| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,168,374 | T→C | 14.1% | R491R (CGT→CGC) | fusA → | protein chain elongation factor EF‑G |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,168,374 | 0 | T→C | 14.1% | 112.9 ‑0.9 ‑0.0 | 290 | R491R (CGT→CGC) | fusA | protein chain elongation factor EF‑G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (17/24): ref base (122/127): total (139/151) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.03e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.12e-01 | ||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CGCGGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGC > NC_007779/4168275‑4168474 | cgcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTg < 1:2596462/101‑1 (MQ=255)cgcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTg < 1:2231842/101‑1 (MQ=255) gcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGa < 1:7447473/101‑1 (MQ=255) gcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGa > 1:13713768/1‑101 (MQ=255) gcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGa < 1:8601321/101‑1 (MQ=255) gcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGa > 1:1798579/1‑101 (MQ=255) gcgGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGa > 1:11664841/1‑101 (MQ=255) gcggTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGag < 1:6084079/99‑2 (MQ=255) gcggTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGag > 1:8827435/3‑100 (MQ=255) cggTATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGaga < 1:11047092/100‑3 (MQ=255) ggTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAAc < 1:7856440/101‑1 (MQ=255) ggTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAAc < 1:11923648/101‑1 (MQ=255) tATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGAcca < 1:5942333/101‑3 (MQ=255) tATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGAcca < 1:2102584/101‑3 (MQ=255) tATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGAcca > 1:4203043/1‑99 (MQ=255) tATGGGCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGAcca > 1:4034227/1‑99 (MQ=255) tATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTa > 1:4875394/1‑101 (MQ=255) tATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTa > 1:14111040/1‑101 (MQ=255) gggCGAGCTCTACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATcc < 1:2744437/101‑1 (MQ=255) gggCGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATcc < 1:8985259/101‑1 (MQ=255) gggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATcc > 1:3671038/1‑101 (MQ=255) gggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATcc < 1:6952597/101‑1 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCg < 1:1121714/101‑1 (MQ=255) cGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATCCGca > 1:5301809/1‑100 (MQ=255) cGAGCTCCACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATCCGca < 1:9647650/101‑2 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGcc < 1:1109025/101‑1 (MQ=255) cGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGcc < 1:14473025/101‑1 (MQ=255) aaCTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAg < 1:6245439/101‑1 (MQ=255) aaCTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAg < 1:8051858/101‑1 (MQ=255) aCTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGa > 1:1606561/1‑101 (MQ=255) aCTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGa > 1:6563107/1‑101 (MQ=255) ctccACCTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATCCGCAAgcc < 1:9919366/98‑3 (MQ=255) tGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGaaa < 1:3176158/101‑1 (MQ=255) cTCGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATCCGCAAgccggtcga > 1:8224732/1‑93 (MQ=255) cTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAc < 1:8520457/101‑1 (MQ=255) tCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAcc < 1:13290600/101‑1 (MQ=255) tCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTAcc > 1:26447/1‑101 (MQ=255) cGACGTCCTGGTTGACCGCATGAAGCGTGAGTTCAAGGTCGAAGCAAACATCGGTAACCCGCAGGTTGCTTACCGCGAGACCATCCGCAAgccggtcgaga > 1:3088218/1‑91 (MQ=255) cGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCg > 1:12897123/1‑101 (MQ=255) gACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGa > 1:11409928/1‑101 (MQ=255) gACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGa > 1:1195885/1‑101 (MQ=255) gACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGa < 1:7588506/101‑1 (MQ=255) tcatcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGtt > 1:2027688/1‑101 (MQ=255) atcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGa < 1:4415504/101‑1 (MQ=255) tcGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGaa > 1:4526137/1‑101 (MQ=255) cGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAg < 1:8304561/101‑1 (MQ=255) gTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAgg < 1:13501220/101‑1 (MQ=255) ttGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGt < 1:9117370/101‑1 (MQ=255) gACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaa < 1:3252104/101‑1 (MQ=255) gACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaa < 1:10556260/101‑1 (MQ=255) aCCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTaaa > 1:563368/1‑101 (MQ=255) gTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAacac > 1:2548828/1‑101 (MQ=255) tATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcg > 1:6336719/1‑101 (MQ=255) tATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcg < 1:2502291/101‑1 (MQ=255) tATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcg > 1:2906665/1‑101 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc < 1:3786900/101‑1 (MQ=255) aTGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgc < 1:2863686/101‑1 (MQ=255) tGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACAcgcg < 1:6443292/101‑1 (MQ=255) aaGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGaa > 1:169908/1‑101 (MQ=255) aaGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGaa < 1:7700106/101‑1 (MQ=255) aGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGaaa > 1:10974842/1‑101 (MQ=255) cGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACa > 1:15048013/1‑101 (MQ=255) cGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACa < 1:18841/101‑1 (MQ=255) tGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGt > 1:4956139/1‑101 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTc > 1:5033672/1‑101 (MQ=255) gAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTc > 1:735188/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtg > 1:7253430/1‑101 (MQ=255) ttCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtgg < 1:8892297/101‑1 (MQ=255) cAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtg > 1:3349646/1‑101 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg > 1:7655702/1‑101 (MQ=255) aaCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCtggtgg < 1:13937890/101‑1 (MQ=255) aCGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTggtggt > 1:5401184/1‑101 (MQ=255) cGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtc > 1:13347031/1‑101 (MQ=255) cGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtc < 1:6667380/101‑1 (MQ=255) gTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcg > 1:10814436/1‑101 (MQ=255) ttGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAACCTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgt < 1:10643907/101‑1 (MQ=255) ttGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgt < 1:14402705/101‑1 (MQ=255) gAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtgg > 1:8686229/1‑101 (MQ=255) aGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGgtggtcgtggtc < 1:5745549/101‑1 (MQ=255) gTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATgg > 1:14264525/1‑101 (MQ=255) aGGTAAGCCGCAGGTTGCTTTCCGTGAAACTATCTGCCAGAAGGTTACCGATGTTGAATGTAAACACGGGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTc < 1:1642252/101‑1 (MQ=255) aGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTc > 1:14770295/1‑101 (MQ=255) aGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTc > 1:4386817/1‑101 (MQ=255) tAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCAtg < 1:9434558/101‑1 (MQ=255) cGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATgttgtt > 1:10112567/1‑101 (MQ=255) cGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATgttgtt > 1:9250594/1‑101 (MQ=255) gCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTa < 1:1143872/101‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc < 1:7135325/101‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc < 1:14514/101‑1 (MQ=255) aGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc > 1:5174526/1‑101 (MQ=255) aGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATc > 1:4659547/1‑101 (MQ=255) ggTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCg < 1:12222063/101‑1 (MQ=255) ttGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGAc > 1:7948000/1‑101 (MQ=255) tGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACa > 1:4746346/1‑101 (MQ=255) gCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACAt < 1:10012709/101‑1 (MQ=255) ttACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGt > 1:13879924/1‑101 (MQ=255) tACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTa > 1:3025057/1‑101 (MQ=255) aCCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAc < 1:10424873/101‑1 (MQ=255) aCCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAc < 1:14613756/101‑1 (MQ=255) ccGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTAcc < 1:12799656/101‑1 (MQ=255) | CGCGGGTATGGGCGAACTGCACCTCGACATCATCGTTGACCGTATGAAGCGTGAATTCAACGTTGAAGCGAACGTAGGTAAACCGCAGGTTGCTTACCGTGAAACTATCCGCCAGAAAGTTACCGATGTTGAAGGTAAACACGCGAAACAGTCTGGTGGTCGTGGTCAGTATGGTCATGTTGTTATCGACATGTACCCGC > NC_007779/4168275‑4168474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |