New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | 272 (1.050) | 132/180 | NT | 96.5% | intergenic (‑147/+15) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
? | NC_007779 | = 2985055 | 10 (0.040) | coding (553/1230 nt) | yqeG | transporter |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 | cacacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCg < 1:9876203/101‑1 (MQ=255) cacacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCg > 1:7919786/1‑101 (MQ=255) acacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCgg < 1:3515751/101‑1 (MQ=255) cacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTaa > 1:9676029/1‑101 (MQ=255) aaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGa < 1:12249113/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa > 1:1314534/1‑101 (MQ=255) aGCAATTCCATTTATAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:12843327/101‑1 (MQ=255) aaTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACt > 1:871536/1‑101 (MQ=255) aaTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACt > 1:11746724/1‑101 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:1798925/101‑1 (MQ=255) tCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:2067873/101‑1 (MQ=255) tCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:9744714/101‑1 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg > 1:3998021/1‑101 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:4628434/101‑1 (MQ=255) aTTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:8422381/101‑1 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt > 1:6464297/1‑101 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 1:5340045/101‑1 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa < 1:10855265/101‑1 (MQ=255) tGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:9602329/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:3205525/101‑1 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg > 1:2024006/1‑101 (MQ=255) aTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt > 1:4466188/1‑101 (MQ=255) tgtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 1:1392904/101‑1 (MQ=255) gtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:4749662/101‑1 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 1:1099923/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:5966407/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:7532773/101‑1 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:5747302/101‑1 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:8154893/1‑101 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:3870616/101‑1 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:1694207/1‑101 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:4794423/1‑101 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:10687550/101‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:5611484/101‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:9390143/101‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg > 1:4142865/1‑101 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa < 1:5578133/101‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:1902462/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACTCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:9158137/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:5912503/101‑1 (MQ=255) cAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:2387413/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:2906706/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:2958878/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:7509457/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:6929575/1‑101 (MQ=255) gTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATg > 1:1443859/1‑101 (MQ=255) tttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc > 1:5691445/1‑101 (MQ=255) tttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc > 1:11695452/1‑101 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:11854991/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:3578202/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg > 1:5494759/1‑101 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:10059998/101‑1 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 1:7011446/1‑101 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg < 1:1560802/101‑1 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg < 1:2490463/101‑1 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc > 1:887830/1‑101 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 1:4922307/1‑101 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt < 1:12702868/101‑1 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt < 1:1328671/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:12088769/1‑101 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:2707805/101‑1 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 1:2162450/1‑101 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:5219102/1‑101 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACACCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:6499186/1‑101 (MQ=255) ggACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:4396110/1‑101 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:6670436/101‑1 (MQ=255) aCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:2603763/101‑1 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc < 1:10432276/101‑1 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:10648944/1‑101 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:9046285/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:926221/1‑101 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:1130584/1‑101 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:3077263/1‑101 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc < 1:7790389/101‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:7721724/1‑101 (MQ=255) gTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTc > 1:2432419/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:7955003/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:3693324/1‑101 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg > 1:10004481/1‑101 (MQ=255) aTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGa < 1:2539486/101‑1 (MQ=255) gCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt < 1:6855444/101‑1 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTTTCATTCAGCGCCACCGAttt < 1:8218478/101‑1 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt > 1:6174525/1‑101 (MQ=255) tatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 1:6075591/101‑1 (MQ=255) atGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:3338412/1‑101 (MQ=255) tGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag > 1:3747379/1‑101 (MQ=255) gAGTTGCACTACCAAAGCGGTAGTGACTCCAACTTATTGGTGGTGTTTTATGTTCCGATAATGCCTGATGCCTTTCTCATGCAGCTCCAccccttccgagc > 1:500711/1‑91 (MQ=14) aGTTACACTAAAAAAGCCGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa < 1:7274664/101‑1 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc > 1:11507317/1‑101 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc > 1:6306630/1‑101 (MQ=255) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:2299858/101‑1 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:12346175/101‑1 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:10540240/101‑1 (MQ=40) aCTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:612209/101‑1 (MQ=40) tAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg > 1:8938543/1‑101 (MQ=38) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 1:7103573/1‑101 (MQ=35) aaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 1:10175663/1‑101 (MQ=34) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt > 1:8556490/1‑101 (MQ=33) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt > 1:4290513/1‑101 (MQ=33) aaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc > 1:6025537/1‑101 (MQ=32) | CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |