| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3744263 | NA (NA) | 235 (0.910) | 123/180 | NT | 100% | intergenic (‑91/+30) | insC/yidZ | IS2 element protein/DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_007779 | 3903274 = | 0 (0.000) | coding (37/825 nt) | bax | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
TTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAA > NC_007779/3903174‑3903374 | tCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCgatgat < 1:638518/101‑1 (MQ=255) aCTCTCAAATTTGGGAAAAATATAAGGGGTTGGAATGATCAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATACGGGGCGATGATTCt > 1:11148718/1‑101 (MQ=255) tctcAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTg < 1:13347537‑M1/101‑2 (MQ=255) ctcAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTgg > 1:2841134‑M1/1‑99 (MQ=255) ctcAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTgg < 1:6837499‑M1/101‑3 (MQ=255) aaTTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggattt > 1:2478580‑M1/1‑95 (MQ=255) aaTTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggattt < 1:7327116‑M1/101‑7 (MQ=255) aaTTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggattt < 1:3609827‑M1/101‑7 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTactcac < 1:2702626‑M2/17‑1 (MQ=255) tgAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccct > 1:12178373‑M1/1‑89 (MQ=255) tgAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccct < 1:5793441‑M1/101‑13 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagagtcagggggccagtctaATTCTTATGTTactcact < 1:4782168‑M2/18‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctat > 1:700230‑M1/1‑87 (MQ=255) aaaaTATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctata < 1:5144702‑M1/101‑16 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGgt < 1:521493‑M2/23‑1 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattgggtgtctggagattcagggggccaggctaATTCTTATGTTACTCACTCTGgt > 1:4184816‑M2/79‑101 (MQ=255) aaTATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatt < 1:4886760‑M1/101‑18 (MQ=255) aaTATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatt < 1:11491639‑M1/101‑18 (MQ=255) aaTATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatt < 1:7212028‑M1/101‑18 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGgtg > 1:5446131‑M2/78‑101 (MQ=255) atatAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatattt > 1:4297424‑M1/1‑83 (MQ=255) atatAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatattt > 1:3670736‑M1/1‑83 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtt > 1:6020640‑M2/76‑101 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtt > 1:6602194‑M2/76‑101 (MQ=255) taAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttcca < 1:8417043‑M1/101‑22 (MQ=255) taAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttcca > 1:8713825‑M1/1‑80 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGttt > 1:465021‑M2/75‑101 (MQ=255) gtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGttt > 1:10351306‑M2/75‑101 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtttt > 1:12590645‑M2/74‑101 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGtttt < 1:3177635‑M2/28‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTc > 1:5913945‑M2/73‑101 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCg > 1:10045041‑M2/72‑101 (MQ=255) ggTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagac < 1:2767021‑M1/101‑25 (MQ=255) tgtTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacat < 1:1082299‑M1/101‑27 (MQ=255) aactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTg > 1:11763505‑M2/68‑101 (MQ=255) ggAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgt < 1:6454252‑M1/101‑31 (MQ=255) aaTGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:10686725‑M1/1‑69 (MQ=255) aTGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:4348094‑M1/101‑34 (MQ=255) tGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 1:1188574‑M1/101‑35 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGtt < 1:9213157‑M2/41‑1 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGtt < 1:5669302‑M2/41‑1 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTa < 1:7880183‑M2/42‑1 (MQ=255) aTTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 1:3405088‑M1/1‑65 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGc > 1:5494980‑M2/58‑101 (MQ=255) aaTCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 1:3306249‑M1/1‑61 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGaa > 1:1729620‑M2/55‑101 (MQ=255) aTCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 1:10412034‑M1/1‑60 (MQ=255) tCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:12494389‑M1/1‑59 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGa > 1:242415‑M2/53‑101 (MQ=255) cGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca > 1:11566976‑M1/1‑57 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGAc > 1:8278606‑M2/52‑101 (MQ=255) ccAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 1:7520995‑M1/101‑48 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGca > 1:1473792‑M2/49‑101 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcac > 1:3080895‑M2/48‑101 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGcacac < 1:8598827‑M2/56‑1 (MQ=255) gagaCCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:3001253‑M1/101‑52 (MQ=255) ttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACacaac > 1:9652617‑M2/43‑101 (MQ=255) cTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgc < 1:3508911‑M1/101‑57 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACacaacaac < 1:8791266‑M2/62‑1 (MQ=255) tgatgaTTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct > 1:1944379‑M1/1‑44 (MQ=255) gtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACacaacaaca > 1:2111859‑M2/39‑101 (MQ=255) tgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAg > 1:7573753‑M2/38‑101 (MQ=255) gatgatTTTGACTCCCATACGACGATATGGTGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaccagcccgctg < 1:6121876‑M1/101‑59 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCg < 1:2369792‑M2/66‑1 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCg > 1:6921290‑M2/36‑101 (MQ=255) tggttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAgtg > 1:11369195‑M2/32‑100 (MQ=255) ttgtctggagattcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCaaa < 1:6333423‑M2/73‑1 (MQ=255) aCTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatat > 1:4984238‑M1/1‑33 (MQ=255) aCTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatat > 1:11657927‑M1/1‑33 (MQ=255) cccATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcc > 1:7427403‑M1/1‑30 (MQ=255) cccATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcc > 1:1307274‑M1/1‑30 (MQ=255) ccATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc > 1:12697365‑M1/1‑29 (MQ=255) cATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccg < 1:1634721‑M1/101‑74 (MQ=255) aTACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgt < 1:838180‑M1/101‑75 (MQ=255) aTACGACGATATGGGGCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgt > 1:10143364‑M1/1‑27 (MQ=255) attcagggggccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACtt < 1:8163872‑M2/83‑1 (MQ=255) 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aggggcGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgata > 1:10986631‑M1/2‑16 (MQ=255) gggCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac < 1:226671‑M1/101‑88 (MQ=255) ccagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCt < 1:9405288‑M2/93‑1 (MQ=255) ggCGATGATTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 1:9475853‑M1/1‑13 (MQ=255) cagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACCCAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTa < 1:12900875‑M2/94‑1 (MQ=255) cagtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTa > 1:7699017‑M2/8‑101 (MQ=255) agtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAg < 1:3124023‑M2/95‑1 (MQ=255) gtctaATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGt < 1:5549283‑M2/96‑1 (MQ=255) gatgatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccag > 1:6719675‑M1/1‑10 (MQ=255) atgatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc < 1:12000214‑M1/101‑93 (MQ=255) tgatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg > 1:7607099‑M1/1‑8 (MQ=255) taATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaat > 1:7949980‑M2/3‑101 (MQ=255) taATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaat < 1:10561918‑M2/99‑1 (MQ=255) gatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgc > 1:2057962‑M1/1‑7 (MQ=255) gatTCTTggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgc < 1:4520945‑M1/101‑95 (MQ=255) aATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaata > 1:1789830‑M2/2‑101 (MQ=255) aATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGtaata < 1:9293574‑M2/100‑1 (MQ=255) | TTCAACTCTCAAATTTGTGAAAAATATAAGGTGTTGGAATGATTAAATCCGACCAGGAGACCTGATGATTTTGACTCCCATACGACGATATGGGGCGATGATTCTTATGTTACTCACTCTGGTGTTTTCGAGTGAGGTGTTAGCGAAGACGCACACAACAACAGCGAGTCAAAAGTCCCACTTAACTAAAGCTAGTAATAA > NC_007779/3903174‑3903374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |