New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1305037 | 20 (0.060) | 394 (1.170) | 144/172 | NT | 95.4% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase |
Only 100 of 507 total aligned reads displayed.
GCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1304934‑1305037 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519723‑2519822 GCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTAT < 1:14981344/101‑1 GGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCC > 1:13968977/1‑101 TACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAA < 1:7933493/101‑1 TACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAA > 1:8259425/1‑101 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TAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:15974637/1‑101 TAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:16336458/1‑101 AGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTA > 1:13905200/1‑101 TGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:11862553/101‑1 GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATGCCGTGATGGGTCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:5744156/101‑1 GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 1:6608686/1‑101 GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:6062500/101‑1 GGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:4407492/1‑101 GGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:16981897/101‑1 CGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT > 1:1673160/1‑101 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:12283609/101‑1 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:12077321/1‑101 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT < 1:11466214/101‑1 CCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:3868904/101‑1 CCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:11016899/101‑1 CGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG > 1:4120437/1‑101 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AAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATA < 1:12608214/101‑1 AACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT > 1:7605135/1‑101 ACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATG > 1:687679/1‑101 CAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA > 1:14314038/1‑101 AAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAT > 1:10461919/1‑101 AAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATT < 1:6385459/101‑1 ACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 1:6974488/101‑1 ACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA > 1:1037443/1‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |