Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,496,775 | Δ1 bp | 100% | coding (11/924 nt) | ydcI ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,496,775 | 0 | T→. | 100.0% | 1039.4 | 213 | coding (11/924 nt) | ydcI | DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (103/109): ref base (1/0): total (104/109) |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 | aaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttt > 1:1888346/1‑101 (MQ=255) aaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttt > 1:5312937/1‑101 (MQ=255) tAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttttt < 1:6754320/101‑1 (MQ=255) aaGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttc > 1:8761284/1‑100 (MQ=255) aaGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttc < 1:9296270/101‑2 (MQ=255) aaGGGTTTCACCCGCCCCCCCCAAAGTTACTTGTTGTGCGACAGCTGCAAAAGTATGAAGGTGGCGAAAACGGGTGAGCTTACTAAACAGCCTAtttgttc < 1:3888712/101‑2 (MQ=255) aGGGTTTCCGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGTCGCAAACGGATGCGCTGAATAAACAGAATAttttttcc < 1:3341668/101‑3 (MQ=255) aGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcc < 1:6466967/101‑3 (MQ=255) aGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcc < 1:446200/101‑3 (MQ=255) gggTTTCAGCCGGGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTGCGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:3590005/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca > 1:2905182/1‑98 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:3823725/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:1376937/101‑4 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg > 1:7687705/1‑101 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg < 1:3917451/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:1387010/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGa > 1:1490697/1‑101 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGa > 1:4194827/1‑101 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt > 1:8026814/1‑101 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTa < 1:4963959/101‑1 (MQ=255) gcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa > 1:720327/1‑101 (MQ=255) gcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa < 1:11028880/101‑1 (MQ=255) cgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGGCTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaa < 1:2639494/101‑1 (MQ=255) cgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaa < 1:5358432/101‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa > 1:8951194/1‑101 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:4253853/101‑1 (MQ=255) ccccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaaa > 1:9841721/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:4048716/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:8707116/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:6420748/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:5653425/1‑101 (MQ=255) gTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCg < 1:6179126/101‑1 (MQ=255) ccTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtg < 1:1623742/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:2702547/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc > 1:2558880/1‑101 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg < 1:10126788/101‑1 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg > 1:1952645/1‑101 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg < 1:5198145/101‑1 (MQ=255) tgttgtGCGACAGCTACGAATGGCTGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCg > 1:5675961/1‑101 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg > 1:9058152/1‑101 (MQ=255) gCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACa < 1:9503369/101‑1 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTT‑CATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:7550711/1‑101 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCTATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:10095044/1‑101 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:6156206/1‑101 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg < 1:379418/101‑1 (MQ=255) cAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTg < 1:10508887/101‑1 (MQ=255) cAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTg < 1:975501/101‑1 (MQ=255) cAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTg < 1:812506/101‑1 (MQ=255) aGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGATGACAAGTGa > 1:1787890/1‑101 (MQ=255) gCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTATCGCTGACAAGTGaa > 1:7113/1‑101 (MQ=255) tACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgt < 1:9917667/101‑1 (MQ=255) cGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttg < 1:5956152/101‑1 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgt < 1:7907987/101‑1 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgt < 1:2083003/101‑1 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTCAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgt < 1:4588116/101‑1 (MQ=255) aTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGttt < 1:4912801/101‑1 (MQ=255) aTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGttt < 1:8505900/101‑1 (MQ=255) aTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGttt < 1:3036952/101‑1 (MQ=255) tATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAt > 1:10247243/1‑101 (MQ=255) tATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAt > 1:8288770/1‑101 (MQ=255) cctttaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAt > 1:7393514/6‑101 (MQ=255) aTGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAtt < 1:9959442/101‑1 (MQ=255) aTGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAtt > 1:5932551/1‑101 (MQ=255) tGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTa < 1:9831439/101‑1 (MQ=255) tGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTa > 1:6869374/1‑101 (MQ=255) gAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTAt > 1:8450620/1‑101 (MQ=255) gAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTAt > 1:4008424/1‑101 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg > 1:10310884/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATa < 1:10012141/101‑1 (MQ=255) gTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATa > 1:8617905/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCAGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATa > 1:10671756/1‑101 (MQ=255) tGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATaa < 1:3230347/101‑1 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt > 1:4708553/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:5812133/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg < 1:2279661/101‑1 (MQ=255) cAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGa > 1:1273854/1‑101 (MQ=255) cAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTGTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGa < 1:5781263/101‑1 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:2381973/1‑101 (MQ=255) aaCGGAGGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAtt < 1:7337400/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:1346607/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCGGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:7753989/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGc > 1:475543/1‑101 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa > 1:469068/1‑101 (MQ=255) aTGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaa < 1:7365054/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaaa < 1:10856534/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaaa > 1:7208374/1‑101 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat > 1:8280754/1‑101 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat < 1:4601462/101‑1 (MQ=255) cgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAata > 1:10600690/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:918826/1‑101 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat < 1:7831996/101‑1 (MQ=255) tGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatta > 1:4505535/1‑101 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta < 1:5552564/101‑1 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta > 1:7148741/1‑101 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta < 1:8981084/101‑1 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATACGCGATGTTAAAAACGAAGCGGGGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc > 1:8823954/1‑101 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa > 1:6572537/1‑101 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa > 1:1529324/1‑101 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa < 1:3297817/101‑1 (MQ=255) gACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTa < 1:10983719/101‑1 (MQ=255) | CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |