| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,441,356 | T→G | 12.4% | S259A (TCC→GCC) | thiC → | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,441,356 | 0 | T→G | 12.4% | 100.9 ‑1.6 ‑0.3 | 264 | S259A (TCC→GCC) | thiC | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (13/20): ref base (120/111): total (133/131) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.96e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.36e-01 | ||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GATGATTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGG > NC_007779/3441256‑3441456 | gatgatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGt > 1:6448858/1‑101 (MQ=255) atgatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTc > 1:12560880/1‑101 (MQ=255) atgatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTc > 1:13799180/1‑101 (MQ=255) atgatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTc > 1:9093593/1‑101 (MQ=255) tgatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTcc > 1:15010707/1‑101 (MQ=255) gatTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCa < 1:14651841/101‑1 (MQ=255) gatTAGTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCa < 1:432207/101‑1 (MQ=255) ttattGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCAcg < 1:462335/101‑1 (MQ=255) ttattGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCAcg < 1:14205474/101‑1 (MQ=255) ttattGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCAcg > 1:158234/1‑101 (MQ=255) tattGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCAcgc > 1:1065693/1‑101 (MQ=255) tGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCt > 1:8556367/1‑101 (MQ=255) ggTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTg < 1:606361/101‑1 (MQ=255) tCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTggg > 1:658858/1‑101 (MQ=255) gCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGa > 1:7407323/1‑101 (MQ=255) aaTTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGc > 1:1631621/1‑101 (MQ=255) ttCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGa > 1:3677357/1‑101 (MQ=255) ttCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGa > 1:8093828/1‑101 (MQ=255) tCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGAt < 1:12216897/101‑1 (MQ=255) tCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGAt < 1:3837291/101‑1 (MQ=255) tCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGAt < 1:9125040/101‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATAc < 1:6430461/101‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATAc < 1:7015799/101‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATAc > 1:4768258/1‑101 (MQ=255) cTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATAc < 1:9569650/101‑1 (MQ=255) cTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATAc < 1:10479161/101‑1 (MQ=255) aaaaGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGa > 1:5412990/1‑101 (MQ=255) aaaGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGAt < 1:8456681/101‑1 (MQ=255) aaaGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGAt > 1:14462750/1‑101 (MQ=255) aaaGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGAt > 1:3369951/1‑101 (MQ=255) gTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGa < 1:5111644/101‑1 (MQ=255) gTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGa < 1:8910/101‑1 (MQ=255) ttAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGAt < 1:1325937/101‑1 (MQ=255) tAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGAtc > 1:2571231/1‑101 (MQ=255) aaCGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGAtct > 1:11188752/1‑101 (MQ=255) aCGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGAtctc > 1:148349/1‑101 (MQ=255) gCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGAtctctc > 1:2850577/1‑101 (MQ=255) aaTATCGGCAACTCGGCGGTCGCCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCAc > 1:10854029/1‑101 (MQ=255) aaTATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCAc > 1:5891866/1‑101 (MQ=255) atatCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCAcc < 1:3497712/101‑1 (MQ=255) atatCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCAcc < 1:1088106/101‑1 (MQ=255) tCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGt > 1:1981544/1‑101 (MQ=255) tCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGt < 1:1717641/101‑1 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTc > 1:10984352/1‑101 (MQ=255) cGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTc > 1:14858600/1‑101 (MQ=255) gCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGc > 1:8752032/1‑101 (MQ=255) gCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGc > 1:2888884/1‑101 (MQ=255) cAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCt > 1:12131150/1‑101 (MQ=255) aaCTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCta > 1:7574659/1‑101 (MQ=255) aaCTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCta > 1:2447416/1‑101 (MQ=255) aCTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCtat < 1:11432361/101‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTatat > 1:12382036/1‑101 (MQ=255) gcggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCa > 1:2294647/1‑101 (MQ=255) gcggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCa < 1:6705030/101‑1 (MQ=255) gcggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCa < 1:7820595/101‑1 (MQ=255) ggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACg < 1:10593037/101‑1 (MQ=255) tCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGaa > 1:5009494/1‑101 (MQ=255) ccTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAAcc > 1:9447939/1‑101 (MQ=255) tctTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCcg > 1:13224659/1‑101 (MQ=255) ttCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCcgcg < 1:4481343/101‑1 (MQ=255) ttCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCcgcg > 1:3947341/1‑101 (MQ=255) tCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGa < 1:6993111/101‑1 (MQ=255) 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tccgaagaggTGGAGAAGATGGTGTGGGCGACCCGTTGGGGCGCGGACACCATCATGGACCTGTCCACCGGTAAGGACATTCACGAAACCCGCGAGTGGAt < 1:980838/98‑1 (MQ=255) gaagaagaaGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGAt > 1:7699005/1‑101 (MQ=255) ccgaagaggTGGAGAAGATGGTGTGGGCGACCCGTTGGGGCGCGGACACCATCATGGACCTGTCCACCGGTAAGGACATTCACGAAACCCGCGAGTGGAtt > 1:8336660/3‑101 (MQ=255) agaagacgTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGAttt > 1:13407451/1‑101 (MQ=255) gaagaggTGGAGAAGATGGTGTGGGCGACCCGTTGGGGCGCGGACACCATCATGGACCTGTCCACCGGTAAGGACATTCACGAAACCCGCGAGTGGAttct > 1:7241428/1‑99 (MQ=255) agaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGc < 1:15139730/101‑1 (MQ=255) gaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCg > 1:12672966/1‑101 (MQ=255) 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gagaaGATGGTGTGGGCGACCCGTTGGGGCGCGGACACCATCATGGACCTGTCCACCGGTAAGGACATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTCTGCGTAActc < 1:5300940/98‑3 (MQ=255) aaaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGcc < 1:10575175/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGccc < 1:9688304/101‑1 (MQ=255) agatGGTGTGGGCGACCCGTTGGGGCGCGGACACCATCATGGACCTGTCCACCGGTAAGGACATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTCTGCGTAACTCCCCg < 1:13090043/98‑1 (MQ=255) aGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCg < 1:2096677/101‑1 (MQ=255) gCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCgg < 1:6760159/101‑1 (MQ=255) gCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTAACGAAACCCGCGAGGGGCTTTTGCGTAACAGCCCgg > 1:9563783/1‑101 (MQ=255) ggTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGc > 1:12856641/1‑101 (MQ=255) ggTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGc < 1:5996975/101‑1 (MQ=255) gTATAGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCTGTGcc < 1:15086925/101‑1 (MQ=255) tATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCg < 1:2997684/101‑1 (MQ=255) aTGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGa > 1:11783796/1‑101 (MQ=255) aTGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGa > 1:11677590/1‑101 (MQ=255) aTGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGa > 1:13998493/1‑101 (MQ=255) tGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGAt < 1:3108688/101‑1 (MQ=255) ggTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATc < 1:10253501/101‑1 (MQ=255) tCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGACCGGTGCCGATCgg > 1:9396525/1‑101 (MQ=255) | GATGATTATTGGTCGCAATTTCCTGGTAAAAGTTAACGCCAATATCGGCAACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGG > NC_007779/3441256‑3441456 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |