| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,694 | G→A | 20.9% | A154T (GCG→ACG) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,694 | 0 | G→A | 20.9% | 138.1 ‑0.4 ‑0.0 | 244 | A154T (GCG→ACG) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (26/25): ref base (91/102): total (117/127) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.40e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.98e-01 | ||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAC > NC_007779/4051594‑4051794 | cATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcgg > 1:7626514/1‑101 (MQ=255)cATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcgg > 1:11755874/1‑101 (MQ=255) ttCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcg > 1:10777238/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg > 1:11109421/1‑101 (MQ=255) tCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGACCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCcggcgg < 1:10438077/101‑1 (MQ=255) ggAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGgtgt > 1:9250311/1‑101 (MQ=255) cTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCt < 1:3430044/101‑1 (MQ=255) gACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGtt < 1:4894089/101‑1 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat > 1:8071026/1‑101 (MQ=255) gTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgat < 1:4251790/101‑1 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg > 1:8968046/1‑101 (MQ=255) tCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTtgatg < 1:14438844/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGc < 1:2012783/101‑1 (MQ=255) gcAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGTCGGTCGGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCg < 1:3809550/100‑1 (MQ=255) cgaccgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGc > 1:6710955/10‑101 (MQ=2) cAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGc > 1:9551337/1‑101 (MQ=255) cgcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctc < 1:12591079/96‑1 (MQ=2) aCGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctct < 1:8614321/101‑1 (MQ=255) gcaagCCCGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGctctca < 1:2531305/97‑2 (MQ=2) gTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGctctct > 1:14942794/1‑101 (MQ=255) cccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAcc < 1:13910294/101‑1 (MQ=255) cccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAAcc < 1:6873552/101‑1 (MQ=255) cccGCGC‑ATCTCTCGGGTGGTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCt < 1:14326549/101‑1 (MQ=2) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt < 1:12339251/101‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCt < 1:4502188/101‑1 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg < 1:14966841/101‑1 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:12420305/1‑101 (MQ=255) gcgcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGGGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCg > 1:568597/1‑101 (MQ=255) gAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGc > 1:3540179/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:8890679/101‑1 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:10613616/101‑1 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:6436385/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:9594150/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt < 1:14755414/101‑1 (MQ=255) ggggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtc < 1:1095226/96‑2 (MQ=9) gggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtcc > 1:13640568/5‑99 (MQ=255) cggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgc < 1:178670/101‑1 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:15073676/1‑101 (MQ=255) ggcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcg > 1:11787921/1‑101 (MQ=255) gtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccgc > 1:8940197/3‑101 (MQ=255) gcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcgc < 1:4968286/101‑1 (MQ=255) cggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGcgcg > 1:7349705/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:6501703/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGt < 1:6743610/101‑1 (MQ=255) gTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtc < 1:8101268/101‑2 (MQ=255) gTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTg > 1:14511050/1‑101 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc > 1:15166594/1‑101 (MQ=255) gcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGa > 1:14044592/1‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg > 1:9693593/1‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:2225303/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:8392520/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:13155681/101‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGACCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:14861495/101‑1 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg > 1:12266066/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:4715165/101‑1 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:2871114/1‑100 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:7434345/101‑2 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:4174594/101‑2 (MQ=255) gCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgca > 1:13621510/1‑99 (MQ=255) cgcggggCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcac < 1:6343193/96‑4 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg > 1:14643610/1‑101 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:11616715/101‑1 (MQ=255) cgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGA‑CCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccg > 1:13085422/2‑96 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:11004995/1‑95 (MQ=255) gtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccga > 1:5985111/1‑95 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc < 1:4772120/101‑1 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:9141106/1‑101 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:4393785/1‑101 (MQ=255) gCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACt > 1:10251739/1‑101 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa > 1:10704862/1‑101 (MQ=255) gggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAAc < 1:4189665/101‑1 (MQ=255) gggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAAc < 1:5881870/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:5823630/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:6668291/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:10157406/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:7135958/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:6928801/1‑101 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:10053469/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt < 1:13256503/101‑1 (MQ=255) gcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTg > 1:464685/1‑101 (MQ=255) cgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGc < 1:13192432/101‑1 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc < 1:7548454/101‑1 (MQ=255) ttGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGt > 1:9414572/1‑101 (MQ=255) tgtgCG‑TGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTc < 1:2929269/101‑1 (MQ=255) tgtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTc < 1:12783837/101‑1 (MQ=255) tgtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTc < 1:6408166/101‑1 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:3051603/101‑1 (MQ=255) gcg‑cGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGcc < 1:11189807/101‑1 (MQ=255) cg‑cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCt < 1:2370010/101‑1 (MQ=255) cg‑cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCt < 1:5235652/101‑1 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa > 1:10834435/1‑101 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa < 1:8051165/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:12139214/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:3670646/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa < 1:12912436/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaaa > 1:9614309/1‑101 (MQ=255) cggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACg < 1:825935/101‑1 (MQ=255) cggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACg > 1:3870031/1‑101 (MQ=255) cggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACg > 1:543732/1‑101 (MQ=255) ggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGa > 1:8138613/1‑101 (MQ=255) | CATTCTGGAGCTGGACGGTCTGCTCAAACGTCGCCCGCGCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGAC > NC_007779/4051594‑4051794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |