| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 274,733 | Δ97,240 bp | 100% | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 205 [1] | [0] 205 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 274732 | 1 (0.000) | 174 (0.900) | 105/160 | NT | 99.7% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
| ? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 | gcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCa < 1:10800993‑M2/2‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACg < 1:9274041‑M2/4‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACg > 1:6825523‑M2/98‑101 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACg > 1:1306457‑M2/98‑101 (MQ=255) caggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGc < 1:5397280‑M2/5‑1 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaggctgctgngctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCaaaa > 1:5548365‑M2/93‑101 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaaa < 1:5991562‑M2/9‑1 (MQ=255) ttattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAt < 1:4559893‑M2/10‑1 (MQ=255) attcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATgg > 1:9423312‑M2/90‑101 (MQ=255) cttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCa < 1:10241857‑M2/15‑1 (MQ=255) cttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCa < 1:2335017‑M2/15‑1 (MQ=255) ttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCAAAAAGGCCAg > 1:7674998‑M2/86‑101 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt < 1:10056749‑M2/17‑1 (MQ=255) caataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTc > 1:2901436‑M2/84‑101 (MQ=255) aataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCt < 1:7932599‑M2/19‑1 (MQ=255) aataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCCAAATGGCCAGTCt > 1:8038861‑M2/83‑101 (MQ=255) ataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTg > 1:3107693‑M2/82‑101 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg < 1:6660430‑M2/21‑1 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg > 1:6092439‑M2/81‑101 (MQ=255) ccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGt < 1:6965790‑M2/23‑1 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:891600‑M2/24‑1 (MQ=255) gggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGa < 1:3975011‑M2/25‑1 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGaa < 1:2921448‑M2/26‑1 (MQ=255) gtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCAAAATGGCCAGACTGGGTGAAc > 1:10333393‑M2/75‑101 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAcc < 1:338503‑M2/28‑1 (MQ=255) catcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAACGc > 1:9742603‑M2/72‑101 (MQ=255) catcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGc > 1:8633211‑M2/72‑101 (MQ=255) tcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTg < 1:950375‑M2/32‑1 (MQ=255) atttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTgcg > 1:5294059‑M2/68‑101 (MQ=255) tccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAc < 1:10133224‑M2/37‑1 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAcc < 1:5036872‑M2/38‑1 (MQ=255) caccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCg < 1:6897190‑M2/39‑1 (MQ=255) caccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCg > 1:7194019‑M2/63‑101 (MQ=255) accactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCgg > 1:9900812‑M2/62‑101 (MQ=255) accactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCgg < 1:9354667‑M2/40‑1 (MQ=255) ccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggggcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACcggg > 1:672448‑M2/61‑100 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:9615258‑M2/44‑1 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:10472982‑M2/44‑1 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:5110606‑M2/44‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAAGGCCAGTCTGGGTGAACCGCCGCGCACCGGAGata > 1:5394364‑M2/57‑101 (MQ=255) gagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATc < 1:7076614‑M2/47‑1 (MQ=255) agcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCa < 1:4612013‑M2/48‑1 (MQ=255) gcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAt > 1:11006637‑M2/53‑101 (MQ=255) gcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAt < 1:2838001‑M2/49‑1 (MQ=255) cggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAtt < 1:8504022‑M2/50‑1 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc < 1:9456440‑M2/51‑1 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc > 1:61116‑M2/51‑101 (MQ=255) gggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTa > 1:3139829‑M2/48‑101 (MQ=255) ggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTAc < 1:9277443‑M2/55‑1 (MQ=255) gaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTAcc > 1:2134877‑M2/46‑101 (MQ=255) aacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCg < 1:8948284‑M2/57‑1 (MQ=255) cgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCggg < 1:1149294‑M2/59‑1 (MQ=255) tgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCa > 1:8295932‑M2/40‑101 (MQ=255) tgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCa > 1:10881427‑M2/40‑101 (MQ=255) tgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCa > 1:2282821‑M2/40‑101 (MQ=255) 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attggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggt < 1:5906897‑M2/76‑1 (MQ=255) attggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggt < 1:8334564‑M2/76‑1 (MQ=255) ttggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtg < 1:7714536‑M2/77‑1 (MQ=255) ttggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtg < 1:2438388‑M2/77‑1 (MQ=255) ttggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtg < 1:6933262‑M2/77‑1 (MQ=255) gtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCg < 1:7820452‑M2/80‑1 (MQ=255) gcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGcggc > 1:2889118‑M2/20‑100 (MQ=255) cgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTg < 1:7610976‑M2/83‑1 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa < 1:2080559‑M2/84‑1 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa > 1:1373269‑M2/18‑101 (MQ=255) ctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGaa < 1:3302351‑M2/85‑1 (MQ=255) ctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGaa < 1:3489402‑M2/85‑1 (MQ=255) ctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGaa > 1:6891876‑M2/17‑101 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGTTGGTGGCGGTGAAt < 1:1456079‑M2/86‑1 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAAt < 1:4932828‑M2/86‑1 (MQ=255) ctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCg < 1:2737657‑M2/93‑1 (MQ=255) tggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGa > 1:5449244‑M2/8‑101 (MQ=255) ggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGAt < 1:7760590‑M2/95‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:5799335‑M2/96‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGATGGCGGTGAATGCGGGCGATc > 1:5931522‑M2/6‑101 (MQ=255) ctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCg > 1:8665823‑M2/5‑101 (MQ=255) ctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCg > 1:8587528‑M2/5‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt < 1:3704774‑M2/98‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGACTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt > 1:2104306‑M2/2‑101 (MQ=255) | AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |