| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 245 [0] | [0] 246 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_007779 | = 274732 | 0 (0.000) | 200 (0.970) | 111/160 | NT | 100% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
| ? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
GCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGCTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/274625‑274732‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTT > NC_007779/371973‑372072 GCGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTC < 1:4738748/101‑1 CGTGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCT > 1:7879614/1‑101 TGATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGG < 1:3267164/101‑1 GATTGGCACAGGATTATTCTTCAATACCGGGTACATCATTTCCACCACTGGAGCGGCGGGAACGCTGCTGGCCTATCTGATTGGTGCGCTGGTGGTCTGGC < 1:6198473/101‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |