New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 608570 | NA (NA) | 177 (0.970) | 110/174 | NT | 93.8% | intergenic (+170/+112) | insL/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
? | NC_007779 | 1305025 = | 12 (0.060) | coding (413/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/608471‑608570 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAA > NC_007779/1305025‑1305127 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:3483077/101‑1 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:8519666/101‑1 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:2448759/1‑101 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:4015098/101‑1 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:491408/1‑101 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCACATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:6735495/101‑1 CAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 1:5639944/1‑101 AGCCTACAAAACGCAATTGACGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:1371812/101‑1 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:5587965/101‑1 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:7884751/1‑101 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTG > 1:4246866/1‑101 TACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGT > 1:8939934/1‑101 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTA > 1:5990658/1‑101 AAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTCATGGGTTGTTAT > 1:3349893/1‑101 ACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCC > 1:1323918/1‑101 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCC < 1:2410548/101‑1 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCTGATGGCTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTCTTATCCCCA > 1:7069772/1‑101 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCA > 1:4355350/1‑101 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCA > 1:156091/1‑101 CAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAG < 1:6143154/101‑1 AATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGT < 1:8898442/101‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTT > 1:190834/1‑101 TGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTT < 1:4425999/101‑1 TGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTT < 1:3265043/101‑1 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTG < 1:4093726/101‑1 GAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTG > 1:1458864/1‑101 AAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGT > 1:2749181/1‑101 GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGG < 1:6967266/101‑1 AACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGT > 1:2574970/1‑101 ACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTT < 1:1958531/101‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGC < 1:3555715/101‑1 CGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCA < 1:2968395/101‑1 CGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCA < 1:8032530/101‑1 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCTCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAC > 1:4030432/1‑101 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAC > 1:6251379/1‑101 AGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACC > 1:5937239/1‑101 AGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACC < 1:4027388/101‑1 GGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCA > 1:6496562/1‑101 CATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATT < 1:1945682/101‑1 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTA < 1:7586660/101‑1 TCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTAT > 1:1093734/1‑101 CGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTGTT < 1:7468380/101‑1 GTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTA < 1:3992602/101‑1 GTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTA < 1:9367357/101‑1 TCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAG < 1:780537/101‑1 TCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAG > 1:2581903/1‑101 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCA < 1:416264/101‑1 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCA < 1:4308464/101‑1 TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCA < 1:6771993/101‑1 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT > 1:1808932/1‑101 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT > 1:8922390/1‑101 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT < 1:4952457/101‑1 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT > 1:915335/1‑101 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAGGGGTTGTTATCCCAAGTTTGGTGGTTGCACCATTATTAGTCAg > 1:294823/1‑100 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGAT > 1:9543028/1‑101 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGCCATGAT > 1:1296670/1‑101 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATA > 1:7413439/1‑101 GGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAT > 1:5285221/1‑101 GGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAT < 1:4544304/101‑1 CACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTT < 1:4607462/101‑1 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TCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTT < 1:6098239/101‑1 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTT > 1:8475210/1‑101 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTT > 1:1699011/1‑101 CGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTT > 1:6055426/1‑101 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACTATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTG > 1:8674354/1‑101 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTG > 1:2243808/1‑101 GCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTG < 1:3757630/101‑1 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGC > 1:8952111/1‑101 TCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATT < 1:7191228/101‑1 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTG > 1:8436487/1‑101 AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTG < 1:9105001/101‑1 GTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGG > 1:2897012/1‑101 TTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGC < 1:2656757/101‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGT > 1:1626303/1‑101 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGT < 1:8595956/101‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGT < 1:8489494/101‑1 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ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/608471‑608570 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAA > NC_007779/1305025‑1305127 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |