| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,684 | G→C | 20.2% | V150V (GTG→GTC) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,684 | 0 | G→C | 20.2% | 145.6 ‑0.7 ‑0.1 | 233 | V150V (GTG→GTC) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (26/21): ref base (91/95): total (117/116) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.14e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.15e-01 | ||||||||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
AAGCGGCGCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCC > NC_007779/4051584‑4051784 | aagCGGCGCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGGCGCGCGATtgtg > 1:2379863/1‑101 (MQ=255)aagCGGCGCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATtgtg > 1:3174695/1‑101 (MQ=255) gcggcgCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTgcg < 1:50175/101‑1 (MQ=255) gcggcgCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTgcg < 1:5824687/101‑1 (MQ=255) gcggcgCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCATGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTgcg > 1:6205671/1‑101 (MQ=255) gcgcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATc > 1:15071802/1‑101 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg < 1:2564167/101‑1 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg > 1:3315260/1‑101 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg < 1:13390697/101‑1 (MQ=255) cATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcgg < 1:14840207/101‑1 (MQ=255) cATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcgg > 1:7626514/1‑101 (MQ=255) aTTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggc < 1:9482736/101‑1 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg > 1:11109421/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCACGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg > 1:2170824/1‑101 (MQ=255) cTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGTGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcggg > 1:9410486/1‑100 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGgtgt > 1:1010403/1‑101 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGgtgt > 1:9250311/1‑101 (MQ=255) aGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTc < 1:6801175/101‑1 (MQ=255) cTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCt < 1:3659348/101‑1 (MQ=255) ggACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGt > 1:4212664/1‑101 (MQ=255) aCGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGttt < 1:13113941/101‑1 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat < 1:14357937/101‑1 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat < 1:4251790/101‑1 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg < 1:6037238/101‑1 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg > 1:8968046/1‑101 (MQ=255) gcAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGTCGGTCGGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCg < 1:3809550/100‑1 (MQ=255) cgaccgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGc > 1:6710955/10‑101 (MQ=2) cAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGc > 1:6503830/1‑101 (MQ=255) aaCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctc > 1:4686526/1‑101 (MQ=255) cgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctc < 1:12591079/96‑1 (MQ=2) aCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctct < 1:8614321/101‑1 (MQ=255) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:14942794/1‑101 (MQ=255) caagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctcaa < 1:10222619/98‑3 (MQ=2) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa < 1:9602739/101‑1 (MQ=255) gCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAc > 1:8115445/1‑101 (MQ=255) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGCCGAGCCGCTCTCAAAcc > 1:2917967/1‑101 (MQ=2) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt < 1:12177932/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt < 1:4502188/101‑1 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:6914433/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:12420305/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGGGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:4949059/101‑1 (MQ=255) cgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATg > 1:6988907/1‑101 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc < 1:14308970/101‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc > 1:1290886/1‑101 (MQ=255) tctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCa < 1:14486580/91‑1 (MQ=2) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:11757762/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:8890679/101‑1 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg < 1:10322370/101‑1 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg < 1:7352355/101‑1 (MQ=255) ttgccGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg > 1:10751791/4‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:9594150/1‑101 (MQ=255) ggggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc < 1:1095226/96‑2 (MQ=9) ccGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTg > 1:11545424/1‑101 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:178670/101‑1 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:2287044/101‑1 (MQ=255) ggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccg > 1:12085727/4‑101 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:755689/1‑101 (MQ=255) gcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcgc < 1:13953316/101‑1 (MQ=255) tggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCcgcg < 1:10691614/100‑1 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:1969612/1‑101 (MQ=255) gTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtc < 1:3479218/101‑2 (MQ=255) gTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTg < 1:5075530/101‑1 (MQ=255) tcggcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCAGGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtcc < 1:5914873/98‑3 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc > 1:15105836/1‑101 (MQ=255) cAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCa > 1:5564002/1‑101 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa > 1:5777050/1‑101 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:644726/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:7325953/101‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGa < 1:14636746/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGACGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:4758875/1‑101 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:14985178/3‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:8392520/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg > 1:9693593/1‑101 (MQ=255) tcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCGAAGCTCCGCGTCCAGATGc < 1:4832667/100‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGACCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:14861495/101‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg > 1:13630019/1‑101 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:6356695/1‑100 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:4174594/101‑2 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:7434345/101‑2 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt < 1:6427282/101‑1 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt < 1:10485700/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTGGa < 1:8084136/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGA‑CCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:11661203/1‑95 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:13771859/1‑95 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:11004995/1‑95 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:4393785/1‑101 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt < 1:12339582/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:14744732/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:10829239/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:6668291/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:10053469/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:13256503/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:287033/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:13192432/101‑1 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc > 1:12976602/1‑101 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc > 1:2963865/1‑101 (MQ=255) tgtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTc < 1:12783837/101‑1 (MQ=255) gtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:8940486/101‑1 (MQ=255) tgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGc > 1:818267/1‑101 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:11189807/101‑1 (MQ=255) | AAGCGGCGCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCC > NC_007779/4051584‑4051784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |