| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,270,206 | G→T | 3.8% | intergenic (+749/+274) | yhaC → / ← garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,270,206 | 0 | G→T | 3.8% | 12.5 ‑1.2 ‑0.0 | 233 | intergenic (+749/+274) | yhaC/garK | hypothetical protein/glycerate kinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/7): ref base (101/123): total (103/130) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.05e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.91e-01 | ||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGG > NC_007779/3270106‑3270306 | gACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCg < 1:5142611/101‑1 (MQ=255)gACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCg < 1:12593672/101‑1 (MQ=255) aCAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCgg > 1:9375781/1‑101 (MQ=255) aGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGt > 1:4095504/1‑101 (MQ=255) gTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTg < 1:7766324/101‑1 (MQ=255) gTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTg < 1:6232687/101‑1 (MQ=255) tcattcatCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTgg > 1:5084199/1‑101 (MQ=255) tcattcatCTAGGACAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTgg > 1:12024068/1‑101 (MQ=255) cattcatCTAGGCCAGAAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGa > 1:13915985/1‑101 (MQ=255) ttcatCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGt > 1:1752782/1‑101 (MQ=255) catCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTTGAGttt < 1:10794733/101‑1 (MQ=255) atCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGtttt > 1:10271147/1‑100 (MQ=255) cTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTAcc < 1:97584/101‑1 (MQ=255) aGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGt < 1:784890/101‑1 (MQ=255) ggCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTg < 1:4489941/101‑1 (MQ=255) ccAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGcc < 1:7407519/101‑1 (MQ=255) cAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCa < 1:9824764/101‑1 (MQ=255) aGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCAc < 1:7291941/101‑1 (MQ=255) tCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt < 1:820706/101‑1 (MQ=255) tCGCACACTGGGTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACt > 1:14118186/1‑101 (MQ=255) cGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTg < 1:10953503/101‑1 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:4783491/1‑101 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:2471731/1‑101 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:14786265/1‑101 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:1115201/1‑101 (MQ=255) tCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTAAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTa > 1:11944920/1‑101 (MQ=255) cTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCa > 1:4689764/1‑101 (MQ=255) tGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAg < 1:491435/101‑1 (MQ=255) tGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAg < 1:13462445/101‑1 (MQ=255) tGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAg > 1:9215468/1‑101 (MQ=255) tGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAg < 1:8634479/101‑1 (MQ=255) agcagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCcgcgc‑g < 1:1337871/101‑1 (MQ=255) cagcCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGt < 1:4996527/101‑1 (MQ=255) agcCTCCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg < 1:11115761/101‑1 (MQ=255) agcCTACCCGGGGTCAGTACGGGCCGGACCTTATGAACCCCTTTTTGGCCTTGCTCCGGGGGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTg > 1:7352942/1‑101 (MQ=255) ccTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgcg < 1:2256176/101‑1 (MQ=255) cTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTgcgc < 1:7115757/101‑1 (MQ=255) tACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGGGCGct > 1:3098792/1‑101 (MQ=255) tACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTACCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGct < 1:10528032/101‑1 (MQ=255) aCCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGctc < 1:267593/101‑1 (MQ=255) gggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCATGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAc < 1:14400791/101‑1 (MQ=255) ggTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTAcc < 1:1541002/101‑1 (MQ=255) gTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCg < 1:7870927/101‑1 (MQ=255) ttCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGc < 1:4840573/101‑1 (MQ=255) tCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCa > 1:8119733/1‑101 (MQ=255) tCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCa > 1:629152/1‑101 (MQ=255) tACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCt > 1:6392390/1‑101 (MQ=255) aCGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCtt < 1:8427386/101‑1 (MQ=255) aCGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCtt > 1:14213219/1‑101 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt > 1:4349041/1‑101 (MQ=255) cGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCttt < 1:9103060/101‑1 (MQ=255) gTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCt > 1:13801896/1‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa > 1:7054894/1‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa > 1:6347486/1‑101 (MQ=255) aCCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTa < 1:14525405/101‑1 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAc > 1:4881362/1‑101 (MQ=255) ccTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAc < 1:3001343/101‑1 (MQ=255) cTTGTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc > 1:12540328/1‑101 (MQ=255) cTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTAcc < 1:13185487/101‑1 (MQ=255) ttATGAACCCCTATTTGGCCTGGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCt < 1:3250782/101‑1 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGa > 1:6694667/1‑101 (MQ=255) aTGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGa > 1:2372926/1‑101 (MQ=255) tGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGAt > 1:5775679/1‑101 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:896456/101‑1 (MQ=255) gAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATc < 1:13002592/101‑1 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc > 1:10417182/1‑101 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc < 1:542778/101‑1 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc < 1:5258446/101‑1 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc > 1:3427766/1‑101 (MQ=255) aaCCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATcc < 1:7976224/101‑1 (MQ=255) ccccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCg > 1:3948202/1‑101 (MQ=255) cccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGc < 1:2018395/101‑1 (MQ=255) gcgaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccac < 1:8457317/98‑6 (MQ=255) ccTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCt > 1:9512239/1‑101 (MQ=255) cTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCCCCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCtt < 1:1150386/101‑1 (MQ=255) tATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTg < 1:12857116/101‑1 (MQ=255) gaTTTTGCCTTGCTCCTGGTGGGGTTTACCTAGCC‑GGTGCAATCACTTGCCCCGCTGGTGCGCTCTTACCGCACCTTTTCACCCTCACCGGATctccacag < 1:9704236/100‑8 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgc < 1:15055549/101‑1 (MQ=255) aTTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgc < 1:9159782/101‑1 (MQ=255) tttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcg < 1:5211324/101‑1 (MQ=255) ttGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTgcgc < 1:2334800/101‑1 (MQ=255) tGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGcgcg < 1:7163861/101‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCgg > 1:7024721/1‑101 (MQ=255) ggCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCgg < 1:49744/101‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCggg > 1:8665828/1‑101 (MQ=255) ccTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑CGGGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGc > 1:7511198/1‑101 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCa < 1:9948387/101‑1 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCa < 1:3864349/101‑1 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCa < 1:3754690/101‑1 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCa < 1:404345/101‑1 (MQ=255) ttGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCa > 1:681347/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg < 1:5887743/101‑1 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg > 1:14691020/1‑101 (MQ=255) cTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcg > 1:12333021/1‑101 (MQ=255) tCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcgg > 1:11295624/1‑101 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg < 1:14818270/101‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg > 1:4462585/1‑101 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg < 1:9006790/101‑1 (MQ=255) cGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcg < 1:6465556/101‑1 (MQ=255) gggTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATcggcgg > 1:5656045/1‑101 (MQ=255) | GACAGTCATTCATCTAGGCCAGCAATCGCTCACTGGCTCAAGCAGCCTACCCGGGTTCAGTACGGGCCGTACCTTATGAACCCCTATTTGGCCTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGC‑GGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGG > NC_007779/3270106‑3270306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |