Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,496,775 | Δ1 bp | 100% | coding (11/924 nt) | ydcI ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,496,775 | 0 | T→. | 100.0% | 1955.6 | 395 | coding (11/924 nt) | ydcI | DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (163/232): ref base (0/0): total (163/232) |
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 | cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt < 1:15866782/101‑1 (MQ=255) aaaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtt > 1:3203280/1‑101 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttt < 1:1970767/101‑1 (MQ=255) tAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAtttttt > 1:5073718/1‑101 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:5931671/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:11061420/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca < 1:16693799/101‑4 (MQ=255) gggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttcca > 1:15718787/1‑98 (MQ=255) ggTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttttttccat < 1:7178455/101‑5 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa < 1:297569/101‑1 (MQ=255) tttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATaa < 1:17144493/101‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg > 1:8684823/1‑101 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg < 1:10089246/101‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACATACTA‑TTTTTTCCATAAGCg < 1:14321862/101‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg < 1:1776528/101‑1 (MQ=255) aGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGa > 1:14976061/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt > 1:16331481/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt < 1:13746373/101‑1 (MQ=255) cgcgcgCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGt < 1:8859772/101‑1 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt > 1:17007175/1‑101 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGAATA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTa < 1:16599702/101‑1 (MQ=255) gcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa < 1:12218983/101‑1 (MQ=255) acgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAAAGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaa < 1:4774818/100‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:5324732/101‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:6793532/101‑1 (MQ=255) ccccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaaa > 1:13094467/1‑101 (MQ=255) ccccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaaa < 1:11589255/101‑1 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc < 1:15995327/101‑1 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc < 1:17667084/101‑1 (MQ=255) ccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACg > 1:5003628/1‑101 (MQ=255) ccAAAGTTCCCTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACg > 1:11407398/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:17846487/1‑101 (MQ=255) aaaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGaa > 1:15279406/1‑101 (MQ=255) aaaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGaa < 1:2864095/101‑1 (MQ=255) gTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCg < 1:12656707/101‑1 (MQ=255) ttCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCgg > 1:3906861/1‑101 (MQ=255) ttCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCgg < 1:10823488/101‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgt > 1:4907279/1‑101 (MQ=255) tCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgt < 1:16485886/101‑1 (MQ=255) cTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtgt > 1:14204506/1‑101 (MQ=255) cTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtgt < 1:12130868/101‑1 (MQ=255) cTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGgtgt < 1:7409503/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:11183126/101‑1 (MQ=255) ttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCt < 1:4053817/101‑1 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg > 1:348006/1‑101 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc < 1:10404872/101‑1 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc > 1:11943466/1‑101 (MQ=255) ggagACAGCTAGGAATGTGTGGGGGTGGCAAAAAGGGAGGGGGTGAAAAAACAGA‑TTTTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc < 1:14603437/98‑1 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg < 1:14726914/101‑1 (MQ=255) aCAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGt < 1:5475685/101‑1 (MQ=255) aCAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGt < 1:11815142/101‑1 (MQ=255) aCAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGAGTCGCTGACAAGt < 1:10698196/101‑1 (MQ=255) cAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTg < 1:9056170/101‑1 (MQ=255) aCGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgtt < 1:2014632/101‑1 (MQ=255) aCGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgtt < 1:2358760/101‑1 (MQ=255) cGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttg > 1:569067/1‑101 (MQ=255) cGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttg < 1:7785112/101‑1 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgt < 1:12920393/101‑1 (MQ=255) gAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttga < 1:8047686/101‑2 (MQ=255) aaTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgtt < 1:2512564/101‑1 (MQ=255) aTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGttt < 1:6351997/101‑1 (MQ=255) tGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTg < 1:6195629/101‑1 (MQ=255) aTGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGAtt < 1:942027/101‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTAt < 1:2728929/101‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg < 1:7478077/101‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg > 1:17525620/1‑101 (MQ=255) aGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGa > 1:11241961/1‑101 (MQ=255) aGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGa < 1:11313602/101‑1 (MQ=255) ggTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGAt > 1:15599252/1‑101 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt < 1:15381553/101‑1 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt < 1:4610954/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg < 1:8189533/101‑1 (MQ=255) cAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGa > 1:1896974/1‑101 (MQ=255) cAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGAAAACTTGa < 1:10272207/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:4227433/101‑1 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa > 1:6984523/1‑101 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa < 1:16168394/101‑1 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa < 1:6644466/101‑1 (MQ=255) gATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaa < 1:9803734/101‑1 (MQ=255) gATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaa > 1:10539633/1‑101 (MQ=255) tGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaaa < 1:5861429/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCaaaa > 1:2623495/1‑101 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat > 1:17294450/1‑101 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat > 1:4533688/1‑101 (MQ=255) tGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatta > 1:1624003/1‑101 (MQ=255) gACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtattat < 1:13398410/101‑1 (MQ=255) aCTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATattatt > 1:2195121/1‑101 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta < 1:7303178/101‑1 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa > 1:3792081/1‑101 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa < 1:7723707/101‑1 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa < 1:6390166/101‑1 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc > 1:7907569/1‑101 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc < 1:963470/101‑1 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa > 1:1466474/1‑101 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGGGGGGCCCCTGCCAAGGGAAGTGGTTGATTTATGTTACTTTGTTGGCAAATTATTATTaaaat > 1:8377620/1‑98 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa < 1:14029553/101‑1 (MQ=255) cAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAt > 1:4345747/1‑101 (MQ=255) cAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAt < 1:12436136/101‑1 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt > 1:13513198/1‑101 (MQ=255) gACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTa > 1:8289292/1‑101 (MQ=255) | CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |