Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,303,904 | A→G | 6.7% | N337D (AAC→GAC) | oppA → | oligopeptide transporter subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,303,904 | 0 | A→G | 6.7% | 43.5 0.0 ‑0.2 | 268 | N337D (AAC→GAC) | oppA | oligopeptide transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/9): ref base (128/122): total (137/131) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.89e-01 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
TAACAACCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGC > NC_007779/1303804‑1304004 | tAACAACCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAGACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCa > 1:10855853/1‑101 (MQ=255) tAACAACCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCa < 1:5399102/101‑1 (MQ=255) caacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACa > 1:912809/1‑101 (MQ=255) caacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACa > 1:8156190/1‑101 (MQ=255) aacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACAt < 1:7554511/101‑1 (MQ=255) aacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACAt > 1:10325621/1‑101 (MQ=255) aacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACAt > 1:1504034/1‑101 (MQ=255) aacCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACAt > 1:10830245/1‑101 (MQ=255) acCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATg > 1:13007896/1‑101 (MQ=255) ccAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGc > 1:6335433/1‑101 (MQ=255) cAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGcc > 1:13115871/1‑101 (MQ=255) aGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGccc < 1:7685280/101‑1 (MQ=255) aGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGccc > 1:7845238/1‑101 (MQ=255) aGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGccc < 1:2800930/101‑1 (MQ=255) aaCCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGcc > 1:12090365/1‑101 (MQ=255) aCCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTCCCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGCCAACATGCCCGCCt < 1:41576/101‑1 (MQ=255) aCCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCt < 1:2176938/101‑1 (MQ=255) ccGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTa < 1:6506441/101‑1 (MQ=255) ccATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATgg < 1:4570984/101‑1 (MQ=255) ccATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCACACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATgg < 1:9465770/101‑1 (MQ=255) cATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCTATGGt < 1:10967724/101‑1 (MQ=255) aTTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGtt > 1:12825249/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGtt > 1:10101244/1‑101 (MQ=255) aTTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGtt > 1:7995180/1‑101 (MQ=255) ttCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTa < 1:4979237/101‑1 (MQ=255) cAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTaca > 1:12878118/1‑101 (MQ=255) aaCGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGTACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTacac > 1:3488348/1‑101 (MQ=255) aaCGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTacac > 1:10030291/1‑101 (MQ=255) aCGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACt > 1:9768480/1‑101 (MQ=255) cGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCTATGGTTACACTc < 1:298594/101‑1 (MQ=255) gtgcgtgtgcgtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCAcc < 1:4677927/101‑1 (MQ=255) cgtgtgcgtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGta < 1:653497/101‑1 (MQ=255) gtgtgcgtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGtat < 1:3852001/101‑1 (MQ=255) gtgtgcgtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGtat < 1:1627959/101‑1 (MQ=255) gcgtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTg < 1:11412790/101‑1 (MQ=255) gtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGAt < 1:1934952/101‑1 (MQ=255) gtACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGAt < 1:6636704/101‑1 (MQ=255) tACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATg < 1:10400917/101‑1 (MQ=255) cGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGgcg < 1:8986726/101‑1 (MQ=255) gCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGgcgc > 1:5895891/1‑101 (MQ=255) aCTGAAACTAGGTATGGCCCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCaa < 1:2529221/101‑1 (MQ=255) tGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCaaaa > 1:324563/1‑101 (MQ=255) aaaCTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAAtt < 1:6895492/101‑1 (MQ=255) cTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGAc > 1:5098970/1‑101 (MQ=255) ggTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCa > 1:11746480/1‑101 (MQ=255) gTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAg > 1:4283720/1‑101 (MQ=255) gTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAg < 1:3910438/101‑1 (MQ=255) gTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAg < 1:3391270/101‑1 (MQ=255) tATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGc > 1:5581396/1‑101 (MQ=255) tATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGc > 1:12409648/1‑101 (MQ=255) tGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCa < 1:3576361/101‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGa < 1:2760672/101‑1 (MQ=255) aCCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGaa > 1:9224051/1‑101 (MQ=255) cgcgATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATg < 1:10508317/101‑1 (MQ=255) gcgATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATgg < 1:1669169/101‑1 (MQ=255) cgATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGt > 1:4956577/1‑101 (MQ=255) atatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGttt > 1:8951612/1‑101 (MQ=255) atatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGttt < 1:4368973/101‑1 (MQ=255) atatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGttt > 1:11024820/1‑101 (MQ=255) atatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGttt < 1:11662524/101‑1 (MQ=255) tatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCGACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTg < 1:6103322/101‑1 (MQ=255) tatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTg > 1:11932932/1‑101 (MQ=255) tatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTg < 1:8737685/101‑1 (MQ=255) tatCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTg > 1:8561881/1‑101 (MQ=255) cATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCt > 1:6296203/1‑101 (MQ=255) cATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCt < 1:4997908/101‑1 (MQ=255) cATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCt < 1:12586811/101‑1 (MQ=255) ttGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTgg < 1:11530678/101‑1 (MQ=255) tGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGa > 1:5912951/1‑101 (MQ=255) aataaAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCa < 1:710639/101‑1 (MQ=255) ataaAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAg < 1:12626944/101‑1 (MQ=255) ataaAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAg > 1:1809789/1‑101 (MQ=255) taaAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAgg > 1:3754501/1‑101 (MQ=255) aaGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGaa < 1:12172919/101‑1 (MQ=255) aGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGaaa < 1:3365400/101‑1 (MQ=255) gTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGaaaa < 1:12310697/101‑1 (MQ=255) tGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGaaaaa < 1:7583871/101‑1 (MQ=255) aaaGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACg > 1:4518366/1‑101 (MQ=255) aaaGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACg < 1:12919678/101‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGt > 1:12024531/1‑101 (MQ=255) aaGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGt < 1:4041901/101‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGt < 1:1362823/101‑1 (MQ=255) aGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTa < 1:8392187/101‑1 (MQ=255) aGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTa > 1:9260559/1‑101 (MQ=255) aGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTa > 1:9642397/1‑101 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg > 1:9917466/1‑101 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg < 1:698976/101‑1 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg > 1:4933129/1‑101 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg > 1:2938074/1‑101 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg < 1:2139631/101‑1 (MQ=255) gcAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACg > 1:10683006/1‑101 (MQ=255) aGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACgaa > 1:5970155/1‑101 (MQ=255) gggCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACgaag > 1:3631748/1‑101 (MQ=255) gCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACgaagaa < 1:6876580/101‑1 (MQ=255) gCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACgaagaa < 1:4895351/101‑1 (MQ=255) cAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGaagaag < 1:421050/101‑1 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGc > 1:7432077/1‑101 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGc > 1:7347530/1‑101 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGc < 1:8726045/101‑1 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGc > 1:4142723/1‑101 (MQ=255) | TAACAACCAGAAACCGCCATTCAACGATGTGCGTGTGCGTACCGCACTGAAACTAGGTATGGACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCCACCGTATACTGATGGCGCAAAATTGACTCAGCCAGAATGGTTTGGCTGGAGCCAGGAAAAACGTAACGAAGAAGC > NC_007779/1303804‑1304004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |