| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 2,005,401 | C→T | 100% | E115K (GAA→AAA) | fliC ← | flagellar filament structural protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 2,005,401 | 0 | C→T | 100.0% | 831.6 | 212 | E115K (GAA→AAA) | fliC | flagellar filament structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (106/104): ref base (0/1): total (106/106) | ||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CTGGATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTCGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGAC > NC_007779/2005303‑2005498 | cTGGATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGt > 1:3091811/1‑101 (MQ=255) tGGATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTc > 1:7011523/1‑101 (MQ=255) tGGATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGACGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTc < 1:7327022/101‑1 (MQ=255) ggATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTcc < 1:832416/101‑1 (MQ=255) ggATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTcc > 1:7525846/1‑101 (MQ=255) gATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCt > 1:9687389/1‑101 (MQ=255) aTTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTg > 1:9457038/1‑101 (MQ=255) tttCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGa < 1:8546649/101‑1 (MQ=255) ttCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGAt > 1:5163054/1‑101 (MQ=255) tCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTAACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATa < 1:3385055/101‑1 (MQ=255) cATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATag < 1:4874575/101‑1 (MQ=255) tGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATagaa > 1:6398402/1‑101 (MQ=255) tGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATagaa < 1:6748101/101‑1 (MQ=255) ggAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATagaag > 1:4096312/1‑101 (MQ=255) ggAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATagaag < 1:5076319/101‑1 (MQ=255) aGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGAc > 1:5463595/1‑101 (MQ=255) gCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACa > 1:3180268/1‑101 (MQ=255) gCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACa < 1:6766897/101‑1 (MQ=255) ccATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAg < 1:3056450/101‑1 (MQ=255) cATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCCGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGa > 1:5714171/1‑101 (MQ=255) cATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGa > 1:6821666/1‑101 (MQ=255) aTTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGAt > 1:4619504/1‑101 (MQ=255) aTTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGAt < 1:1573541/101‑1 (MQ=255) ttttttGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATc < 1:9059879/101‑1 (MQ=255) tttGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGa > 1:9378806/1‑101 (MQ=255) tttGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGa < 1:1996854/101‑1 (MQ=255) tGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACt > 1:3039302/1‑101 (MQ=255) tGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACt > 1:6090916/1‑101 (MQ=255) aGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCaga < 1:5155573/101‑1 (MQ=255) gCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCagag > 1:3704663/1‑101 (MQ=255) aCGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGtt < 1:4923474/101‑1 (MQ=255) ttCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGt < 1:2913211/101‑1 (MQ=255) ttCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGt > 1:7818612/1‑101 (MQ=255) tCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTa > 1:932411/1‑101 (MQ=255) cACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTAc < 1:1541805/101‑1 (MQ=255) cACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTAc > 1:165378/1‑101 (MQ=255) ccGCCGTTGAACTTGGTCTGACCAGATACGCTGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTAcc < 1:584512/100‑1 (MQ=255) gCCTTTGAAATGGGTCTTACCAGATACTCGGTTAATTTCATCCAAACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCgg < 1:3843168/101‑1 (MQ=255) gCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCgg > 1:9667989/1‑101 (MQ=255) cGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTa > 1:1061396/1‑101 (MQ=255) cGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTa > 1:3556211/1‑101 (MQ=255) tGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTg > 1:1266136/1‑101 (MQ=255) tGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTg < 1:1718384/101‑1 (MQ=255) gAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTgg > 1:9278455/1‑101 (MQ=255) gAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTgg > 1:2361912/1‑101 (MQ=255) cTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCt > 1:777525/1‑101 (MQ=255) tGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTg < 1:9682741/101‑1 (MQ=255) tGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTg > 1:8058673/1‑101 (MQ=255) ggTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGTTTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTa < 1:2858614/101‑1 (MQ=255) gTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTAc > 1:6613407/1‑101 (MQ=255) tCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTAcc < 1:1140344/101‑1 (MQ=255) cTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCg < 1:7957341/101‑1 (MQ=255) gACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTc < 1:2392761/101‑1 (MQ=255) gACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTc > 1:1808203/1‑101 (MQ=255) aCCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCa < 1:8690863/101‑1 (MQ=255) aCCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCa < 1:2544338/101‑1 (MQ=255) aGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGtt < 1:3989813/101‑1 (MQ=255) aGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGtt < 1:8489411/101‑1 (MQ=255) gATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTc < 1:2219158/101‑1 (MQ=255) gATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTc < 1:5568730/101‑1 (MQ=255) tACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCAc < 1:2000165/101‑1 (MQ=255) tACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCAc < 1:1841297/101‑1 (MQ=255) gcgGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGca < 1:2977343/101‑1 (MQ=255) gcgGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGca < 1:6346774/101‑1 (MQ=255) ggTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGcaca > 1:8943444/1‑101 (MQ=255) gTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTAACGCacac > 1:2765408/1‑101 (MQ=255) gTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTAGTCCTGGATATAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCacac < 1:2464951/101‑1 (MQ=255) aaTTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTCGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACACACACGCt > 1:2041773/1‑101 (MQ=255) aaTTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACgat < 1:4798270/101‑3 (MQ=255) aTTTCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTg < 1:7020158/101‑1 (MQ=255) tttCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGt < 1:2294309/101‑1 (MQ=255) tttCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGt > 1:2936072/1‑101 (MQ=255) tttCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGt > 1:4363176/1‑101 (MQ=255) tttCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGt < 1:2637957/101‑1 (MQ=255) tCATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTaa > 1:3807312/1‑101 (MQ=255) cATCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAg < 1:7393942/101‑1 (MQ=255) tCCAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAgtt < 1:3144874/101‑1 (MQ=255) ccAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAgttg > 1:2708390/1‑101 (MQ=255) cAGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGACTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAgttgt > 1:543003/1‑101 (MQ=255) aGACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAgttgtt > 1:6116268/1‑101 (MQ=255) gACGGGATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAgttgttg < 1:4927108/101‑1 (MQ=255) gggATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGttgttgttg > 1:8866993/1‑101 (MQ=255) gggATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGttgttgttg > 1:4389216/1‑101 (MQ=255) ggATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACTGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGa > 1:1923590/1‑101 (MQ=255) ggATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGa < 1:2097099/101‑1 (MQ=255) gATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAt > 1:7650991/1‑101 (MQ=255) gATTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAt > 1:6143718/1‑101 (MQ=255) aTTTAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAtt < 1:7706351/101‑1 (MQ=255) tttAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAttt > 1:5059740/1‑101 (MQ=255) tttAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAttt > 1:8259755/1‑101 (MQ=255) tttAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGAttt > 1:4640950/1‑101 (MQ=255) tAATTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCg < 1:950425/101‑1 (MQ=255) aaTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCgg > 1:1193359/1‑101 (MQ=255) aaTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCgg < 1:5682986/101‑1 (MQ=255) aaTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCgg < 1:1073592/101‑1 (MQ=255) aTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGa < 1:4242053/101‑1 (MQ=255) aTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGa < 1:1421166/101‑1 (MQ=255) aTTTTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGa > 1:348851/1‑101 (MQ=255) tttTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGAc > 1:4716759/1‑101 (MQ=255) tttTGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGAc > 1:3574078/1‑101 (MQ=255) | CTGGATTTTCATGGAGCCATTTTTTGCCAGCACGTTCACGCCGTTGAACTGGGTCTGACCAGATACGCGGTCAATTTCATCCAGACGGGATTTAATTTCGTCCTGGATAGAAGACAGATCAGACTCAGAGTTAGTACCGGTAGTGGCCTGTACCGTCAGTTCACGCACACGCTGTAAGTTGTTGTTGATTTCGGAC > NC_007779/2005303‑2005498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |