| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,166,187 | A→G | 1.4% | K108K (AAA→AAG) | rpsL → | 30S ribosomal protein S12 |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,166,187 | 0 | A→G | 1.4% | 2.6 0.0 ‑0.6 | 281 | K108K (AAA→AAG) | rpsL | 30S ribosomal protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (115/162): total (117/164) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.79e-01 | ||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
AGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCAAACTA > NC_007779/4166087‑4166287 | aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa < 1:6020579/101‑1 (MQ=255)aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa < 1:1280158/101‑1 (MQ=255)aGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTaaa > 1:10373226/1‑101 (MQ=255) ggAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAg > 1:5460037/1‑101 (MQ=255) gCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGAcc < 1:12727055/101‑1 (MQ=255) gCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGAcc < 1:10924464/101‑1 (MQ=255) aCTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGt < 1:8468122/101‑1 (MQ=255) cTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTa > 1:8044861/1‑101 (MQ=255) ccGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAg > 1:10005366/1‑101 (MQ=255) ccGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAg > 1:4796819/1‑101 (MQ=255) cGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGc < 1:166423/101‑1 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa < 1:60600/101‑1 (MQ=255) gTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCa < 1:5489585/101‑1 (MQ=255) tgatcctgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAg < 1:7957667/101‑1 (MQ=255) cctgatccGTGGCGGTCGCGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTc < 1:3177347/101‑1 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt < 1:8561970/101‑1 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt > 1:8838159/1‑101 (MQ=255) tgatccGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGt > 1:9070914/1‑101 (MQ=255) cgcggtggTCGTGTTAAGGACCTCCCGGGTGTCCGCTACAAGATCGTCCGTGGTTCCCTCGACACCCAGGGTGTCAAGGACCGCAAGCAGGCTCGTTcccg > 1:7558820/7‑99 (MQ=255) gTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAg < 1:5407403/101‑1 (MQ=255) tGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGt < 1:5028303/101‑1 (MQ=255) gCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTAt > 1:6351926/1‑101 (MQ=255) gCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTAt > 1:832184/1‑101 (MQ=255) gCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTAt > 1:12989198/1‑101 (MQ=255) gCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTAt < 1:3487978/101‑1 (MQ=255) ggTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATgg > 1:5334478/1‑101 (MQ=255) gTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGc < 1:11145507/101‑1 (MQ=255) gTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGc > 1:3792557/1‑101 (MQ=255) gtgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTg < 1:13611550/101‑1 (MQ=255) gtgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTg > 1:8201468/1‑101 (MQ=255) gtgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTg > 1:7738650/1‑101 (MQ=255) gtgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTg < 1:7841920/101‑1 (MQ=255) tgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGa > 1:7303026/1‑101 (MQ=255) tgtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGa > 1:5707915/1‑101 (MQ=255) gtTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGaa < 1:587384/101‑1 (MQ=255) ttATAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAg > 1:11520410/1‑101 (MQ=255) ttAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAg < 1:9239612/101‑1 (MQ=255) tAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGc < 1:2520304/101‑1 (MQ=255) ccTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTa < 1:3745068/101‑1 (MQ=255) ccTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTa < 1:4908815/101‑1 (MQ=255) cTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTaa < 1:14453086/101‑1 (MQ=255) ccGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGc > 1:8621778/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTa < 1:2225234/101‑1 (MQ=255) gtgtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTaa < 1:2861509/101‑1 (MQ=255) tgtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAAt > 1:14826210/1‑101 (MQ=255) gtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATg > 1:7765750/1‑101 (MQ=255) gtTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATg > 1:6871080/1‑101 (MQ=255) cGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGtt > 1:11808748/1‑101 (MQ=255) gTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTtc < 1:1213251/101‑1 (MQ=255) ttACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTtct > 1:2025013/1‑101 (MQ=255) ttACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTtct < 1:10324364/101‑1 (MQ=255) ttACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTtct > 1:3612099/1‑101 (MQ=255) acacCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGtt > 1:9761970/1‑101 (MQ=255) acCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaa < 1:261297/101‑1 (MQ=255) acCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaa < 1:4158076/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag < 1:1344598/101‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaag < 1:6665753/101‑1 (MQ=255) cGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagt > 1:6956982/1‑101 (MQ=255) cGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagt > 1:6188769/1‑101 (MQ=255) gTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagta < 1:1867816/101‑1 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa > 1:7471346/1‑101 (MQ=255) tACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaa < 1:3348282/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag < 1:10104419/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag < 1:9374015/101‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTtaagtaag < 1:2402472/101‑1 (MQ=255) cGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAgg < 1:12633564/101‑1 (MQ=255) gtggtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGc < 1:9883536/101‑1 (MQ=255) ggtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCa > 1:12905091/1‑101 (MQ=255) gtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaa < 1:14232544/101‑1 (MQ=255) gtgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaa < 1:11246709/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:4499177/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:1559845/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:972594/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:3953385/101‑1 (MQ=255) tgCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCaaa < 1:11041874/101‑1 (MQ=255) gcgcTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAAc < 1:13755183/101‑1 (MQ=255) cTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtt < 1:14008953/101‑1 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTTAGGCCAAACGtttt > 1:12382551/1‑101 (MQ=255) tGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGtttt > 1:6689678/1‑101 (MQ=255) aCTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTaa < 1:7639844/101‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACt > 1:433985/1‑101 (MQ=255) gCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACtt < 1:14646129/101‑1 (MQ=255) cTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTa > 1:1144608/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaa > 1:12463789/1‑101 (MQ=255) tCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaa < 1:10497498/101‑1 (MQ=255) tCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaa < 1:9464191/101‑1 (MQ=255) ccGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTaaa < 1:13365561/101‑1 (MQ=255) ggCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATg > 1:10887538/1‑101 (MQ=255) ggCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATg > 1:1977448/1‑101 (MQ=255) gTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGTGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCa < 1:2916882/101‑1 (MQ=255) gTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCa < 1:2268799/101‑1 (MQ=255) gTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCa > 1:9522754/1‑101 (MQ=255) ttAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaa > 1:12212480/1‑101 (MQ=255) ttAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaa > 1:10744026/1‑101 (MQ=255) tAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaa > 1:11684399/1‑101 (MQ=255) aaaGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaac < 1:9642688/101‑1 (MQ=255) aaaGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaac > 1:14679285/1‑101 (MQ=255) aaaGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaac < 1:15033299/101‑1 (MQ=255) aGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaacta < 1:11982475/101‑1 (MQ=255) aGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCaaacta < 1:13875682/101‑1 (MQ=255) | AGGAGCACTCCGTGATCCTGATCCGTGGCGGTCGTGTTAAAGACCTCCCGGGTGTTCGTTACCACACCGTACGTGGTGCGCTTGACTGCTCCGGCGTTAAAGACCGTAAGCAGGCTCGTTCCAAGTATGGCGTGAAGCGTCCTAAGGCTTAATGGTTCTCCGTTAAGTAAGGCCAAACGTTTTAACTTAAATGTCAAACTA > NC_007779/4166087‑4166287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |