| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4355060 = | 0 (0.000) | 333 (0.950) | 135/180 | NT | 100% | coding (1281/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | 4502861 = | NA (NA) | intergenic (+241/‑46) | intB/insC | integrase/IS2 insertion element repressor InsA | |||||
Only 100 of 734 total aligned reads displayed.
TACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354961‑4355160 | gCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGc < 1:10465606/101‑1 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg < 1:12801007‑M1/101‑2 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg < 1:12680039‑M1/101‑2 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg > 1:13355962‑M1/1‑100 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt < 1:5086684‑M1/101‑5 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt > 1:14685208‑M1/1‑97 (MQ=255) tCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgattt > 1:13431478‑M1/1‑96 (MQ=255) cGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAGTGCCTCCAGCGCGGTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttg < 1:12909939‑M1/101‑7 (MQ=255) ccTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcc < 1:2081873‑M1/101‑9 (MQ=255) ccTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcc > 1:1823595‑M1/1‑93 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGc > 1:6618952‑M1/86‑101 (MQ=255) cTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccc > 1:8408067‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccc > 1:65190‑M1/1‑91 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCt > 1:16277510‑M1/85‑101 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTg > 1:2823908‑M1/84‑101 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTg > 1:6835504‑M1/84‑101 (MQ=255) cGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccccta < 1:7391272‑M1/101‑13 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTgg > 1:14764018‑M1/83‑101 (MQ=255) gggTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctat < 1:11927212‑M1/101‑14 (MQ=255) gactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCtt < 1:10914425‑M1/22‑1 (MQ=255) gTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatat < 1:10599634‑M1/101‑16 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCttt < 1:16163030‑M1/23‑1 (MQ=255) tCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatattt < 1:1002183‑M1/101‑18 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc < 1:16457647‑M1/24‑1 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAc > 1:13556049‑M1/76‑101 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAc > 1:9511132‑M1/76‑101 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACt > 1:6186678‑M1/75‑101 (MQ=255) ccTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagac < 1:3624194‑M1/101‑24 (MQ=255) cTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagaca > 1:3380128‑M1/1‑77 (MQ=255) aacactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTa < 1:5511385‑M1/32‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTa < 1:195221‑M1/32‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTa < 1:4920943‑M1/32‑1 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTaaa > 1:3874624‑M1/68‑101 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTaaa < 1:4643881‑M1/34‑1 (MQ=255) tGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctg > 1:15142855‑M1/1‑73 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATc < 1:10114917‑M1/37‑1 (MQ=255) ccTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtt < 1:11146287‑M1/101‑31 (MQ=255) tCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttat > 1:8648899‑M1/1‑69 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg > 1:2355096‑M1/63‑101 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg > 1:5742247‑M1/63‑101 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg > 1:6312244‑M1/63‑101 (MQ=255) ccAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 1:17158556‑M1/1‑68 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCg < 1:5170033‑M1/41‑1 (MQ=255) cgcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactt > 1:7242915‑M1/1‑64 (MQ=255) gTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 1:2725920‑M1/1‑61 (MQ=255) gTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac < 1:14927931‑M1/101‑41 (MQ=255) gTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 1:10750922‑M1/1‑61 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGc > 1:3776625‑M1/55‑101 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGc < 1:14349575‑M1/47‑1 (MQ=255) ttttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:4551016‑M1/1‑60 (MQ=255) tttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 1:15997238‑M1/1‑59 (MQ=255) ttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 1:4424067‑M1/101‑44 (MQ=255) ttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 1:11002485‑M1/101‑44 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTa < 1:8219547‑M1/50‑1 (MQ=255) tCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:17557610‑M1/1‑57 (MQ=255) tCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 1:10246369‑M1/101‑45 (MQ=255) cTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt < 1:9686637‑M1/101‑46 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAAt > 1:15478178‑M1/49‑101 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATc < 1:12336242‑M1/54‑1 (MQ=255) aTCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac > 1:7896472‑M1/1‑54 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTACAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGt > 1:8934103‑M1/45‑101 (MQ=255) atttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGt < 1:3187885‑M1/57‑1 (MQ=255) ttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcg > 1:3987469‑M1/43‑101 (MQ=255) tttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccc < 1:16689958‑M1/101‑54 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgc > 1:11254659‑M1/42‑101 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcg > 1:6033764‑M1/41‑101 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcg < 1:14567245‑M1/61‑1 (MQ=255) gtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcgcg < 1:1677993‑M1/63‑1 (MQ=255) ccAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctg > 1:16969199‑M1/1‑44 (MQ=255) cAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgc < 1:11629323‑M1/101‑59 (MQ=255) aaCGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc > 1:9360137‑M1/1‑42 (MQ=255) aCGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccg > 1:14135775‑M1/1‑41 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTaa < 1:8777405‑M1/68‑1 (MQ=255) gTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgca > 1:13013243‑M1/1‑39 (MQ=255) tggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATc > 1:7146115‑M1/32‑101 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCtt > 1:14502872‑M1/30‑101 (MQ=255) 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ggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAg > 1:12549296‑M1/13‑101 (MQ=255) cTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga < 1:4785808‑M1/101‑83 (MQ=255) gggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGc < 1:9167074‑M1/90‑1 (MQ=255) gggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGc > 1:12078217‑M1/12‑101 (MQ=255) tctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAcc > 1:11809412‑M1/5‑101 (MQ=255) cACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag > 1:5372875‑M1/1‑11 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc > 1:1739024‑M1/1‑10 (MQ=255) cTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg < 1:1370295‑M1/101‑93 (MQ=255) cTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg > 1:13925881‑M1/1‑9 (MQ=255) cTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg > 1:15664872‑M1/1‑9 (MQ=255) | TACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354961‑4355160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |