Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 274,547 | A→G | 100% | intergenic (‑206/‑2) | insH ← / → mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 274,547 | 0 | A→G | 100.0% | 990.6 | 234 | intergenic (‑206/‑2) | insH/mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (108/125): ref base (0/1): total (108/126) |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTA > NC_007779/274449‑274644 | aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:7098246/101‑1 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:1421636/101‑1 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:10730866/101‑1 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:8495832/101‑1 (MQ=255) cTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGc < 1:6401175/101‑1 (MQ=255) tGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCa > 1:142749/1‑101 (MQ=255) gCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaa < 1:7440471/101‑1 (MQ=255) cGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaaa < 1:2758433/101‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac < 1:8467410/101‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac > 1:4476780/1‑101 (MQ=255) tCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaaca > 1:7733287/1‑101 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa < 1:9106656/101‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa < 1:3524888/101‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaac > 1:671309/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaaca < 1:7039856/101‑1 (MQ=255) cAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaac > 1:8587817/1‑101 (MQ=255) aGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAAcaacacaaca > 1:5657715/1‑101 (MQ=255) aGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAAcaacacaaca > 1:10871340/1‑101 (MQ=255) gggTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACAcaacaa < 1:6350174/101‑1 (MQ=255) ggTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACaaa < 1:10043499/101‑1 (MQ=255) gTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACaaaa < 1:10642134/101‑1 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt < 1:8029958/101‑1 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt < 1:3236535/101‑1 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt < 1:2659073/101‑1 (MQ=255) tGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATg > 1:7709194/1‑101 (MQ=255) tGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATg < 1:2868922/101‑1 (MQ=255) gACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgc > 1:7223051/1‑101 (MQ=255) ttGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCa > 1:881811/1‑101 (MQ=255) ttGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCa < 1:9284780/101‑1 (MQ=255) cATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTg < 1:7954831/101‑1 (MQ=255) cATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTg < 1:1566514/101‑1 (MQ=255) aTTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGa < 1:11040408/101‑1 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAg > 1:6627627/1‑101 (MQ=255) cTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgc > 1:5032164/1‑101 (MQ=255) tGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcg > 1:5909795/1‑101 (MQ=255) tGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcg > 1:1488008/1‑101 (MQ=255) tGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcg < 1:482069/101‑1 (MQ=255) gTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcgc > 1:1307671/1‑101 (MQ=255) gTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcgc > 1:9340859/1‑101 (MQ=255) ttAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGca > 1:3897393/1‑101 (MQ=255) aaCAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGcaca > 1:5320704/1‑101 (MQ=255) cAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAAt < 1:9617951/101‑1 (MQ=255) cAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAAt > 1:4892844/1‑101 (MQ=255) cAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAAt < 1:2568399/101‑1 (MQ=255) aaaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATg > 1:2539176/1‑101 (MQ=255) aaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGa < 1:10366525/101‑1 (MQ=255) cgcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGaaa > 1:707645/1‑101 (MQ=255) gcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGaaaa < 1:1802118/101‑1 (MQ=255) gcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGaaaa < 1:9777009/101‑1 (MQ=255) cgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAc < 1:4012315/101‑1 (MQ=255) cgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAc > 1:336543/1‑101 (MQ=255) gTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcgc > 1:948812/1‑101 (MQ=255) tataACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcgcg < 1:3167291/101‑1 (MQ=255) taACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTc < 1:693518/101‑1 (MQ=255) aaCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCa > 1:5777568/1‑101 (MQ=255) aaCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCa < 1:10150385/101‑1 (MQ=255) aaCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCa < 1:4716507/101‑1 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAc > 1:3079690/1‑101 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc < 1:10612418/101‑1 (MQ=255) aaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTg < 1:115488/101‑1 (MQ=255) aaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTg > 1:2110991/1‑101 (MQ=255) cttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGAtt < 1:7260252/101‑1 (MQ=255) ttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTa > 1:3464645/1‑101 (MQ=255) tcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTAt < 1:6407250/101‑1 (MQ=255) tcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTAt > 1:807296/1‑101 (MQ=255) tcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTAt > 1:1436449/1‑101 (MQ=255) cttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATg > 1:918951/1‑101 (MQ=255) ttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCt > 1:1884382/1‑101 (MQ=255) tGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCtt < 1:5564244/101‑1 (MQ=255) ggATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCttt < 1:896934/101‑1 (MQ=255) ggATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCttt < 1:4068586/101‑1 (MQ=255) gATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTc < 1:6041001/101‑1 (MQ=255) gATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTc > 1:2322884/1‑101 (MQ=255) gTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCtt < 1:9956633/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:6568120/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg > 1:4942193/1‑101 (MQ=255) ttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTgg < 1:5886423/101‑1 (MQ=255) tAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTggg > 1:2132968/1‑101 (MQ=255) aGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggc > 1:3287676/1‑101 (MQ=255) tGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcggc < 1:3701195/101‑1 (MQ=255) tGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcggc > 1:4970753/1‑101 (MQ=255) gTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGgcggcg < 1:9928480/101‑1 (MQ=255) gTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGgcggcg < 1:1222977/101‑1 (MQ=255) cATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGa < 1:9224490/101‑1 (MQ=255) aTACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAt > 1:5489796/1‑101 (MQ=255) aTACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAt > 1:8276763/1‑101 (MQ=255) tACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAtt < 1:423451/101‑1 (MQ=255) aCGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTg < 1:10420142/101‑1 (MQ=255) aCGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTg < 1:3786585/101‑1 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgg > 1:1640772/1‑101 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca < 1:82359/101‑1 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca < 1:7521672/101‑1 (MQ=255) tAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGcaca < 1:784226/101‑1 (MQ=255) aGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAg > 1:7674689/1‑101 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat < 1:5710952/101‑1 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat < 1:6821210/101‑1 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat < 1:1246147/101‑1 (MQ=255) ggTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatt < 1:6829376/101‑1 (MQ=255) gTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCAGAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatta < 1:5299055/101‑1 (MQ=255) gTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatta > 1:1527275/1‑101 (MQ=255) | CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATTA > NC_007779/274449‑274644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |