| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4355066 | 8 (0.040) | 191 (1.040) | 115/176 | NT | 96.1% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < NC_007779/4504189‑4504090 AATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGG < 1:7506051/101‑1 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:6445994/101‑1 CGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTG < 1:4048177/101‑1 CCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCC < 1:2296895/101‑1 GGGTTCCGGCCCTGATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTAT > 1:6581835/1‑101 GGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTAT > 1:2048490/1‑101 GGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGGGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATA < 1:7076981/101‑1 TCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTT < 1:4091401/101‑1 CCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTC > 1:5004354/1‑101 CCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTC > 1:5074053/1‑101 CCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:9234272/1‑101 CCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA > 1:7598352/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:5617677/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:6065145/1‑101 AATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGGGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC > 1:3542288/1‑101 AATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:2153456/101‑1 ATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 1:3581118/101‑1 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG > 1:8079867/1‑101 CCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTT < 1:1002837/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:344293/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:9080628/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:84975/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:3026284/101‑1 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:5747979/1‑101 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:5785421/1‑101 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC < 1:1204621/101‑1 GCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 1:572322/1‑101 GCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 1:1831947/1‑101 CGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:2387363/101‑1 GTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCATCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACGTCTGTTATCACTTAAC > 1:2867486/1‑101 GTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:3333077/1‑101 GTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC < 1:7434192/101‑1 CTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:4568019/1‑101 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:9600947/1‑101 TCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACA > 1:4599664/1‑101 CAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA > 1:1781606/1‑101 CAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 1:5503809/101‑1 AGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGGCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:4825889/1‑101 TTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 1:1056788/1‑101 TTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCC > 1:2737610/1‑101 CCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG < 1:1637149/101‑1 CGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC > 1:1372817/1‑101 GTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCA < 1:2068649/101‑1 TAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA < 1:1523338/101‑1 TAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA > 1:2991715/1‑101 AATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 1:7347570/1‑101 AATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT < 1:1124174/101‑1 AATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAT > 1:8824287/1‑101 AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC > 1:8166414/1‑101 AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC < 1:1562134/101‑1 AGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCC < 1:4713999/101‑1 GTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCGGATATTCCCGTG > 1:3105230/1‑101 CGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:62771/1‑101 CGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:360364/1‑101 CGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:5481579/1‑101 GCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG > 1:5208485/1‑101 CGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA < 1:9296243/101‑1 GACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 1:9473594/1‑101 GACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 1:1949441/1‑101 ACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC < 1:266702/101‑1 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gCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 1:3860534/100‑1 CCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 1:2185615/1‑101 CCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 1:8696676/101‑1 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 1:1308582/1‑101 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 1:9731304/101‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 1:7970479/101‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 1:8314309/101‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT > 1:8365337/1‑101 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 1:6987971/101‑1 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGCCGAGCGATAACCCACCGAACTAT > 1:315045/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCGGCTGCCGCAGATATGCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:8656144/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG < 1:10980/101‑1 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG < 1:2523566/101‑1 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG < 1:2788844/101‑1 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:9150487/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG < 1:3765120/101‑1 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:8965065/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:417160/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:4372249/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:4875744/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:5999307/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG < 1:7830323/101‑1 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:6480184/1‑101 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:7553955/1‑101 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CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < NC_007779/4504189‑4504090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |