New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | 262 (1.020) | 135/180 | NT | 95.6% | intergenic (‑147/+15) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
? | NC_007779 | = 2985055 | 12 (0.050) | coding (553/1230 nt) | yqeG | transporter |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 | acacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCgg < 1:3342721/101‑1 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGt < 1:12449350/101‑1 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGt < 1:12825211/101‑1 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGt < 1:11945772/101‑1 (MQ=255) cacacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGt > 1:2202791/1‑101 (MQ=255) acacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTa > 1:8953/1‑101 (MQ=255) caaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATg < 1:6824294/101‑1 (MQ=255) aaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGa > 1:7733116/1‑101 (MQ=255) aaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGa < 1:3723203/101‑1 (MQ=255) caaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTc > 1:12511299/1‑101 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTcc < 1:9699596/101‑1 (MQ=255) aaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTcc < 1:3550819/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:6868576/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa > 1:8685517/1‑101 (MQ=255) gCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCaa < 1:9870600/101‑1 (MQ=255) cAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAAc < 1:7600458/101‑1 (MQ=255) aaTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACt < 1:519214/101‑1 (MQ=255) aTTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACtt < 1:1001746/101‑1 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:10975256/101‑1 (MQ=255) tCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:8227261/101‑1 (MQ=255) ccATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:9937532/101‑1 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:4574943/101‑1 (MQ=255) cATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTg > 1:4026551/1‑101 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 1:1452387/101‑1 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:563880/1‑101 (MQ=255) tGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:10045185/1‑101 (MQ=255) tGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:1218282/1‑101 (MQ=255) tGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:626707/1‑101 (MQ=255) gTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt > 1:8585864/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg > 1:11224689/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg > 1:7353198/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg > 1:10682363/1‑101 (MQ=255) aTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt < 1:11525567/101‑1 (MQ=255) aTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt > 1:162546/1‑101 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:6999229/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:5459924/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt < 1:6757798/101‑1 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt > 1:10520011/1‑101 (MQ=255) cTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGt > 1:11407183/1‑101 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 1:12785020/1‑101 (MQ=255) cccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCTGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 1:9463856/1‑101 (MQ=255) ccgggCAG‑TTCATCCGGAAACCGGGCCGAAATAAAAATGCCTAAGGAGTGCCCTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:7442297/98‑1 (MQ=12) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:12692039/101‑1 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa > 1:301019/1‑101 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg > 1:5767815/1‑101 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:6009606/101‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg > 1:11705486/1‑101 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:10901372/101‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:5155283/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:8502791/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:8455077/101‑1 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:12307547/101‑1 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 1:4333835/1‑101 (MQ=255) cAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:8099116/1‑101 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:5508830/101‑1 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc < 1:8811825/101‑1 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGCTCAGATAATGCCCg < 1:6697663/101‑1 (MQ=255) ggAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc > 1:2503168/1‑101 (MQ=255) aaCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 1:5343409/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:3630233/1‑101 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 1:8261490/101‑1 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:4127748/101‑1 (MQ=255) ccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:9156650/1‑101 (MQ=255) cGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc > 1:4779695/1‑101 (MQ=255) ggACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa < 1:469390/101‑1 (MQ=255) ggACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa < 1:6932895/101‑1 (MQ=255) aCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:11327045/101‑1 (MQ=255) aCGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg > 1:3261467/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:1711729/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:10149659/1‑101 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa < 1:10347574/101‑1 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:6204143/1‑101 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg < 1:10737177/101‑1 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:10076777/1‑101 (MQ=255) aaaaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCa < 1:12958254/101‑1 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc < 1:2673072/101‑1 (MQ=255) tGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt > 1:12102292/1‑101 (MQ=255) tGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt > 1:9603972/1‑101 (MQ=255) tGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt < 1:654173/101‑1 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt < 1:8045990/101‑1 (MQ=255) tatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 1:2589286/101‑1 (MQ=255) atGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:2369565/1‑101 (MQ=255) tGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgag > 1:8629439/1‑101 (MQ=255) gAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgaga > 1:6386640/1‑101 (MQ=255) aGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 1:24736/1‑101 (MQ=255) ttGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg > 1:1974643/1‑101 (MQ=255) tGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:1361300/1‑101 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc < 1:4223874/101‑1 (MQ=255) gCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc > 1:4896342/1‑101 (MQ=255) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGCCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:3154769/101‑1 (MQ=255) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 1:3101042/101‑1 (MQ=39) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 1:11165627/101‑1 (MQ=39) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc > 1:4403162/1‑101 (MQ=39) tAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg < 1:11840127/101‑1 (MQ=38) aaaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa < 1:9376267/101‑1 (MQ=37) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 1:3086893/1‑101 (MQ=35) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt > 1:1766466/1‑101 (MQ=33) aaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt < 1:3197320/101‑1 (MQ=33) gCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCg < 1:9526188/101‑1 (MQ=11) gCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCg < 1:12407884/101‑1 (MQ=11) | CACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_007779/2411358‑2411556 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |