| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 758,450 | T→A | 100% | Y114N (TAT→AAT) | sdhB → | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 758,450 | 0 | T→A | 100.0% | inf | 380 | Y114N (TAT→AAT) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (87/122): ref base (87/84): total (174/206) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.90e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.57e-02 | ||||||||||
Only 100 of 392 total aligned reads displayed.
GGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTA > NC_007779/758350‑758550 | gCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAata < 1:1497629/101‑1 (MQ=255) gCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAata < 1:3081096/101‑1 (MQ=255) cACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAaaat < 1:16675851/101‑1 (MQ=255) cACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAaaat > 1:8432575/1‑101 (MQ=255) aCTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATg > 1:9468562/1‑101 (MQ=255) cTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATga > 1:11138969/1‑101 (MQ=255) tCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATgag > 1:8462023/1‑101 (MQ=255) tCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATgag < 1:6192184/101‑1 (MQ=255) cAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATgaga > 1:13396982/1‑101 (MQ=255) ccAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGaaaa > 1:323321/1‑101 (MQ=255) aGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAAtt < 1:15411773/101‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTCTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTaa < 1:7412009/101‑1 (MQ=255) ctggCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGAACCGCTATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAg < 1:5756498/99‑1 (MQ=255) cGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAg > 1:12908009/1‑101 (MQ=255) cAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCtt < 1:15248774/101‑1 (MQ=255) aagaagATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTa > 1:8780029/1‑101 (MQ=255) aagaagATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTa > 1:2646539/1‑101 (MQ=255) agaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTAc > 1:3354793/1‑101 (MQ=255) aagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCt < 1:17606097/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:1935522/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt > 1:5006183/1‑101 (MQ=255) aTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGtt < 1:6728207/101‑1 (MQ=255) ttGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTg < 1:7747383/101‑1 (MQ=255) tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGa > 1:16029501/1‑101 (MQ=255) tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGa < 1:3799475/101‑1 (MQ=255) gATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaata < 1:12449675/101‑1 (MQ=255) aTTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataa > 1:9875320/1‑101 (MQ=255) aTTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataa > 1:12119828/1‑101 (MQ=255) ttCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataat < 1:1906024/101‑1 (MQ=255) ttCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataat < 1:16864138/101‑1 (MQ=255) cGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATgg < 1:16131927/101‑1 (MQ=255) cGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCACGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATgg > 1:1535521/1‑101 (MQ=255) gCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGa > 1:4626006/1‑101 (MQ=255) gCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGa < 1:4840553/101‑1 (MQ=255) ccGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACa > 1:8287376/1‑101 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa > 1:5955246/1‑101 (MQ=255) cTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGCCaaaa > 1:809183/1‑101 (MQ=255) gCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATc > 1:11849278/1‑101 (MQ=255) ccAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATcc < 1:2304418/101‑1 (MQ=255) aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCgt > 1:9743660/1‑100 (MQ=255) aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGc < 1:9043037/101‑1 (MQ=255) aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGc < 1:12082854/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCa < 1:530428/101‑1 (MQ=255) gTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCa < 1:7814002/101‑1 (MQ=255) tttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAg < 1:4105041/101‑1 (MQ=255) tttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAg < 1:8730546/101‑1 (MQ=255) ttACCGGTGATCCGCGTTTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGc > 1:11906862/1‑101 (MQ=255) ttACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGc < 1:2100889/101‑1 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc < 1:9359197/101‑1 (MQ=255) cGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgc > 1:12317069/1‑101 (MQ=255) gTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGa > 1:13599117/1‑101 (MQ=255) cgcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAttt < 1:8039416/101‑1 (MQ=255) cgcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAttt < 1:14767253/101‑1 (MQ=255) gcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTa > 1:8183153/1‑101 (MQ=255) gcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTa > 1:2018177/1‑101 (MQ=255) cgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTAc > 1:14602490/1‑101 (MQ=255) gATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACa > 1:16538658/1‑101 (MQ=255) tttGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGa > 1:17773106/1‑101 (MQ=255) gtggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGca > 1:6891581/1‑100 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa > 1:17124330/1‑101 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:396109/101‑1 (MQ=255) ggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCag < 1:4440599/101‑1 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc > 1:17418960/1‑101 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc > 1:7947735/1‑101 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc < 1:4209671/101‑1 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc > 1:11593934/1‑101 (MQ=255) aCATGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagcag > 1:546261/1‑101 (MQ=255) aTGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcg > 1:10028265/1‑101 (MQ=255) tGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcgc > 1:3632454/1‑101 (MQ=255) tGGGACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcgc > 1:95578/1‑101 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa < 1:10457562/101‑1 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa < 1:9125174/101‑1 (MQ=255) aCAATTATATTCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaa > 1:14849270/1‑101 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:8605088/1‑101 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:6394047/1‑101 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:5111811/1‑101 (MQ=255) cAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa < 1:2423111/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa < 1:17240141/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:11479404/1‑101 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa < 1:1379965/101‑1 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa < 1:16979454/101‑1 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa > 1:10674769/1‑101 (MQ=255) aaTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa > 1:16921345/1‑101 (MQ=255) aaTTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaaa > 1:6657059/1‑101 (MQ=255) aTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc < 1:11726450/101‑1 (MQ=255) aTTATATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc > 1:1870992/1‑101 (MQ=255) ttatATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACt > 1:14442252/4‑101 (MQ=255) tatATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTc < 1:13139178/99‑1 (MQ=255) atATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCC‑‑AGCAGCGCGAAAAACTCGAc > 1:14117980/2‑101 (MQ=255) atATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCg < 1:7323228/100‑1 (MQ=255) atATGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCg < 1:7067882/100‑1 (MQ=255) tATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGa > 1:10395915/1‑101 (MQ=255) aTGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGAc < 1:12688008/101‑1 (MQ=255) tGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACg < 1:10220876/101‑1 (MQ=255) tGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACg < 1:15718423/101‑1 (MQ=255) tGCGCAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACg > 1:286196/1‑101 (MQ=255) cgcAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACggg > 1:6092591/1‑101 (MQ=255) cAAAATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCt > 1:13659361/1‑101 (MQ=255) aaTATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTg > 1:13095789/1‑101 (MQ=255) atatGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGt > 1:16205545/1‑101 (MQ=255) | GGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAACTCGACGGGCTGTA > NC_007779/758350‑758550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |