Predicted mutation | |||||||
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MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 307 [0] | [1] 310 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 269 (1.050) | 133/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
ATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3958021‑3958122 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATC > NC_007779/3958157‑3958256 ATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCT < 1:10294957/101‑1 ATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCT < 1:1212908/101‑1 CGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGT > 1:2806667/1‑101 gtaCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTC < 1:1706673/98‑1 TGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCG < 1:7512396/101‑1 CTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTT < 1:6969503/101‑1 TGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTG > 1:2250516/1‑101 TGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTG < 1:4705528/101‑1 TGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTG < 1:6727001/101‑1 GCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCT < 1:8497458/101‑1 GCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCT > 1:1224698/1‑101 CGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGACATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTA > 1:10350794/1‑101 GGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAA > 1:4035531/1‑101 GGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAA > 1:2585889/1‑101 GGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAA > 1:5955449/1‑101 GGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAA > 1:961156/1‑101 GCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAG < 1:3433206/101‑1 CGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGT > 1:6754400/1‑101 CGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGT < 1:5937356/101‑1 GACGGTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTG > 1:12481193/1‑101 GACGCTCTCTGCGGTGGGACATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTAAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTG > 1:238991/1‑101 GCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGT > 1:4889157/1‑101 CTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTG < 1:10396989/101‑1 CTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAA > 1:1473845/1‑101 CTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAA < 1:4622179/101‑1 TCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAA > 1:3215757/1‑101 CGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAAC < 1:12716003/101‑1 GGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGA > 1:6077120/1‑101 GGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGAC < 1:12358388/101‑1 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACC < 1:8049534/101‑1 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACC < 1:11675070/101‑1 ATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGGGGGTGAAAGAACTGGACCACA > 1:102601/1‑101 TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAA > 1:4380556/1‑101 TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAA < 1:6025583/101‑1 GTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTG > 1:4676529/1‑101 GTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTG < 1:1963929/101‑1 TAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGG > 1:8362846/1‑101 TAGCGGGTCTGGCGCTGATACTCGGTATCGACCGCTTGATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGG < 1:10081/101‑1 AGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGA < 1:1065786/101‑1 GCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGAC < 1:6266222/101‑1 GCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGAC < 1:12017619/101‑1 GCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGAC < 1:6131518/101‑1 CGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACG < 1:3726498/101‑1 GGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGA < 1:6569975/101‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |