| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 569,996 | G→C | 100% | intergenic (+345/‑120) | ybcK → / → ybcL | recombinase/kinase inhibitor |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 569,996 | 0 | G→C | 100.0% | 1032.9 | 236 | intergenic (+345/‑120) | ybcK/ybcL | recombinase/kinase inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (110/126): ref base (0/0): total (110/126) | ||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
TTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGAT > NC_007779/569898‑570093 | ttGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCa > 1:1247297/1‑101 (MQ=255) gAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCaaa > 1:6718382/1‑101 (MQ=255) gAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCaaa < 1:234673/101‑1 (MQ=255) aaTGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAaat < 1:598552/101‑1 (MQ=255) aTGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAaata < 1:3758520/101‑1 (MQ=255) tGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAaataa < 1:9673638/101‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |