New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779 | 1909344 = | 223 (0.950) | 29 (0.120) | 28/180 | NT | 11.5% | intergenic (‑39/+631) | yobF/yebO | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
GAGAAGCGGTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGATCAGACGCACAAATCTCGATACGTCTTCCACTTTTTTTGCACACTTATGCAACGG > NC_007779/1909244‑1909444 | aaGCGGTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATcaca < 1:9921271/101‑1 (MQ=255) aaGCGGTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATcaca > 1:4141204/1‑101 (MQ=255) aaGCGGTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATcaca < 1:8736298/101‑1 (MQ=255) ggTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACa > 1:5391705/1‑101 (MQ=255) ggTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACa > 1:9435268/1‑101 (MQ=255) gTATTCAACGTCAACGTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACaa < 1:2432325/101‑1 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tcaacgtcaacgTGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGtt > 1:5521636/1‑101 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACATACAACGtt > 1:6846967‑M1/89‑101 (MQ=255) caacgtcaacgtGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTa < 1:3222900/101‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACATACAACGTTaa < 1:5191450‑M1/15‑1 (MQ=255) acgtcaacgtGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAAt < 1:4093356/101‑1 (MQ=255) acgtcaacgtGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAAt > 1:2768008/1‑101 (MQ=255) cgtcaacgtGTTTACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatga < 1:6435651‑M1/101‑9 (MQ=255) 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tACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttatt < 1:6277601‑M1/101‑21 (MQ=255) tACTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAt > 1:1172731/1‑101 (MQ=255) aCTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAtt < 1:6215614/101‑1 (MQ=255) aCTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAtt > 1:11069364/1‑101 (MQ=255) cTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttattga > 1:5636268‑M1/1‑79 (MQ=255) cTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAttt < 1:11818468/101‑1 (MQ=255) cTCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAttt < 1:1194756/101‑1 (MQ=255) tCAGGACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCAtttt > 1:7605230/1‑101 (MQ=255) gACTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTaaa > 1:4347145/1‑101 (MQ=255) aCTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:5119917‑M1/1‑73 (MQ=255) aCTTCTTTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAAc < 1:3515092/101‑1 (MQ=255) cttcttTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTATCCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACa < 1:8209381/101‑1 (MQ=255) cttcttTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACa > 1:7500932/1‑101 (MQ=255) tcttTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:1872584‑M1/101‑32 (MQ=255) tcttTACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATg < 1:5844607/101‑1 (MQ=255) tttACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 1:3302640‑M1/101‑34 (MQ=255) tACTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGtctc < 1:6076994/101‑1 (MQ=255) aCTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCg < 1:2261466/101‑1 (MQ=255) aCTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCg < 1:2478060/101‑1 (MQ=255) cTGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAACGTTAATTATGGCAAGCCATTTTTAAACATGTCTCGa < 1:860342/101‑1 (MQ=255) tGAAAATGCCACACATAAACAGAACTGTACCTCGTTTAACCCGAAATCTGTTATCACATACAAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca < 1:4442970‑M1/101‑39 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |