| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,689 | A→G | 18.5% | D152G (GAT→GGT) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,689 | 0 | A→G | 18.5% | 111.0 ‑0.3 ‑0.0 | 252 | D152G (GAT→GGT) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (24/23): ref base (97/108): total (121/131) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.46e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.98e-01 | ||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAA > NC_007779/4051591‑4051789 | gcgcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATc < 1:4856783/101‑1 (MQ=255) cgcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATcc > 1:2288143/1‑101 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg > 1:3315260/1‑101 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg < 1:2564167/101‑1 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg < 1:13390697/101‑1 (MQ=255) gcATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcg < 1:1287726/101‑1 (MQ=255) cATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcgg < 1:14840207/101‑1 (MQ=255) aTTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggc < 1:9482736/101‑1 (MQ=255) aTTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggc > 1:4183474/1‑101 (MQ=255) aTTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggc > 1:14875780/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg > 1:11109421/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCACGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg > 1:2170824/1‑101 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGgtgt > 1:9250311/1‑101 (MQ=255) cTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCt < 1:3659348/101‑1 (MQ=255) ggACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGt > 1:4212664/1‑101 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat < 1:14357937/101‑1 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat > 1:8071026/1‑101 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg < 1:8134052/101‑1 (MQ=255) cTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatga > 1:1608288/1‑101 (MQ=255) cTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatga > 1:8523190/1‑101 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc < 1:2012783/101‑1 (MQ=255) cgaccgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGc > 1:6710955/10‑101 (MQ=2) accgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCACCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctc < 1:6555183/94‑1 (MQ=2) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGGGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCAGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:13692668/1‑101 (MQ=255) tcccgggggcgAGCTTCCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa < 1:8035839/93‑1 (MQ=255) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa < 1:2462733/101‑1 (MQ=255) tCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTa < 1:9602739/101‑1 (MQ=255) gCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGCCGAGCCGCTCTCAAAcc > 1:2917967/1‑101 (MQ=2) cccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAcc < 1:6873552/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt < 1:12339251/101‑1 (MQ=255) cgcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTc > 1:10397282/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt > 1:12411323/1‑101 (MQ=255) gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGGGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:4949059/101‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc < 1:14308970/101‑1 (MQ=255) tctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCa < 1:14486580/91‑1 (MQ=2) gtttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:10774831/100‑1 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:10613616/101‑1 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:6436385/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:11757762/1‑101 (MQ=255) tcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCt < 1:14957040/95‑1 (MQ=9) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:9594150/1‑101 (MQ=255) ggggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc < 1:1095226/96‑2 (MQ=9) ccGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTg > 1:11545424/1‑101 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc > 1:7589520/1‑101 (MQ=255) ggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccg > 1:12085727/4‑101 (MQ=255) ggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccg < 1:5028478/98‑1 (MQ=9) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:15073676/1‑101 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc < 1:14596349/99‑1 (MQ=255) gcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcgc < 1:13953316/101‑1 (MQ=255) cggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGcgcg > 1:7349705/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:6743610/101‑1 (MQ=255) gTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtc < 1:3479218/101‑2 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc > 1:15166594/1‑101 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc < 1:13097039/101‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc < 1:12723541/101‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCa > 1:5564002/1‑101 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:644726/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGACGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:4758875/1‑101 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:5832270/3‑101 (MQ=255) gtcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATg > 1:14985178/3‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg > 1:9693593/1‑101 (MQ=255) tcAGCGGGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGc < 1:7394181/100‑1 (MQ=255) cAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCg > 1:13630019/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:4715165/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:8915565/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:2871114/1‑100 (MQ=255) cgcggggCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcac < 1:6343193/96‑4 (MQ=255) cGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCt < 1:8090031/101‑1 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:876794/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGa < 1:5814085/101‑1 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGA‑CCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:11661203/1‑95 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:5985111/1‑95 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:11004995/1‑95 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:4393785/1‑101 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt > 1:10251739/1‑101 (MQ=255) aTGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCa < 1:4289924/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:12576987/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:14744732/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa > 1:10704862/1‑101 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa > 1:4577671/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:10157406/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGt < 1:9062703/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:10053469/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:13256503/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:6928801/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:7135958/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:13192432/101‑1 (MQ=255) gcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCa > 1:8286946/1‑101 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc > 1:12976602/1‑101 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc < 1:7548454/101‑1 (MQ=255) gATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:8942196/1‑101 (MQ=255) gATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:5270338/1‑101 (MQ=255) ttGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGt > 1:9414572/1‑101 (MQ=255) ttGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGt > 1:6406211/1‑101 (MQ=255) gtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:12169920/101‑1 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:11189807/101‑1 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:3051603/101‑1 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa > 1:10834435/1‑101 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa < 1:3891097/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:3804343/1‑101 (MQ=255) | GCGCATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAA > NC_007779/4051591‑4051789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |