Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 758,440 | C→A | 100% | F110L (TTC→TTA) | sdhB → | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 758,440 | 0 | C→A | 100.0% | 1522.8 | 378 | F110L (TTC→TTA) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (172/204): ref base (0/1): total (172/206) |
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
CCGATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAC > NC_007779/758342‑758537 | gATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATg < 1:7291165/101‑1 (MQ=255) aTTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgc > 1:14800775/1‑101 (MQ=255) aTTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgc > 1:6609466/1‑101 (MQ=255) tttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcg < 1:8399152/101‑1 (MQ=255) tttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcg < 1:12407216/101‑1 (MQ=255) ttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcgc < 1:4949857/101‑1 (MQ=255) ttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcgc < 1:11302915/101‑1 (MQ=255) ggCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGGTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCaaa > 1:5518897/1‑100 (MQ=255) ggCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCaaa < 1:5991571/101‑2 (MQ=255) ggCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCaaa < 1:12253289/101‑2 (MQ=255) aCTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATg > 1:14630340/1‑101 (MQ=255) aCTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATg > 1:9452900/1‑101 (MQ=255) cTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATga > 1:11138969/1‑101 (MQ=255) cAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATgaga > 1:3439888/1‑101 (MQ=255) cAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATgaga > 1:13396982/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGaa < 1:16928427/101‑1 (MQ=255) aCCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGaaa > 1:15299946/1‑101 (MQ=255) aCCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGaaa < 1:5073331/101‑1 (MQ=255) ccAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGaaaa < 1:6991755/101‑1 (MQ=255) ccAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGaaaa < 1:3780285/101‑1 (MQ=255) ccAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGaaaa < 1:8596358/101‑1 (MQ=255) cAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAAt < 1:5167035/101‑1 (MQ=255) aGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAAtt < 1:6233460/101‑1 (MQ=255) gCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTa < 1:5419822/101‑1 (MQ=255) gCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTa < 1:12111567/101‑1 (MQ=255) gCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTa < 1:6413584/101‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTCTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTaa < 1:7412009/101‑1 (MQ=255) ctggCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGAACCGCTATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAg < 1:5756498/99‑1 (MQ=255) cGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAg > 1:4223631/1‑101 (MQ=255) gggCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGc > 1:15793675/1‑101 (MQ=255) cAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCtt > 1:8613917/1‑101 (MQ=255) cAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCAGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCtt < 1:5825652/101‑1 (MQ=255) agaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTAc > 1:3064716/1‑101 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:1935522/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:8441864/101‑1 (MQ=255) aTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGtt < 1:6728207/101‑1 (MQ=255) ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTg < 1:16625019/101‑1 (MQ=255) ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTg < 1:1908325/101‑1 (MQ=255) ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTg < 1:2094542/101‑1 (MQ=255) tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGa > 1:16029501/1‑101 (MQ=255) aTTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataa < 1:16979778/101‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGa > 1:16144818/1‑101 (MQ=255) ccGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACa > 1:7986903/1‑101 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa > 1:10275096/1‑101 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa > 1:14321726/1‑101 (MQ=255) gCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaa < 1:9868599/101‑1 (MQ=255) cTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaaa > 1:7597210/1‑101 (MQ=255) cTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaaa > 1:6116528/1‑101 (MQ=255) tGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAAt < 1:12532039/101‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAAt > 1:9064277/1‑101 (MQ=255) gCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATc > 1:11849278/1‑101 (MQ=255) ccAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATcc < 1:2304418/101‑1 (MQ=255) cAGGTTTGCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCg < 1:3142626/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCa < 1:3841260/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCa > 1:16450451/1‑101 (MQ=255) ttACCGGTGATCCGCGTTTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGc > 1:11906862/1‑101 (MQ=255) ttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGc > 1:4001828/1‑101 (MQ=255) tACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCt < 1:41386/101‑1 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc < 1:8180930/101‑1 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc < 1:11489478/101‑1 (MQ=255) ccGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcg < 1:8262665/101‑1 (MQ=255) cGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgc > 1:12930014/1‑101 (MQ=255) gTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGa > 1:13599117/1‑101 (MQ=255) gATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGc < 1:17435416/101‑1 (MQ=255) aTCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCa < 1:7857105/101‑1 (MQ=255) gcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTa > 1:2656066/1‑101 (MQ=255) gcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTa > 1:2018177/1‑101 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc > 1:3302857/1‑101 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc < 1:9678024/101‑1 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc > 1:13638177/1‑101 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc > 1:1762134/1‑101 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc > 1:810178/1‑101 (MQ=255) gATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACa > 1:12722003/1‑101 (MQ=255) ttGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGAt < 1:8059724/101‑1 (MQ=255) ggtggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGc > 1:15596942/1‑101 (MQ=255) gtggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGca > 1:6891581/1‑100 (MQ=255) gtggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGcc < 1:13110399/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa > 1:14579707/1‑101 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:4567694/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa > 1:17124330/1‑101 (MQ=255) tAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCagag < 1:901078/101‑1 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc < 1:15379070/101‑1 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc > 1:11593934/1‑101 (MQ=255) gACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagca < 1:14950089/101‑1 (MQ=255) cATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagcagc < 1:8762274/101‑1 (MQ=255) aTGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcg > 1:16865630/1‑101 (MQ=255) aTGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcg > 1:10028265/1‑101 (MQ=255) tGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcgc < 1:17836444/101‑1 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa < 1:7775411/101‑1 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa < 1:10457562/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:4729642/1‑101 (MQ=255) cAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa < 1:2423111/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa < 1:17240141/101‑1 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa < 1:1379965/101‑1 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa > 1:9318079/1‑101 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa > 1:10674769/1‑101 (MQ=255) aTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc > 1:1881030/1‑101 (MQ=255) aTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc < 1:11726450/101‑1 (MQ=255) aTTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc > 1:14993/1‑101 (MQ=255) aTTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc > 1:951540/1‑101 (MQ=255) | CCGATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAC > NC_007779/758342‑758537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |