| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 1,301,041 | Δ1,336 bp | 100% | insC–insD | insC, insD | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 1301041–1302367 | 1302376 | 10–1336 | 379 [0] | [0] 385 | insC–insD | insC, insD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1301040 | 0 (0.000) | 306 (0.940) | 127/166 | NT | 100% | intergenic (+218/‑90) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein |
| ? | NC_007779 | 1302377 = | 0 (0.000) | intergenic (+19/‑519) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGT > NC_007779/1300940‑1301140 | ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtt > 1:9227175‑M1/1‑99 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtta > 1:14656185‑M1/1‑98 (MQ=255) agttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaa < 1:17791079‑M1/101‑5 (MQ=255) gttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaat > 1:14753254‑M1/1‑96 (MQ=255) gttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaat < 1:14344342‑M1/101‑6 (MQ=255) tataAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattc > 1:798279‑M1/1‑94 (MQ=255) taAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatttca > 1:11594154‑M1/1‑92 (MQ=255) taAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattcca < 1:1713721‑M1/101‑10 (MQ=255) aGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccact < 1:7050302‑M1/101‑12 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgc > 1:15165233‑M1/1‑88 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgc > 1:17445240‑M1/1‑88 (MQ=255) ttCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctt > 1:12789096‑M1/1‑85 (MQ=255) cTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttgg < 1:8910360‑M1/101‑20 (MQ=255) ttAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggt > 1:2677534‑M1/1‑81 (MQ=255) tAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggta > 1:6212627‑M1/1‑80 (MQ=255) tAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggta > 1:7234771‑M1/1‑80 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtag < 1:9621254‑M1/101‑23 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga < 1:16300955‑M1/101‑24 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga > 1:8065004‑M1/1‑78 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagagg > 1:3800561‑M1/1‑76 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagagg > 1:2452125‑M1/1‑76 (MQ=255) gCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagagga < 1:15592305‑M1/101‑27 (MQ=255) cTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaa > 1:6875311‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaa > 1:2619726‑M1/1‑74 (MQ=255) tctcCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaag < 1:17032312‑M1/101‑30 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagt < 1:16404050‑M1/101‑31 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagt < 1:4218846‑M1/101‑31 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgct > 1:8528832‑M1/1‑68 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTGGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:14892757‑M1/1‑65 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:11487492‑M1/1‑65 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:2957645‑M1/101‑37 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:15091700‑M1/101‑37 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:12530797‑M1/101‑38 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:15903873‑M1/101‑38 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:9797789‑M1/101‑38 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata > 1:585447‑M1/1‑63 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:6392261‑M1/101‑39 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:16760845‑M1/101‑40 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:13089653‑M1/1‑62 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:9018649‑M1/101‑43 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:103822‑M1/101‑43 (MQ=255) tGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:1173006‑M1/1‑58 (MQ=255) gTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatc < 1:13214986‑M1/101‑45 (MQ=255) gTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatc > 1:36228‑M1/1‑57 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatca < 1:545505‑M1/101‑46 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatca < 1:9450668‑M1/101‑46 (MQ=255) aTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaat < 1:8360312‑M1/101‑48 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaatt < 1:329787‑M1/101‑49 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaatt > 1:5304157‑M1/1‑53 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgt < 1:10605014‑M1/101‑51 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgt > 1:10002306‑M1/1‑51 (MQ=255) tCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgtt < 1:6099914‑M1/101‑52 (MQ=255) gCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaa < 1:14701052‑M1/101‑54 (MQ=255) acaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaatt < 1:17390900‑M1/101‑57 (MQ=255) atcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattat > 1:314707‑M1/1‑43 (MQ=255) tcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattatt < 1:8823329‑M1/101‑60 (MQ=255) atAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgt > 1:1877323‑M1/1‑40 (MQ=255) tAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtg < 1:10903027‑M1/101‑63 (MQ=255) tAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtg < 1:7713473‑M1/101‑63 (MQ=255) aTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgca < 1:6689317‑M1/101‑65 (MQ=255) cTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:9489223‑M1/1‑34 (MQ=255) cTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:12249847‑M1/1‑34 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttca > 1:12487205‑M1/1‑32 (MQ=255) ggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac < 1:4634821‑M1/101‑71 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta > 1:4053294‑M1/1‑29 (MQ=255) ttGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac > 1:1571612‑M1/1‑28 (MQ=255) ttGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac < 1:15361934‑M1/101‑74 (MQ=255) ttGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac > 1:8302007‑M1/1‑28 (MQ=255) ttGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac < 1:12343121‑M1/101‑74 (MQ=255) tGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:3495589‑M1/1‑27 (MQ=255) gCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:10056074‑M1/101‑76 (MQ=255) cTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg > 1:16953891‑M1/1‑25 (MQ=255) tGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgga > 1:2016954‑M1/1‑24 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:2836678‑M1/1‑23 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:17550781‑M1/101‑79 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:13297848‑M1/101‑80 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:2356037‑M1/1‑21 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:4424534‑M1/1‑21 (MQ=255) gaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:10963255‑M1/1‑20 (MQ=255) gaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg < 1:4812203‑M1/101‑82 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:14970804‑M1/1‑19 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:14055809‑M1/101‑83 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:5128724‑M1/1‑19 (MQ=255) ataatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta > 1:9930446‑M1/1‑18 (MQ=255) tGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag > 1:11675205‑M1/1‑13 (MQ=255) gAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcaga < 1:13395248‑M1/101‑90 (MQ=255) aaTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaa > 1:9110569‑M1/1‑10 (MQ=255) aTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa > 1:11226715‑M1/1‑9 (MQ=255) aTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa < 1:17241731‑M1/101‑93 (MQ=255) tGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaag > 1:11914615‑M1/1‑8 (MQ=255) tGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaag < 1:7430098‑M1/101‑94 (MQ=255) tGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaag < 1:3405513‑M1/101‑94 (MQ=255) gATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaaga > 1:16594770‑M1/1‑7 (MQ=255) atatTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagat < 1:12889948‑M1/101‑96 (MQ=255) atatTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagat > 1:6590923‑M1/1‑6 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaatgtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata > 1:4938979‑M1/1‑5 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatag < 1:14430341‑M1/101‑98 (MQ=255) tattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac > 1:7910576‑M1/1‑2 (MQ=255) tattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac > 1:13860622‑M1/1‑2 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagaca > 1:1375894‑M1/1‑1 (MQ=255) | AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGT > NC_007779/1300940‑1301140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |