| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 2,410,314 | 1 | .→C | 0.8% | 0.4 ‑0.7 ‑0.0 | 262 | intergenic (‑572/+59) | nuoA/lrhA | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit A/DNA‑binding transcriptional repressor |
| Rejected: E-value exceeds prediction threshold. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (0/2): ref base (128/132): total (128/134) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.98e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.45e-01 | ||||||||||
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTC > NC_007779/2410213‑2410414 | ttCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACT‑AAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaaa < 1:10506988/101‑1 (MQ=255) tCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaaa < 1:10962902/101‑1 (MQ=255) tCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGATCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTaaaa > 1:11282303/1‑101 (MQ=255) cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAa‑c < 1:7017229/101‑1 (MQ=255) cGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAa‑c < 1:6944282/101‑1 (MQ=255) ggACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAa‑cac > 1:7460846/1‑101 (MQ=255) gACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CAcc < 1:8283261/101‑1 (MQ=255) aCGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CAccc < 1:2889462/101‑1 (MQ=255) cGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CAcccc > 1:618629/1‑101 (MQ=255) gTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CAccccc < 1:6873992/101‑1 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCa < 1:9947680/101‑1 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCa < 1:8826511/101‑1 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCa < 1:10415077/101‑1 (MQ=255) tGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCa > 1:3265353/1‑101 (MQ=255) gAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAg < 1:5750883/101‑1 (MQ=255) aaTCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGc < 1:4909752/101‑1 (MQ=255) tctcTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCgg > 1:10287475/1‑101 (MQ=255) ctctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGc > 1:7679983/1‑101 (MQ=255) ctctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGc > 1:3751552/1‑101 (MQ=255) ctctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGc > 1:2534578/1‑101 (MQ=255) ctGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTc > 1:1907871/1‑101 (MQ=255) tggtggTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCg > 1:2091566/1‑101 (MQ=255) tggtggTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGGTTTAAA‑CACCCCCAGCGGGTCg > 1:9760797/1‑101 (MQ=255) gtggtAAAAAAATAAACTGTTTTTTACGTTCTGCACTATGCAATGAAGGATTTTTAAAAAAAAAAGGCCG‑GGGGGTTTAAAACCCCCCCCGGGGGCTCGtt < 1:8001812/101‑1 (MQ=255) gtggtAAAAAAATAAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGTTTTTTACAAAAAAAAAGCCGC‑GGGGTTTAAAACCCCCCCCAGCGGCTCGtt < 1:10354111/101‑1 (MQ=255) ggtTAAAAAATGAACATTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACAAAAAAAAAGCCGCGGGGTTTAAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGtttt < 1:4474246/101‑1 (MQ=255) ttGAAAAATGAACATTTTTGTCCTTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACAAAAAAAAACCCGCTGGGGTTAAAAC‑CCCCCCCAGCGGCTCGtttttt < 1:6240038/101‑1 (MQ=255) tGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTa > 1:5495584/1‑101 (MQ=255) aaaaaTAAACGGTTTTGTCCGTTCTCCCCTAGGCGAAAAAGGATTTTTACAAAAAAAAAGCCCCTGGGGTTAAAAA‑CCCCCCCAGGGGCTCGTTTTTTaca < 1:8600348/101‑1 (MQ=255) ataaaCGGTTTTGTCCGTTCTGCACTATGCGATGAAGTTTTTTTAAAAAAAAAAAGCCGCGGGGGTTAAAAC‑CCCCCCCGGCGGCTCGTTTTTTACACTAt < 1:257812/98‑1 (MQ=255) ataaaCATTTTTGTCCGTTCTGCCTTATGCGATGAAGGTTTTTTACAAAAAAAAAGCCGCTGGGTTTTAAAA‑CCCCCCCAGGGGCTCGTTTTTTACACTAt < 1:8382089/98‑1 (MQ=255) aTGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTAt > 1:4100355/1‑101 (MQ=255) aCAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCCCGTTTTTTTCACTAttttt > 1:2960261/1‑98 (MQ=255) cAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtct < 1:11371117/101‑1 (MQ=255) cAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtct < 1:5209931/101‑1 (MQ=255) aGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGtctc < 1:5395669/101‑1 (MQ=255) ttttttcGTTCTGCCCTTTGGGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAgg < 1:11143714/95‑1 (MQ=255) tttGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTAAACTATTGTCTCaag > 1:10094294/1‑99 (MQ=255) tGTACTTTTTGCATTAGGGGATGAGGGTTTTTTA‑TAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAAt < 1:7206360/101‑1 (MQ=255) gTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAAt < 1:9559144/101‑1 (MQ=255) gTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatc > 1:6678877/1‑101 (MQ=255) ttCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatct < 1:15429/101‑1 (MQ=255) ttCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatct < 1:10628056/101‑1 (MQ=255) cTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctat > 1:10708108/1‑101 (MQ=255) tGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATtatctatc < 1:1833665/101‑1 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcg < 1:11354783/101‑1 (MQ=255) gCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcg < 1:3610014/101‑1 (MQ=255) cccTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCGGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCGGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgt < 1:11104771/99‑1 (MQ=255) aCTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtc > 1:1446855/1‑101 (MQ=255) cTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtcc > 1:3375816/1‑101 (MQ=255) cTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtcc > 1:6028593/1‑101 (MQ=255) tATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtccg < 1:11514166/101‑1 (MQ=255) tATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCCTTTTTTACACTATTTTCTCAGGGATTATCTATcgtccg > 1:7911484/1‑101 (MQ=255) aTGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATcgtccgt < 1:907190/101‑1 (MQ=255) gggagAAGGTTTTTTAAAAAAAAAAAGCCCGCGGGGTTTAAAACCCCCCCCGGGGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCg < 1:2370052/97‑1 (MQ=255) ggaggaagtttttttAAAAAAAAAAGGCCGCGGGGGTTAAAAC‑CCCCCCCGGGGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGa < 1:5887238/91‑1 (MQ=255) cGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGa < 1:11851745/101‑1 (MQ=255) gATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGAt > 1:9253686/1‑101 (MQ=255) tGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CGCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTa < 1:1285564/101‑1 (MQ=255) aagatttttaACAAAAAAAAGGCCGCTGGGTTTAAAAC‑CCCCCCCGGCGCCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACt < 1:6095198/96‑1 (MQ=255) aaGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACAATATTGTCTCCGGAATTATCACTCTTCCGTGGAATACt > 1:6121721/1‑101 (MQ=255) aaGGATTTTTACAAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCGGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACt < 1:351061/101‑1 (MQ=255) aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTc > 1:8462232/1‑101 (MQ=255) aGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTc > 1:6885098/1‑101 (MQ=255) ggATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCGGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCg < 1:6514246/101‑1 (MQ=255) ggATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCg > 1:5169641/1‑101 (MQ=255) ggATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCg > 1:4869369/1‑101 (MQ=255) aTTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGat < 1:4808478/101‑1 (MQ=255) tttttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGata > 1:7587310/1‑101 (MQ=255) tttACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCACAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATc > 1:3091279/1‑101 (MQ=255) tACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑AACCCCCAGCGGCTCGGTTTTTACACTATTGTCTCAGGGATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATccc > 1:2263308/1‑101 (MQ=255) aCTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCt < 1:10545212/101‑1 (MQ=255) cTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCtt < 1:1320967/101‑1 (MQ=255) tAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCttt < 1:9730280/101‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCttt < 1:8424111/100‑1 (MQ=255) aaaaaagGCGGGTGGGGTTAAAAC‑CCCCCCCGGGGGGTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtca < 1:10014747/101‑1 (MQ=255) aaaaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtca < 1:11693338/101‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaat > 1:4266243/1‑101 (MQ=255) aaaaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGGTTTTTAAACTCTTGTCTCAGGGATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATTCCTTtcaat > 1:3917929/1‑101 (MQ=255) aaaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaatc < 1:5513293/101‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTtcaatca > 1:6772052/1‑101 (MQ=255) acccGGTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCCGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaac < 1:4355830/99‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CCCCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATcaac < 1:10780596/101‑1 (MQ=255) 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ggggTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAat < 1:7724597/101‑1 (MQ=255) gTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcat > 1:8735348/1‑101 (MQ=255) tttAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTTTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc > 1:7782995/1‑101 (MQ=255) tttAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc < 1:9828743/101‑1 (MQ=255) tttAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAatcatc < 1:7510456/101‑1 (MQ=255) aaa‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCt > 1:9509908/1‑101 (MQ=255) aa‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCtt > 1:1641214/1‑101 (MQ=255) a‑cacCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTc < 1:9323402/101‑1 (MQ=255) a‑cacCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTc < 1:5294152/101‑1 (MQ=255) a‑cacCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCATCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTc > 1:8654685/1‑101 (MQ=255) | TTCGGGACGTGAATCTCTGGTGGTTGAAAAATGAACAGTTTTGTACGTTCTGCACTATGCGATGAAGGATTTTTACTAAAAAAAAGCCGCTGGGGTTTAAAA‑CACCCCCAGCGGCTCGTTTTTTACACTATTGTCTCAGGAATTATCTATCGTCCGTCGATTACTCGATATCCCTTTCAATCAACAATGAATCATCCCCTTC > NC_007779/2410213‑2410414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |