New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1980095 | 0 (0.000) | 189 (1.010) | 118/178 | NT | 100% | intergenic (‑175/+260) | flhD/insH | DNA‑binding transcriptional dual regulator/IS5 element protein |
? | NC_007779 | 2176984 = | NA (NA) | intergenic (‑283/‑67) | gatB/insH | PTS system galactitol‑specific transporter subunit IIB/IS5 element protein |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1979995‑1980095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > NC_007779/2176984‑2177083 AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG < 1:2039428/101‑1 ATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGG > 1:8155931/1‑101 ATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGG < 1:5269017/101‑1 ATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGG > 1:2373255/1‑101 TTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGA < 1:5554132/101‑1 TAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAA > 1:2982645/1‑101 TAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAA < 1:1928609/101‑1 CATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGT > 1:8737044/1‑101 ATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTG > 1:8264062/1‑101 TTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGC < 1:4588523/101‑1 TAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCG < 1:778394/101‑1 GAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAA < 1:2390759/101‑1 AATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAAC < 1:6061568/101‑1 TAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAA > 1:6366670/1‑101 AGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAG > 1:2901386/1‑101 TTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTC > 1:3093026/1‑101 GCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTAGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGCCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCC > 1:4987280/1‑101 CGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCT > 1:8133193/1‑101 CGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCT < 1:8780647/101‑1 GATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG > 1:2275481/1‑101 GATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG > 1:2656093/1‑101 GATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG < 1:446452/101‑1 ATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGA < 1:9097348/101‑1 ATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGA > 1:3047565/1‑101 AAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATA < 1:4530077/101‑1 AGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATAT < 1:8810036/101‑1 AGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATAT > 1:9668963/1‑101 GCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATG > 1:9149545/1‑101 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA > 1:7235623/1‑101 GCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA < 1:6830835/101‑1 CAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAT < 1:4773437/101‑1 AATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATC < 1:943754/101‑1 ATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCA > 1:8905676/1‑101 AAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATG > 1:5410149/1‑101 CAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTT < 1:7962056/101‑1 AACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTC < 1:3559986/101‑1 AACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTC < 1:5543585/101‑1 ACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCA > 1:9051380/1‑101 ACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCA > 1:8321932/1‑101 CACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC < 1:105485/101‑1 CACCTTTTTGGTTTAATAGGTCC‑TACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCT < 1:3971954/101‑1 TTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGA < 1:1376481/101‑1 TTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG < 1:8401181/101‑1 TTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGC < 1:1001115/101‑1 TTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCC > 1:5844146/1‑101 TTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCC > 1:8987138/1‑101 TGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCA > 1:5602723/1‑101 GGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCAT > 1:2860374/1‑101 GGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCAT > 1:4153292/1‑101 GTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATA > 1:1362881/1‑101 GTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATA > 1:7664723/1‑101 GTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATA < 1:1486753/101‑1 TTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA > 1:7475789/1‑101 TTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA < 1:3800803/101‑1 TAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAA < 1:5780744/101‑1 TAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAA > 1:2007566/1‑101 ATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA < 1:7367570/101‑1 ATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA > 1:6296652/1‑101 TATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAG > 1:7191367/1‑101 TATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAG > 1:9326771/1‑101 TGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGG > 1:507294/1‑101 TGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGG > 1:9115395/1‑101 CCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTC < 1:1571287/101‑1 CCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTC > 1:4437867/1‑101 TTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT < 1:5894640/101‑1 ACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCA > 1:1172576/1‑101 ACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCA < 1:3787455/101‑1 CAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT < 1:8554086/101‑1 AAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGACCAGGGTTCATCATG > 1:7070485/1‑101 AAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATG < 1:2487849/101‑1 AAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATG < 1:1695903/101‑1 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAG < 1:2177924/101‑1 TAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGGGCGAACAAGTCCCTGAAATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGT > 1:3067494/1‑101 GAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCA < 1:3170600/101‑1 AAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCAT < 1:3451852/101‑1 AAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCAT > 1:7047968/1‑101 AATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATC > 1:1859205/1‑101 ATGGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCA > 1:5987261/1‑101 GGGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAAC < 1:9591606/101‑1 GGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACT < 1:6954858/101‑1 GGTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACT > 1:363401/1‑101 GTCTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACGAGTCCCTGATATGATATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTT < 1:8666214/101‑1 CTTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTAC > 1:3318647/1‑101 TTTACACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACC < 1:7760742/101‑1 CACTTATCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCG < 1:3519221/101‑1 GGAAGGTTCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:5175731/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGGCAGTGAA > 1:79138/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:1749991/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:6657764/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:9215495/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:337513/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:6718604/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:1966785/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:394876/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:2606495/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:2528877/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:4633353/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > 1:4916515/1‑101 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:565943/101‑1 GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA < 1:5293681/101‑1 AATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1979995‑1980095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAA > NC_007779/2176984‑2177083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |