Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_007779 1,170,573 C→T 100% intergenic (‑164/‑77) ycfQ ← / → ycfR DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein

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  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_0077791,170,5730C→T100.0% 1062.0 256intergenic (‑164/‑77)ycfQ/ycfRDNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein
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                                                                                   atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc              <  1:1968164/101‑1 (MQ=255)
                                                                                    tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg             >  1:1246367/1‑101 (MQ=255)
                                                                                    tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg             >  1:7890647/1‑101 (MQ=255)
                                                                                    tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg             <  1:6332673/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt            <  1:478421/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt            >  1:1488007/1‑101 (MQ=255)
                                                                                        gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa         >  1:3142041/1‑101 (MQ=255)
                                                                                        gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa         <  1:8525429/101‑1 (MQ=255)
                                                                                        gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa         >  1:2236662/1‑101 (MQ=255)
                                                                                         tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa        >  1:6259524/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa       >  1:8407807/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa       >  1:12894962/1‑101 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc      >  1:3327926/1‑101 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc      <  1:8230293/101‑1 (MQ=255)
                                                                                            gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc     <  1:12749516/101‑1 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    <  1:8665875/101‑1 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    >  1:1139437/1‑101 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    >  1:9858016/1‑101 (MQ=255)
                                                                                              gATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCt   >  1:2734004/1‑101 (MQ=255)
                                                                                               aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc  <  1:4009545/101‑1 (MQ=255)
                                                                                                  |                                                                                                 
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC  >  NC_007779/1170475‑1170670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.