New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3988379 | NA (NA) | 283 (1.210) | 149/180 | NT | 100% | coding (746/783 nt) | yhiS | hypothetical protein |
? | NC_007779 | 4009199 = | 0 (0.000) | coding (1375/1623 nt) | yhiJ | hypothetical protein |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
CAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTGAA > NC_007779/3988286‑3988479 | cAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAtt > 1:1174527/1‑101 (MQ=11) aaGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAttt > 1:3625710/1‑101 (MQ=31) aaGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAAttt > 1:5909692/1‑101 (MQ=31) aGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACTTGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTg > 1:3512443/1‑101 (MQ=17) aGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTg > 1:2217099/1‑101 (MQ=32) cATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGt < 1:9137811/101‑1 (MQ=35) aCGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTg < 1:2507288/101‑1 (MQ=40) cGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGa < 1:10007084/101‑1 (MQ=255) cGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGa < 1:7879347/101‑1 (MQ=255) gggAGAAAAAATCGGCTCAAATATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGaa > 1:9571787/1‑101 (MQ=255) gggAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGaa > 1:4121881/1‑101 (MQ=255) gggAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGaa > 1:6597472/1‑101 (MQ=255) ggAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTTAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGaaa < 1:2705820/101‑1 (MQ=255) ggAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGaaa < 1:7228438/101‑1 (MQ=255) agaAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAAtt < 1:1504224/101‑1 (MQ=255) gaAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAAttt < 1:1680836/101‑1 (MQ=255) gaAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAAttt > 1:945341/1‑101 (MQ=255) aaaaTCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTtata < 1:10187823/101‑1 (MQ=255) aaaTCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTatat < 1:6399402/101‑1 (MQ=255) aaaTCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTatat > 1:1743881/1‑101 (MQ=255) aTCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTa > 1:8902579/1‑101 (MQ=255) cGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAg < 1:933148/101‑1 (MQ=255) ggCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGt > 1:5806199/1‑101 (MQ=255) ggCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGt < 1:7399096/101‑1 (MQ=255) ggCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATCTATATTAAGt < 1:7378561/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTa < 1:10838528/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTa < 1:1890683/101‑1 (MQ=255) gCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTa > 1:2066702/1‑101 (MQ=255) gCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTa < 1:4307401/101‑1 (MQ=255) cTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAg < 1:8203046/101‑1 (MQ=255) cTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAg < 1:5536757/101‑1 (MQ=255) tCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGa > 1:6000533/1‑101 (MQ=255) tCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGa < 1:1980584/101‑1 (MQ=255) aaCATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCt > 1:11193241/1‑101 (MQ=255) aaCATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCt > 1:10628774/1‑101 (MQ=255) aCATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCtt < 1:2660042/101‑1 (MQ=255) aCATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCtt > 1:5449445/1‑101 (MQ=255) aCATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCtt > 1:8750792/1‑101 (MQ=255) aTGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCg > 1:2851834/1‑101 (MQ=255) aTGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCg > 1:2365016/1‑101 (MQ=255) tGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGa < 1:1048291/101‑1 (MQ=255) gaagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGaa < 1:7117383/101‑1 (MQ=255) gaagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCATCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGaa < 1:9228280/101‑1 (MQ=255) aagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGaaa < 1:6246773/101‑1 (MQ=255) aagaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGaaa > 1:11654194/1‑101 (MQ=255) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAAt < 1:7634671/101‑1 (MQ=255) agaaATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAAt < 1:5114766/101‑1 (MQ=255) gaaatgaaatGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATa < 1:4498129/101‑1 (MQ=255) aaatgaaatgACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATaa > 1:4986176/1‑101 (MQ=255) tgaaatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAAc > 1:8812977/1‑101 (MQ=255) aatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCtt < 1:10422244/101‑1 (MQ=255) aatgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCtt > 1:8569259/1‑101 (MQ=255) atgaCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTg < 1:8437566/101‑1 (MQ=255) aCTGAGTCAGCCGAGGAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACa < 1:4599128/101‑1 (MQ=255) aCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACa > 1:1251456/1‑101 (MQ=255) aCTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACa < 1:11372780/101‑1 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACaa > 1:7445915/1‑101 (MQ=255) cTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACaa > 1:10747333/1‑101 (MQ=255) gAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAgg > 1:7803112/1‑101 (MQ=255) gAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAgg < 1:10867795/101‑1 (MQ=255) aGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGt > 1:8341995/1‑101 (MQ=255) aGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGt > 1:8044745/1‑101 (MQ=255) aGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGt < 1:6911196/101‑1 (MQ=255) aGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGt < 1:613762/101‑1 (MQ=255) gTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGtt < 1:6753864/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTa < 1:7970727/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTa > 1:2404605/1‑101 (MQ=255) cAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAg > 1:6314840/1‑101 (MQ=255) cAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAg > 1:7158842/1‑101 (MQ=255) gagaAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAgaacga < 1:11791379/101‑1 (MQ=255) agaagaATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAgaacgaa > 1:3938487/1‑101 (MQ=255) agaagaATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAgaacgaa < 1:6423105/101‑1 (MQ=255) aagaaTTTCCCCGCTTATTCGCCCCCTCCCTAAATTTGCGTCAGTGCAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAACCCTTGACAAGGTTAGAACGAAcc < 1:2926786/101‑1 (MQ=38) aagaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAAcc > 1:10572374/1‑101 (MQ=255) agaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAAccc > 1:10679297/1‑101 (MQ=255) gaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCg > 1:5578549/1‑101 (MQ=255) aaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCgg > 1:4797545/1‑101 (MQ=255) aTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGa < 1:11167299/101‑1 (MQ=255) aTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGa > 1:3070616/1‑101 (MQ=255) aTTTCCCCGCTTACTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGa < 1:11082929/101‑1 (MQ=255) tttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGAc < 1:6560058/101‑1 (MQ=255) ttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTCTATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCNGNCa < 1:8660088/101‑1 (MQ=255) tCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAg > 1:10100924/1‑101 (MQ=255) tCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAg < 1:8384598/101‑1 (MQ=255) cGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTc < 1:11555945/101‑1 (MQ=255) gCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTct < 1:10447549/101‑1 (MQ=255) ttCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTctgtcct < 1:8095312/101‑1 (MQ=255) tCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTctgtcctg < 1:5399938/101‑1 (MQ=255) cGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTctgtcctgt > 1:3336698/1‑101 (MQ=255) gCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTctgtcctgtc > 1:8266225/1‑101 (MQ=255) gCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTctgtcctgtc > 1:5637067/1‑101 (MQ=255) cACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCa < 1:4233441/101‑1 (MQ=255) cACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCa < 1:6809058/101‑1 (MQ=255) aCCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCat > 1:4733648/1‑101 (MQ=255) ccTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCata > 1:11006781/1‑101 (MQ=255) ccTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCata > 1:9739264/1‑101 (MQ=255) tCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTg < 1:316113/101‑1 (MQ=255) cccTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTGa > 1:3865667/1‑101 (MQ=255) cccTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTGa < 1:11305646/101‑1 (MQ=255) ccTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTGaa > 1:10230603/1‑101 (MQ=255) | CAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATTTGCGTCAGTGAAATTTATATTAAGTAGATCTTCGAAATAAAACCTTGACAAGGTTAGAACGAACCCGGACAGGTTCTGTCCTGTCATATTGAA > NC_007779/3988286‑3988479 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |