Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,546,535 | T→A | 100% | intergenic (+296/‑182) | fimB → / → fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,546,535 | 0 | T→A | 100.0% | 892.2 | 212 | intergenic (+296/‑182) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (144/68): ref base (0/0): total (144/68) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 | tACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaaaca > 1:12733035/1‑101 (MQ=255) tACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaaaca < 1:7767789/101‑1 (MQ=255) cacaTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAAt > 1:6874669/1‑101 (MQ=255) cacaTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAAt < 1:12502335/101‑1 (MQ=255) acaTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATg > 1:9375281/1‑101 (MQ=255) caTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGa > 1:8862306/1‑101 (MQ=255) caTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGa < 1:5072618/101‑1 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:10216482/101‑1 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa > 1:9792814/1‑101 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:7316201/101‑1 (MQ=255) cACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaaa > 1:12369120/1‑101 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt > 1:2299108/1‑101 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt > 1:6903124/1‑101 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt < 1:8724558/101‑1 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg < 1:11097259/101‑1 (MQ=255) ccTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTca > 1:1392014/1‑101 (MQ=255) ccTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTca > 1:5600571/1‑101 (MQ=255) ccTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTca > 1:8967869/1‑101 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa < 1:11580845/101‑1 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa > 1:5627366/1‑101 (MQ=255) tCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAg > 1:3897184/1‑101 (MQ=255) cGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTg < 1:7250929/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa > 1:10103533/1‑101 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat < 1:11237880/101‑1 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat < 1:9456203/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:1702343/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:6241386/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:7026113/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:7651907/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:9880964/101‑1 (MQ=255) tttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattt < 1:9149582/101‑1 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt < 1:6131771/101‑1 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt > 1:1905713/1‑101 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATATTGTCACATCAGTGAtatttt > 1:6374816/1‑101 (MQ=255) tttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttta > 1:2073435/1‑101 (MQ=255) tttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttta > 1:3156235/1‑101 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt > 1:6112299/1‑101 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt < 1:8030442/101‑1 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt > 1:9932795/1‑101 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTAttttt > 1:11637079/1‑101 (MQ=255) tATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTg > 1:11816940/1‑101 (MQ=255) aTTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGt > 1:8263615/1‑101 (MQ=255) ttttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTa > 1:7354368/1‑101 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATg > 1:12072917/1‑101 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATg > 1:12797373/1‑101 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATg > 1:5190486/1‑101 (MQ=255) ttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGat > 1:12806549/1‑101 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:4119158/1‑101 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:3752010/1‑101 (MQ=255) aaGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGatat > 1:12678164/1‑101 (MQ=255) aGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAtt < 1:8428734/101‑1 (MQ=255) aGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAtt > 1:12858033/1‑101 (MQ=255) cAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTa > 1:12010983/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:8708730/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:675475/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa < 1:10611390/101‑1 (MQ=255) aCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt < 1:8812280/101‑1 (MQ=255) cTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATg < 1:4107292/101‑1 (MQ=255) tGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGt > 1:7876525/1‑101 (MQ=255) gAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTaa < 1:756592/101‑1 (MQ=255) aaGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAt < 1:11936658/101‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGa > 1:1404968/1‑101 (MQ=255) aaTCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACt > 1:12461623/1‑101 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt > 1:8633432/1‑101 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt < 1:10680182/101‑1 (MQ=255) cACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa < 1:10728262/101‑1 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg > 1:10343964/1‑101 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg > 1:7080356/1‑101 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCca > 1:1854196/1‑101 (MQ=255) cAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcac > 1:3414799/1‑101 (MQ=255) aaTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcaca > 1:10899372/1‑101 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:11859665/101‑1 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:9637670/101‑1 (MQ=255) cTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCa > 1:5829923/1‑101 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGAGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc > 1:10235588/1‑101 (MQ=255) aTTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACt > 1:5950165/1‑101 (MQ=255) aTTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACt > 1:1659884/1‑101 (MQ=255) ttGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTc < 1:3612074/101‑1 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCg > 1:6722105/1‑101 (MQ=255) ttATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgt < 1:6151451/101‑1 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:6686130/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:6513953/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:1586012/1‑101 (MQ=255) atatTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgt > 1:4126990/1‑101 (MQ=255) tatTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg > 1:12870852/1‑101 (MQ=255) ttGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg > 1:11372985/1‑101 (MQ=255) tGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtgt > 1:4604420/1‑100 (MQ=255) tGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg > 1:2586307/1‑101 (MQ=255) tGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg > 1:12151504/1‑101 (MQ=255) gAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:3693919/101‑1 (MQ=255) gAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt > 1:4635998/1‑101 (MQ=255) gAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt < 1:7268785/101‑1 (MQ=255) aatcaaaacaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGtt < 1:11018308/101‑1 (MQ=255) atcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTa > 1:8591374/1‑101 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt < 1:497509/101‑1 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:5401273/1‑101 (MQ=255) caaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 1:4772504/1‑101 (MQ=255) caaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 1:2970402/1‑101 (MQ=255) aaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCt > 1:3764836/1‑101 (MQ=255) aaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCt < 1:9534332/101‑1 (MQ=255) | TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |