New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1305037 | 68 (0.260) | 190 (0.770) | 109/172 | NT | 74.5% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase |
Only 100 of 556 total aligned reads displayed.
GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 | tAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCa < 1:9793687‑M1/101‑2 (MQ=255) gcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCa > 1:3731744‑M2/87‑101 (MQ=255) aaTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCat < 1:8615802‑M1/101‑3 (MQ=255) aaTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCa > 1:5798706/1‑101 (MQ=255) tACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGATCGGGGTTGTTATCCCataa < 1:6998997‑M1/101‑5 (MQ=255) tACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataa < 1:2177207‑M1/101‑5 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtt > 1:3399082‑M2/84‑101 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt < 1:12339767‑M2/19‑1 (MQ=255) cTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGttt > 1:7287422/1‑101 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtttt < 1:6021132‑M2/20‑1 (MQ=255) tGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcg < 1:327910‑M1/101‑8 (MQ=255) tGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcg < 1:3059114‑M1/101‑8 (MQ=255) tGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcg > 1:9688461‑M1/1‑94 (MQ=255) gaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTtg < 1:143727‑M2/21‑1 (MQ=255) ttAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaact < 1:4191566‑M1/101‑14 (MQ=255) tAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTg > 1:185862/1‑101 (MQ=255) cgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCa < 1:4988826‑M2/29‑1 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAc > 1:1283983‑M2/72‑101 (MQ=255) ggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCa < 1:12784998‑M2/32‑1 (MQ=255) catcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCatt < 1:1047290‑M2/34‑1 (MQ=255) gCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttg < 1:6641175‑M1/101‑23 (MQ=255) tcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCattat < 1:11462156‑M2/36‑1 (MQ=255) gTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtg < 1:11045577‑M1/101‑25 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCattatt > 1:8996947‑M2/65‑101 (MQ=255) ttATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgg > 1:5383773‑M1/1‑76 (MQ=255) gtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCAttatta < 1:3956587‑M2/38‑1 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTc < 1:2724606‑M2/41‑1 (MQ=255) ttGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:1939495‑M1/1‑73 (MQ=255) ttGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:10815475‑M1/1‑73 (MQ=255) tGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtatt > 1:9882059‑M1/1‑72 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAt > 1:2813222‑M2/59‑101 (MQ=255) ccGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:11984726‑M1/101‑32 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATg < 1:6294171‑M2/44‑1 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATg > 1:12443991‑M2/58‑101 (MQ=255) cGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg > 1:9535362‑M1/1‑69 (MQ=255) gCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGat < 1:13087137/101‑1 (MQ=255) ggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGatat < 1:7908413‑M2/48‑1 (MQ=255) tAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga > 1:6696292‑M1/1‑64 (MQ=255) aaancaaaacACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 1:6098567‑M1/1‑63 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCg > 1:10599415‑M2/49‑101 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:9215377‑M1/101‑41 (MQ=255) ggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATc < 1:11585305‑M2/56‑1 (MQ=255) aaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCa > 1:6899252/1‑101 (MQ=255) aacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 1:6433937‑M1/101‑46 (MQ=255) aacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt > 1:3876437‑M1/1‑56 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAttt > 1:5296098‑M2/42‑101 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaa > 1:11911517‑M1/1‑54 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAttt < 1:7466734/101‑1 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAttt < 1:1543418/101‑1 (MQ=255) acCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:2660695‑M1/101‑49 (MQ=255) cattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGc < 1:167516‑M2/63‑1 (MQ=255) cAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt < 1:10704137‑M1/101‑51 (MQ=255) aaTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc < 1:2504282‑M1/101‑53 (MQ=255) aTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc > 1:11128979‑M1/1‑48 (MQ=255) tGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccg > 1:4848616‑M1/1‑47 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTg < 1:10134843‑M2/67‑1 (MQ=255) ggACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgat < 1:6514210‑M1/101‑57 (MQ=255) gACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCt < 1:1797113/101‑1 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCt < 1:11691216‑M2/70‑1 (MQ=255) aacTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatg < 1:9099843‑M1/100‑58 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGcc > 1:5958434‑M2/29‑101 (MQ=255) ataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt < 1:9612143‑M1/101‑62 (MQ=255) aCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattac > 1:7647203‑M1/1‑38 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGc < 1:5562480‑M2/77‑1 (MQ=255) tcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCg > 1:12950426‑M2/24‑101 (MQ=255) gTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactct < 1:4362623‑M1/101‑67 (MQ=255) gATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctca > 1:8731849‑M1/1‑33 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCt < 1:4110844‑M2/84‑1 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTgg < 1:10972570‑M2/86‑1 (MQ=255) ggCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgata < 1:7089579‑M1/101‑74 (MQ=255) aagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGa < 1:7336131‑M2/87‑1 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca < 1:8083201‑M1/101‑82 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca < 1:3794899‑M1/101‑82 (MQ=255) tGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTggg < 1:7707927/101‑1 (MQ=255) gcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTggg > 1:5124015‑M2/7‑101 (MQ=255) gACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagc < 1:6773480‑M1/101‑84 (MQ=255) ttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgc < 1:11191654‑M2/97‑1 (MQ=255) aCCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgc > 1:11757618/1‑101 (MQ=255) aCCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGGGGCTGGAATGGTGGGgc > 1:3511552/1‑101 (MQ=255) ccGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaa < 1:9368878‑M1/101‑86 (MQ=255) tGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCt < 1:11539611‑M2/100‑1 (MQ=255) tGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCt < 1:11409001‑M2/100‑1 (MQ=255) gttgttATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctg < 1:10378574‑M1/101‑91 (MQ=255) ttgttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTaaa < 1:4631490/101‑1 (MQ=255) ttgttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTaaa > 1:6235424/1‑101 (MQ=255) gttATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcc < 1:12138323‑M1/101‑94 (MQ=255) ttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTc < 1:12522097/101‑1 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccata < 1:8154091‑M1/101‑98 (MQ=255) tCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATg < 1:11303458/101‑1 (MQ=255) ccccAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGa < 1:8880081/101‑1 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:2300732‑M1/1‑3 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat < 1:12698795‑M1/101‑99 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:4455572‑M1/1‑3 (MQ=255) cccAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGat > 1:3642343/1‑101 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:13307766‑M1/1‑2 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt < 1:839805‑M1/101‑100 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg < 1:2549743‑M1/101‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg < 1:4266140‑M1/101‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg < 1:8011685‑M1/101‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:10000599‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |