| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1221495 | 0 (0.000) | 182 (0.830) | 111/180 | NT | 100% | intergenic (+717/+2387) | ymgF/ymgD | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | = 1302369 | NA (NA) | intergenic (+11/‑527) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
TGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1221396‑1221495‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < NC_007779/1302369‑1302282 TGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATT < 1:497907/101‑1 GGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTG > 1:1675021/1‑101 GATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATGAGCGATAGCGATTGG > 1:1083433/1‑101 GATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGG > 1:2871365/1‑101 ATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGA > 1:10146176/1‑101 TATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGAT < 1:2456174/101‑1 ATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATT > 1:3811430/1‑101 ATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATT < 1:8083193/101‑1 ATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTG < 1:7187501/101‑1 AATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCC > 1:4111279/1‑101 AATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCC > 1:1377400/1‑101 ATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCC < 1:180712/101‑1 ATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCC < 1:3422134/101‑1 AATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTA > 1:8731279/1‑101 AATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTA > 1:10319710/1‑101 AATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTA < 1:1394376/101‑1 GCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATAT < 1:10983869/101‑1 CCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATT < 1:7996385/101‑1 CAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:2188251/1‑101 CAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:2276886/1‑101 AGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:10124786/101‑1 GTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:3294187/1‑101 TGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGACAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:1750683/101‑1 GTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:5057979/1‑101 TGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:3789054/1‑101 TGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:985959/1‑101 TGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:136696/1‑101 ATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA > 1:10349466/1‑101 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GTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:4440312/1‑101 GTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:9896479/1‑101 TGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 1:711310/101‑1 GATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:3497348/101‑1 ATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:6172880/101‑1 GGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA > 1:768582/1‑101 GATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:10691599/1‑101 GATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:8970390/1‑101 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ATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 1:945539/101‑1 TGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:7595711/101‑1 GGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACA > 1:4629535/1‑101 TATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:7888802/101‑1 TATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:5172617/101‑1 ATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 1:4232086/1‑101 ATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 1:5262428/1‑101 TTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC < 1:9012509/101‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |