| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,169,338 | G→C | 28.7% | G84G (GGG→GGC) | tufA → | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,169,338 | 0 | G→C | 28.7% | 165.6 ‑0.3 ‑1.4 | 167 | G84G (GGG→GGC) | tufA | protein chain elongation factor EF‑Tu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (20/28): ref base (54/65): total (74/93) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.32e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.37e-02 | ||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTG > NC_007779/4169277‑4169438 | acacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTgctgct < 1:8969986/101‑1 (MQ=11)acacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTgctgct > 1:1183981/1‑101 (MQ=11)acacTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTgctgct < 1:5916857/101‑1 (MQ=11) cgtctcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTc < 1:10044258/94‑1 (MQ=2) acTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCa > 1:210590/1‑101 (MQ=32) acTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCa > 1:10121127/1‑101 (MQ=32) acTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCa > 1:5219838/1‑101 (MQ=32) acTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCa < 1:5905181/101‑1 (MQ=32) tctcgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAg < 1:7199432/96‑1 (MQ=2) ttCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGa < 1:14000799/101‑1 (MQ=32) ttCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGa < 1:11780201/101‑1 (MQ=32) ttCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGa < 1:9747902/101‑1 (MQ=32) tctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGAt < 1:6112270/101‑1 (MQ=32) ctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg < 1:11286160/101‑1 (MQ=32) ctcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg < 1:7090720/101‑1 (MQ=32) cgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg < 1:6368232/99‑1 (MQ=2) cgcACGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATg > 1:9878484/3‑101 (MQ=2) tcACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATgg < 1:4860957/101‑1 (MQ=32) aCGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:6647398/101‑1 (MQ=2) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc > 1:8146370/1‑101 (MQ=32) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc > 1:4011159/1‑101 (MQ=32) aCGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGAc < 1:7557719/101‑1 (MQ=32) cGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg < 1:4351784/101‑1 (MQ=2) cGTTGAGTACCAGACCGAGAAGCGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg < 1:9330761/101‑1 (MQ=2) cGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg > 1:6833539/1‑101 (MQ=32) cGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg < 1:1604695/101‑1 (MQ=32) cGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg < 1:492114/101‑1 (MQ=32) cGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACGGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACg < 1:11979417/101‑1 (MQ=17) ttGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgc < 1:419487/101‑1 (MQ=32) ttGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgc > 1:12726102/1‑101 (MQ=32) ttGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgc < 1:14583839/101‑1 (MQ=32) tGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcg < 1:2354616/101‑1 (MQ=33) tGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcg > 1:5812396/1‑101 (MQ=32) tGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcg > 1:9836238/1‑101 (MQ=32) gAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGgcgc < 1:13698253/101‑1 (MQ=33) aaTACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGcgcg > 1:5617732/1‑101 (MQ=32) tACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGAt < 1:2873872/101‑1 (MQ=33) cGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATcc > 1:9102884/1‑101 (MQ=32) gACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCt < 1:6553429/101‑1 (MQ=33) gACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCt > 1:3948897/1‑101 (MQ=32) acacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTg < 1:3853430/101‑1 (MQ=32) acacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTg > 1:6232983/1‑101 (MQ=32) cacCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTgg > 1:6931216/1‑101 (MQ=32) acCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGt > 1:817576/1‑101 (MQ=32) ccccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTa > 1:9563240/1‑101 (MQ=32) cccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAg < 1:14750726/101‑1 (MQ=33) ccGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGt > 1:86558/1‑101 (MQ=32) cGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGtt < 1:13816608/101‑1 (MQ=33) cGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGtt > 1:14884607/1‑101 (MQ=32) gACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtg < 1:6719997/101‑1 (MQ=32) aagcGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgc > 1:13124605/4‑101 (MQ=2) aCCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgc > 1:7872361/1‑101 (MQ=32) cccGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTtgct > 1:10464696/1‑101 (MQ=32) agcGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgcc < 1:6676893/99‑2 (MQ=2) agcGTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgcc < 1:3864909/99‑2 (MQ=2) cGTCACTACGCTCACGTCGAC‑GCTCCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgccgc > 1:8610903/1‑101 (MQ=2) gTCACTACGCTCACGTCGACGCT‑CCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTcgccgct < 1:4372936/101‑2 (MQ=2) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:2209297/101‑1 (MQ=33) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:523957/101‑1 (MQ=33) cACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGAc < 1:1482704/101‑1 (MQ=33) aCTACGCTCACGTCGAC‑GCTCCGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTAcc > 1:6280574/1‑100 (MQ=2) cTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTg > 1:11808937/1‑101 (MQ=32) aCGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGAc < 1:2796243/101‑1 (MQ=33) gCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACgg > 1:872556/1‑101 (MQ=32) gCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACgg < 1:5306182/101‑1 (MQ=33) cacaCGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGc < 1:14974403/101‑1 (MQ=33) acGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg < 1:10832286/101‑1 (MQ=32) acGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCg < 1:879611/101‑1 (MQ=32) gTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 1:10773161/101‑1 (MQ=32) gTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGAt < 1:13410462/101‑1 (MQ=32) cgtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGa > 1:7103621/11‑101 (MQ=2) gtcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGAt < 1:8431336/92‑1 (MQ=2) tcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATg < 1:11353713/93‑1 (MQ=2) tcgacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATg < 1:12163158/93‑1 (MQ=2) aGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc < 1:6370311/101‑1 (MQ=32) aGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:2391647/1‑101 (MQ=32) aGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGc > 1:14126358/1‑101 (MQ=32) gACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:8007610/101‑1 (MQ=32) gACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGcc < 1:4576142/101‑1 (MQ=32) gacgctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGcc > 1:11302910/7‑101 (MQ=2) cTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGc > 1:4675831/1‑101 (MQ=32) tGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCa < 1:573813/101‑1 (MQ=32) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa < 1:7384246/98‑1 (MQ=2) gctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCa < 1:6620665/98‑1 (MQ=2) gC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAg > 1:7694205/1‑101 (MQ=32) gC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAg > 1:6478025/1‑101 (MQ=32) ctccGGGCCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAg > 1:1814097/3‑101 (MQ=2) c‑ccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGa < 1:11657359/101‑1 (MQ=32) c‑ccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGa > 1:3295817/1‑101 (MQ=32) ccGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGAc > 1:3506145/1‑101 (MQ=32) cGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACt < 1:12523390/101‑1 (MQ=32) ggggCACGCCGACTATTTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:10080753/101‑1 (MQ=17) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc > 1:76001/1‑101 (MQ=33) ggggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTc < 1:10025256/101‑1 (MQ=32) gggcCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGAccc < 1:5103559/101‑3 (MQ=2) gggcCACGCCGACTACATCAAGAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATTCTGGTTGTCGCCGCTACCGACGGTCCGATGCCGCAGAccc > 1:10098299/1‑99 (MQ=2) gggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCg < 1:4691324/101‑1 (MQ=32) gggCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCg > 1:10196757/1‑101 (MQ=33) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGGCTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg < 1:9562760/101‑1 (MQ=17) gCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTg < 1:11733752/101‑1 (MQ=32) | ACACTTCTCACGTTGAATACGACACCCCGACCCGTCACTACGCACACGTAGACTGC‑CCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCTCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTG > NC_007779/4169277‑4169438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |