| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 224,779 | T→G | 1.8% | noncoding (1009/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 224,779 | 0 | T→G | 1.8% | 2.9 0.0 ‑0.0 | 227 | noncoding (1009/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (115/108): total (117/110) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.99e-01 | ||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
ACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCG > NC_007779/224679‑224878 | cTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTc > 1:5020047/1‑101 (MQ=37) tCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTcc > 1:11917654/1‑101 (MQ=38) cAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCa > 1:13809458/1‑101 (MQ=39) cAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCa < 1:11969374/101‑1 (MQ=39) cAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCa < 1:9863412/101‑1 (MQ=39) ttGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGa > 1:9579585/1‑101 (MQ=40) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt < 1:444600/101‑1 (MQ=255) tGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAt > 1:6929075/1‑101 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt > 1:1862681/1‑101 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt > 1:9758735/1‑101 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt < 1:5426397/101‑1 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt < 1:9428561/101‑1 (MQ=255) gACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGAtt > 1:11153220/1‑101 (MQ=255) aCGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTg > 1:2312274/1‑101 (MQ=255) aCGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTg < 1:10112620/101‑1 (MQ=255) cGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTgg > 1:283286/1‑101 (MQ=255) ggggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTg < 1:8674587/101‑1 (MQ=255) ggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGcc < 1:7134038/101‑1 (MQ=255) ggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGcc > 1:60101/1‑101 (MQ=255) ggCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGcc > 1:6493436/1‑101 (MQ=255) ccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTc > 1:2898944/1‑101 (MQ=255) ccGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTc < 1:13668609/101‑1 (MQ=255) cGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCg > 1:13981368/1‑101 (MQ=255) gCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCgg < 1:3713549/101‑1 (MQ=255) cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCggg < 1:6597516/101‑1 (MQ=255) cacaAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCggg > 1:15106559/1‑101 (MQ=255) caAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGaa < 1:1087008/101‑1 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt > 1:3563314/1‑101 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt < 1:5900993/101‑1 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt > 1:11239021/1‑101 (MQ=255) aGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACt < 1:13304374/101‑1 (MQ=255) gCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtg < 1:6146807/101‑1 (MQ=255) gCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtg < 1:12181007/101‑1 (MQ=255) ggTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACtgtg < 1:1249710/101‑1 (MQ=255) gTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTga > 1:153908/1‑101 (MQ=255) tGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTgag > 1:5804967/1‑101 (MQ=255) gAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGAc < 1:6213920/101‑1 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:1231117/1‑101 (MQ=255) gCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAg > 1:10049672/1‑101 (MQ=255) aTGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGt < 1:1118266/101‑1 (MQ=255) tgtgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtg > 1:5245634/1‑101 (MQ=255) tgGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgct < 1:7316021/101‑1 (MQ=255) ggTTTGATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:9010650/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:10817158/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:10281396/1‑101 (MQ=255) ggTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctg > 1:12643957/1‑101 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc < 1:2102196/101‑1 (MQ=255) gTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGtgctgc < 1:11019855/101‑1 (MQ=255) tAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATg > 1:7927597/1‑101 (MQ=255) tAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATg < 1:4181130/101‑1 (MQ=255) aaTTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATgg > 1:3401074/1‑101 (MQ=255) ttCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCt > 1:6421125/1‑101 (MQ=255) ttCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCt < 1:14494242/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:5156768/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc < 1:10321864/101‑1 (MQ=255) gATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtc > 1:14564595/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgtc > 1:228468/1‑101 (MQ=255) gCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTgtcgtc < 1:1290077/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCTGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:9462599/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa > 1:6820564/1‑101 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:11647021/101‑1 (MQ=255) cAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCa < 1:8543254/101‑1 (MQ=255) aaCGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAg > 1:6724864/1‑101 (MQ=255) aCGCGAAGAACCTTACCTGGGCTTGACATATACAGGATCGCGCCAGAGATGG‑‑TGTTTCCCTTGTGGCTTGT‑ATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTc > 1:1926368/1‑101 (MQ=2) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc < 1:779706/101‑1 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc < 1:11871414/101‑1 (MQ=255) gcgAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTc > 1:8258489/1‑101 (MQ=255) gaagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCgt < 1:12189793/101‑1 (MQ=255) aagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGGTTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGGCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCgtg > 1:15054926/1‑101 (MQ=255) aCCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGtgttgt > 1:2692377/1‑101 (MQ=255) ccTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTtgtg < 1:10170801/101‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTTAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGa > 1:4122357/1‑101 (MQ=255) ttACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGaa > 1:4668510/1‑101 (MQ=255) aCCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAAt < 1:4980228/101‑1 (MQ=255) cTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGt > 1:4934412/1‑101 (MQ=255) tGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGtt > 1:1338570/1‑101 (MQ=255) 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tGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTa < 1:1885099/101‑1 (MQ=255) tCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTcc > 1:14191444/1‑101 (MQ=255) ccACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTccc > 1:14982485/1‑101 (MQ=255) caca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCg < 1:4850970/101‑1 (MQ=255) caca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCg < 1:4887006/101‑1 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc > 1:7193304/1‑101 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc > 1:3171375/1‑101 (MQ=255) aca‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGc < 1:12794670/101‑1 (MQ=255) a‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCTGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCaa < 1:9064132/101‑1 (MQ=255) gAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAc < 1:15077316/101‑1 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:5788972/1‑101 (MQ=255) aaCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACg > 1:12693919/1‑101 (MQ=255) aCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGa > 1:8947997/1‑101 (MQ=255) aCTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGa < 1:14060748/101‑1 (MQ=255) tttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgc < 1:4309889/101‑1 (MQ=255) ttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcg < 1:6947627/101‑1 (MQ=255) ttCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAgcg < 1:10499007/101‑1 (MQ=255) | ACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACA‑GAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCG > NC_007779/224679‑224878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |