New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1221495 | 0 (0.000) | 210 (0.890) | 115/180 | NT | 100% | intergenic (+717/+2387) | ymgF/ymgD | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_007779 | = 1302369 | NA (NA) | intergenic (+11/‑527) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
TGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1221396‑1221495 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < NC_007779/1302369‑1302282 TGGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATT < 1:1456996/101‑1 GGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTG > 1:717675/1‑101 GGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTG > 1:11764682/1‑101 GGATATATAAATAATGCCAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATACAAGCGATAGCGATTG > 1:8876693/1‑101 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CAGTGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTT < 1:4700514/101‑1 TGTGATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA > 1:4478469/1‑101 GATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:10739975/1‑101 GATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:4981802/1‑101 ATGACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 1:11201251/101‑1 GACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:9285680/101‑1 GACTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC > 1:10312150/1‑101 CTAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG > 1:1082620/1‑101 TAGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 1:4433230/101‑1 AGTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT > 1:9843707/1‑101 GTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 1:5142342/101‑1 GTGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA < 1:1831316/101‑1 TGGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:6554029/101‑1 GGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC > 1:1878634/1‑101 GGTGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 1:5636868/101‑1 TGATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 1:6917874/101‑1 ATGGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT > 1:6696655/1‑101 GGATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA < 1:8412243/101‑1 TCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 1:8181079/1‑101 TCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC > 1:3980466/1‑101 CTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:2418188/1‑101 TATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:7819350/1‑101 TATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT < 1:7569452/101‑1 TATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:9050169/1‑101 ATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 1:6074702/101‑1 ATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:7437611/1‑101 GTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 1:6756157/101‑1 TATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:10752154/1‑101 TATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:4913362/1‑101 TTTCTGTTGATAGTCAAAACAACGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 1:10097509/101‑1 TCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 1:8947507/1‑101 CTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:5853878/1‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |