCGGGCAACTGTGTGGTGCTGAAACCCGCACGTCTTACCCCGCTTTCTGTACTGCTGCTAATGGAAATTGTCGGTGATTTACTGCCGCCGGGCGTGGTG > NC_007779/3884361‑3884560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |