| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,051,732 | T→C | 16.1% | D166D (GAT→GAC) | ugpC → | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,051,732 | 0 | T→C | 16.1% | 127.4 ‑0.3 ‑0.2 | 279 | D166D (GAT→GAC) | ugpC | glycerol‑3‑phosphate transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (24/21): ref base (118/116): total (142/137) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.47e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.78e-01 | ||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGATGA > NC_007779/4051632‑4051832 | gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGAt < 1:3513031/101‑1 (MQ=255)gcgAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCCCTCTAACCTCGAt > 1:10949466/1‑101 (MQ=255) gAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGc < 1:11043899/101‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc < 1:14308970/101‑1 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc > 1:1290886/1‑101 (MQ=255) aGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGcc > 1:6716741/1‑101 (MQ=255) tctctcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCa > 1:12515337/11‑101 (MQ=9) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:3861341/101‑1 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa > 1:5553169/1‑101 (MQ=255) cTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCaa < 1:10613616/101‑1 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg < 1:10322370/101‑1 (MQ=255) tttCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAg < 1:13620991/101‑1 (MQ=255) tcgggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGACGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCt > 1:9453671/7‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt > 1:9594150/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCt < 1:14755414/101‑1 (MQ=255) gggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCtcc > 1:13640568/5‑99 (MQ=255) ggtggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTccg > 1:12085727/4‑101 (MQ=255) gcggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTgcgc < 1:4968286/101‑1 (MQ=255) cggTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGcgcg > 1:7349705/1‑101 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGt > 1:1969612/1‑101 (MQ=255) gTCAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGtc < 1:8101268/101‑2 (MQ=255) gTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTg < 1:5075530/101‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc > 1:15166594/1‑101 (MQ=255) tCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGc < 1:12723541/101‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCa < 1:11737638/101‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCa < 1:926643/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:7325953/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCa < 1:703804/101‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAg > 1:11798520/1‑101 (MQ=255) gcgtCAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGa > 1:14044592/1‑101 (MQ=255) gcgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGa < 1:14636746/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGACGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGAt > 1:4758875/1‑101 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:2225303/101‑1 (MQ=255) gcCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATg < 1:8392520/101‑1 (MQ=255) tcAGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCGAAGCTCCGCGTCCAGATGc < 1:4832667/100‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTGGCGATGGACCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGc < 1:14861495/101‑1 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg > 1:12266066/1‑101 (MQ=255) cAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCg > 1:9644501/1‑101 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:4715165/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt < 1:8915565/101‑1 (MQ=255) aGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGt > 1:3666625/1‑101 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc > 1:6356695/1‑100 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:4174594/101‑2 (MQ=255) aGCGCGTGGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCG‑CCGACCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgc < 1:7434345/101‑2 (MQ=255) gtgtGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCtt < 1:10485700/101‑1 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:6442892/101‑1 (MQ=255) tgtgGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTg < 1:876794/101‑1 (MQ=255) cgtgGCGATGGGCCGCGCCATCGTCCGCCGA‑CCGAAGGTCTTCCTCATGGACGAGCCGCTCTCAAACCTGGACGCCAAGCTCCGCGTCCAGATGCgcaccg > 1:13085422/2‑96 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:4393785/1‑101 (MQ=255) ggCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAAc > 1:11126823/1‑101 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:10829239/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa > 1:10704862/1‑101 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa < 1:12576987/101‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCaa > 1:4577671/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:5823630/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:10157406/101‑1 (MQ=255) ggCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACa < 1:6668291/101‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGtt > 1:287033/1‑101 (MQ=255) gcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTg > 1:6204406/1‑101 (MQ=255) gcgcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTg > 1:464685/1‑101 (MQ=255) gcgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCa > 1:15094984/1‑101 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc < 1:7548454/101‑1 (MQ=255) cgATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAc > 1:2963865/1‑101 (MQ=255) gATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCAcc > 1:8942196/1‑101 (MQ=255) tgtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTc < 1:6408166/101‑1 (MQ=255) gtgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCg < 1:13196549/101‑1 (MQ=255) tgCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGc > 1:818267/1‑101 (MQ=255) cg‑cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCt > 1:776343/1‑101 (MQ=255) cg‑cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCt < 1:2370010/101‑1 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa > 1:8070261/1‑101 (MQ=255) cgATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGa < 1:153638/101‑1 (MQ=255) gATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaa < 1:3891097/101‑1 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:3804343/1‑101 (MQ=255) aTCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGaaa > 1:9135578/1‑101 (MQ=255) cggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACg < 1:825935/101‑1 (MQ=255) cggcggTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACg < 1:13191437/101‑1 (MQ=255) 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tGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTAc > 1:12202739/1‑101 (MQ=255) tttGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGt < 1:11191410/101‑1 (MQ=255) tttGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGt > 1:14160799/1‑101 (MQ=255) tgatgaGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTa > 1:12350630/1‑101 (MQ=255) aGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCAc < 1:4204030/101‑1 (MQ=255) ccGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGa > 1:2537694/1‑101 (MQ=255) ccGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGa < 1:1500765/101‑1 (MQ=255) cGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGAt > 1:13313215/1‑101 (MQ=255) cGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGAt > 1:11607477/1‑101 (MQ=255) ctctAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAgg < 1:858798/101‑1 (MQ=255) tctAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGt < 1:3407871/101‑1 (MQ=255) tctAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGt > 1:5681504/1‑101 (MQ=255) aCCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGaa > 1:3087960/1‑101 (MQ=255) ccTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAg < 1:5428830/101‑1 (MQ=255) cGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGa < 1:14497297/101‑1 (MQ=255) gATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATAAGGTTGAAGCGAt > 1:6766506/1‑101 (MQ=255) aTGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGATg > 1:10229649/1‑101 (MQ=255) | GCGAGCTTTCCGGCGGTCAGCGCCAGCGTGTGGCGATGGGCCGCGCGATTGTGCG‑CGATCCGGCGGTGTTCCTGTTTGATGAGCCGCTCTCTAACCTCGATGCCAAGCTGCGCGTGCAGATGCGTCTTGAACTGCAACAGTTGCACCGTCGCCTGAAAACGACTTCACTCTACGTTACTCACGATCAGGTTGAAGCGATGA > NC_007779/4051632‑4051832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |