| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,079,847 | T→A | 0.91% | L13Q (CTG→CAG) | glpR → | DNA‑binding transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,079,847 | 0 | T→A | 0.9% | 2.7 0.0 ‑0.0 | 438 | L13Q (CTG→CAG) | glpR | DNA‑binding transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (251/183): total (253/185) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.55e-01 | ||||||||||
Only 100 of 457 total aligned reads displayed.
TAGCGATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAA > NC_007779/4079747‑4079947 | tAGCGATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACt > 1:8966641/1‑101 (MQ=255)tAGCGATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACt > 1:11866603/1‑101 (MQ=255) gagATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTgg > 1:8046330/3‑101 (MQ=255) cgctGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAACCAAACACAACGCCACAACGGTATTATCGAACTGGt < 1:1010928/98‑1 (MQ=255) gATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGtt < 1:9484919/101‑1 (MQ=255) gATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGtt < 1:16006200/101‑1 (MQ=255) gATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGtt < 1:12453826/101‑1 (MQ=255) ggCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTaaa > 1:13537166/1‑101 (MQ=255) cTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAca < 1:5733164/101‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAca < 1:13909133/101‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAca > 1:13259103/1‑101 (MQ=255) ttttGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAcag < 1:7410221/101‑1 (MQ=255) tgttgATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAcagcag > 1:17295193/1‑101 (MQ=255) tgttgATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAAcagcag > 1:11011344/1‑101 (MQ=255) tgATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGTGATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGt > 1:7551223/1‑101 (MQ=255) ttCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTAt < 1:2003301/101‑1 (MQ=255) ttCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTAt > 1:4377555/1‑101 (MQ=255) tCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATg < 1:17637614/101‑1 (MQ=255) tCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATg < 1:7889597/101‑1 (MQ=255) aaTGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTa < 1:16109299/101‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTAc > 1:14231878/1‑101 (MQ=255) aTGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTAc > 1:12063078/1‑101 (MQ=255) tGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTAcc > 1:15939221/1‑101 (MQ=255) gcgcGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCg > 1:6695442/1‑101 (MQ=255) cgcgAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGa > 1:398997/1‑101 (MQ=255) cgaaaacgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAag > 1:6468021/1‑101 (MQ=255) gaaaacgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAaga > 1:546673/1‑101 (MQ=255) gaaaacgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAaga > 1:10515307/1‑101 (MQ=255) aaaacgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAagag > 1:13807569/1‑101 (MQ=255) aaacgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGc > 1:7326158/1‑101 (MQ=255) cgaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTgg < 1:12863751/101‑1 (MQ=255) gaaacTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGt > 1:16740436/1‑101 (MQ=255) gaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGt > 1:12967147/1‑101 (MQ=255) gaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGt < 1:3645750/101‑1 (MQ=255) gaaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGt > 1:15282408/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTa < 1:10554115/101‑1 (MQ=255) aaaaTAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTa > 1:9264263/1‑101 (MQ=255) aataatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTaga < 1:179514/101‑1 (MQ=255) ataatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTagag > 1:156135/1‑101 (MQ=255) taatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGc > 1:11195115/1‑101 (MQ=255) taatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGc < 1:17512195/101‑1 (MQ=255) aatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCa > 1:8503088/1‑101 (MQ=255) aatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCa < 1:10014602/101‑1 (MQ=255) aatTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCa < 1:14097208/101‑1 (MQ=255) atTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCAt > 1:259890/1‑101 (MQ=255) tCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCGCAACGGTATTATCGAACTGGTTGAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCAttt < 1:12640212/101‑1 (MQ=255) ccAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTtc < 1:3477598/101‑1 (MQ=255) cAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTtct < 1:1756851/101‑1 (MQ=255) aGGGATTTATAAATGAAAAAAACAAAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGGTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGGAGAGCATTtctc > 1:16450915/1‑101 (MQ=255) gggATTTATAAATGAAACATACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTcc < 1:14189282/101‑1 (MQ=255) ggATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCg > 1:14801644/1‑101 (MQ=255) aTTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTc < 1:6104544/101‑1 (MQ=255) ttATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAg > 1:6325357/1‑101 (MQ=255) tataAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGc > 1:5581048/1‑101 (MQ=255) tataAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGc > 1:2714322/1‑101 (MQ=255) taAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGccc > 1:17363652/1‑101 (MQ=255) taAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGccc > 1:14903028/1‑101 (MQ=255) aTGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCa > 1:2878428/1‑101 (MQ=255) gAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGa > 1:7258551/1‑101 (MQ=255) aaacaaacACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGAc > 1:2328844/1‑101 (MQ=255) aaacaaacACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGAc < 1:4642143/101‑1 (MQ=255) aacaaacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACt > 1:6241254/1‑101 (MQ=255) aacaaacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACt > 1:1509807/1‑101 (MQ=255) acaaacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTa < 1:16895407/101‑1 (MQ=255) acaaacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTa > 1:7703923/1‑101 (MQ=255) aaacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTAtt > 1:8766098/1‑101 (MQ=255) aacaCAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTc > 1:15424232/1‑101 (MQ=255) acacAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcg > 1:1922435/1‑101 (MQ=255) acacAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcg > 1:3264432/1‑101 (MQ=255) acacAACGTCACAACGGTATTATCGAACAGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTca < 1:8891153/101‑2 (MQ=255) cacaACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgc > 1:302682/1‑101 (MQ=255) acaACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgcc < 1:3905998/101‑1 (MQ=255) acaACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgcc < 1:7157042/101‑1 (MQ=255) acaACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgcc < 1:7010515/101‑1 (MQ=255) caACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgccg < 1:11648655/101‑1 (MQ=255) caACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgccg > 1:9129688/1‑101 (MQ=255) caACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgccg > 1:1271388/1‑101 (MQ=255) caACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgccg > 1:14453349/1‑101 (MQ=255) aaCGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTcgccgc < 1:16647360/101‑1 (MQ=255) gTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGAc > 1:9646271/1‑101 (MQ=255) gTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGAc > 1:17224079/1‑101 (MQ=255) tCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGAcc < 1:214088/101‑1 (MQ=255) tCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGAcc > 1:508635/1‑101 (MQ=255) tCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGAcc < 1:2229934/101‑1 (MQ=255) caACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCAGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCa < 1:1771726/101‑1 (MQ=255) aCGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAAt < 1:3410915/101‑1 (MQ=255) aCGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAAt > 1:5956347/1‑101 (MQ=255) cGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATg < 1:14541823/101‑1 (MQ=255) ggTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGa < 1:8260817/101‑1 (MQ=255) ttatCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTg < 1:8649366/101‑1 (MQ=255) ttatCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTg < 1:9434455/101‑1 (MQ=255) tatCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTgg > 1:11779656/1‑101 (MQ=255) tatCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTgg < 1:16366706/101‑1 (MQ=255) gAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCggg > 1:5332902/1‑100 (MQ=255) gAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGa > 1:13061687/1‑101 (MQ=255) aaCTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAg < 1:16193289/101‑1 (MQ=255) aaCTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAg < 1:10849728/101‑1 (MQ=255) cTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCa < 1:3836937/101‑1 (MQ=255) cTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCa < 1:17003212/101‑1 (MQ=255) tGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCaa > 1:1133256/1‑101 (MQ=255) | TAGCGATGGCTTTTGTTGATTCGCTCAATGCGCGAAAACGAAAATAATTCCAGGGATTTATAAATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGGGTTATGTCAGTACCGAAGAGCTGGTAGAGCATTTCTCCGTCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAA > NC_007779/4079747‑4079947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |