| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,056 | C→A | 23.6% | A426S (GCA→TCA) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,056 | 0 | C→A | 23.6% | 159.3 ‑0.8 ‑1.9 | 233 | A426S (GCA→TCA) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/28): ref base (100/78): total (127/106) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.39e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.33e-02 | ||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAATG > NC_007779/3449956‑3450153 | gCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGc < 1:9645551/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc > 1:5807318/1‑101 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt > 1:8860742/1‑101 (MQ=255) atGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTc > 1:5157714/1‑101 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcag < 1:1866208/101‑1 (MQ=255) gCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGGTcag < 1:3283582/101‑1 (MQ=255) ccGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagc > 1:3775787/1‑101 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:1064282/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca > 1:9320046/1‑101 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca > 1:3674724/1‑101 (MQ=255) caAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTAc > 1:4932317/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:2564833/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc < 1:3706928/101‑1 (MQ=255) ccAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCggg < 1:1832003/101‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt > 1:1305161/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:1669288/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:5781919/1‑101 (MQ=255) gCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtgt > 1:4404683/1‑101 (MQ=255) cGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt < 1:7997131/101‑1 (MQ=255) cGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGtt > 1:1007959/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg > 1:5546564/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg > 1:9020894/1‑101 (MQ=255) gTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgc < 1:8523408/101‑1 (MQ=255) gCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCgg > 1:9383359/1‑101 (MQ=255) cAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGa < 1:8189082/101‑1 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:3019290/1‑101 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt > 1:5445224/1‑101 (MQ=255) aGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGAt < 1:7951987/101‑1 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTTCCTTCGATCAGTACAGGTTCAAATGCCTGGATGCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:3859046/101‑1 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:4740110/101‑1 (MQ=255) gATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt > 1:7353767/1‑101 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc < 1:6722112/101‑1 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc > 1:7171833/1‑101 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa < 1:7308980/101‑1 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa > 1:1506137/1‑101 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa > 1:3169837/1‑101 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg > 1:169751/1‑101 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:8908533/101‑1 (MQ=255) ccTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGat > 1:5689798/1‑101 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:2914026/101‑1 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata < 1:6866164/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:8446176/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat > 1:7687932/1‑101 (MQ=255) tCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATc > 1:8415809/1‑101 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:960625/1‑101 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:3372073/1‑101 (MQ=255) cGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGCGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATcc > 1:4792941/1‑101 (MQ=255) gATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc < 1:3991039/101‑1 (MQ=255) gATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc > 1:570464/1‑101 (MQ=255) aTCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCa > 1:1637830/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:2378324/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:5047047/1‑101 (MQ=255) tACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGa > 1:2416353/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAc > 1:5474208/1‑101 (MQ=255) aCCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAc < 1:1736291/101‑1 (MQ=255) ccGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACa > 1:6032840/1‑101 (MQ=255) ggTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGc > 1:4993002/1‑101 (MQ=255) gTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGct > 1:8626091/1‑101 (MQ=255) gTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGGGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCATTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGct > 1:1165347/1‑101 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTACACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt < 1:6190212/101‑1 (MQ=255) tCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttt > 1:2259379/1‑100 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGTTGTTCGCGGATAACATCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt > 1:6916426/1‑101 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt > 1:3115817/1‑101 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt < 1:8934631/101‑1 (MQ=255) aaTGCCTGGATACCGAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCttcttc > 1:1374486/1‑101 (MQ=255) aaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCttcttc < 1:8293418/101‑1 (MQ=255) aaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCttcttc < 1:1211527/101‑1 (MQ=255) aaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCttcttc < 1:2147200/101‑1 (MQ=255) aTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGTGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcg < 1:4044689/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc < 1:8719507/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc < 1:6281741/101‑1 (MQ=255) gCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgcg < 1:8095440/101‑1 (MQ=255) ccTGGATGCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCgcgc < 1:29026/101‑1 (MQ=255) ccTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCgcgc > 1:7233073/1‑101 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc > 1:4163697/1‑101 (MQ=255) gATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGCTATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCaa < 1:9304673/101‑1 (MQ=255) tACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAAcc > 1:7870119/1‑101 (MQ=255) aCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCTGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCa < 1:8602760/101‑1 (MQ=255) aCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCa > 1:239571/1‑101 (MQ=255) cccAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAt > 1:2675722/1‑101 (MQ=255) ccAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtt < 1:5336272/101‑1 (MQ=255) cAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAttt < 1:3077492/101‑1 (MQ=255) aGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCAtttt < 1:945211/101‑1 (MQ=255) gACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttc < 1:4306568/101‑1 (MQ=255) aCGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttct < 1:4629130/101‑1 (MQ=255) cGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttctt > 1:5967585/1‑101 (MQ=255) cGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttctt < 1:9260078/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGAGTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttcttc > 1:1563510/1‑101 (MQ=255) tGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGc > 1:6624052/1‑101 (MQ=255) tGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGAAAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTttcttaga > 1:342972/1‑98 (MQ=255) gCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCa < 1:2067329/101‑1 (MQ=255) agagTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGc < 1:5892192/101‑1 (MQ=255) gagTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCt < 1:394435/101‑1 (MQ=255) gagTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCt > 1:56017/1‑101 (MQ=255) agTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCtt > 1:639571/1‑101 (MQ=255) gTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCttt < 1:5221518/101‑1 (MQ=255) gTCGGTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCttt > 1:7752646/1‑101 (MQ=255) ggTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAt > 1:2076508/1‑101 (MQ=255) ggTGAACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAt < 1:7396295/101‑1 (MQ=255) gTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGGCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAAtg > 1:1997572/1‑101 (MQ=255) | GCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAACCATTTTCTTCGCAGCTTTAATG > NC_007779/3449956‑3450153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |