New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1305036 | 7 (0.030) | 242 (0.950) | 130/172 | NT | 66.0% | coding (424/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
? | NC_007779 | 2519722 = | 242 (0.950) | intergenic (+32/‑55) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase |
Only 100 of 584 total aligned reads displayed.
CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > NC_007779/2519622‑2519821 | gtaatactgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccc < 1:2392251‑M2/1‑1 (MQ=255) taatactgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgcgactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCa < 1:11424658‑M2/2‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa > 1:3731203/1‑101 (MQ=255) aatactgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggagttgttatccCAt > 1:1342405‑M2/99‑101 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa < 1:7710799/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCAGTCTGCGTCAANCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa < 1:12929918/101‑1 (MQ=255) aGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATaa < 1:3327499/101‑1 (MQ=255) ctgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAgc < 1:2536299‑M2/7‑1 (MQ=255) tgggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAgcg > 1:6379566‑M2/94‑101 (MQ=255) tggtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactattccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAgcgc < 1:4566288‑M2/9‑1 (MQ=255) gTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:7773597/101‑1 (MQ=255) gtgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTa > 1:3992817‑M2/91‑101 (MQ=255) ttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTaa > 1:12807082/1‑101 (MQ=255) ttACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTaa > 1:12604682/1‑101 (MQ=255) tgttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTaa < 1:12112180‑M2/12‑1 (MQ=255) gttagtgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAAc > 1:6510131‑M2/89‑101 (MQ=255) ggCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTa > 1:9210004/1‑101 (MQ=255) tgctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAg > 1:11639361‑M2/84‑101 (MQ=255) gctggcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAgg > 1:6029430‑M2/83‑101 (MQ=255) tACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt > 1:7852655/1‑101 (MQ=255) aCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 1:5648946/101‑1 (MQ=255) gcgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtg > 1:1517457‑M2/79‑101 (MQ=255) cgttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctagcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 1:8224914‑M2/24‑1 (MQ=255) ccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 1:10550945/101‑1 (MQ=255) gttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg > 1:1817667‑M2/77‑101 (MQ=255) gttattgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg > 1:10968713‑M2/77‑101 (MQ=255) cTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 1:8802821/101‑1 (MQ=255) tGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTgg > 1:3403674/1‑101 (MQ=255) ggTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGt < 1:7197790/101‑1 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa > 1:738171/1‑101 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa < 1:10269606/101‑1 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTa > 1:6846757/1‑101 (MQ=255) ttgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt > 1:8377921‑M2/73‑101 (MQ=255) ttgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 1:2044310‑M2/29‑1 (MQ=255) tgccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt > 1:4761853‑M2/72‑101 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt < 1:8123472/101‑1 (MQ=255) gAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtt < 1:4098865/101‑1 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa < 1:2892499/101‑1 (MQ=255) ccgcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAc > 1:3525536‑M2/70‑101 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACg > 1:11559765/1‑101 (MQ=255) gcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc > 1:5542179‑M2/68‑101 (MQ=255) gcattaaaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc > 1:9782258‑M2/68‑101 (MQ=255) gCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCt > 1:696301/1‑101 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa < 1:231042/101‑1 (MQ=255) gTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGat < 1:7974896/101‑1 (MQ=255) aaacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata > 1:2675068‑M2/62‑101 (MQ=255) aacaaaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGatat < 1:1431251‑M2/41‑1 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg < 1:3897293/101‑1 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGa < 1:487250/101‑1 (MQ=255) aaacaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAtt < 1:6224837‑M2/45‑1 (MQ=255) acaccaaatgggactataccgtgatggggctggcaattaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTa < 1:221406‑M2/47‑1 (MQ=255) caccaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa > 1:1638337‑M2/54‑101 (MQ=255) aaTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa > 1:9346255/1‑101 (MQ=255) accaaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc < 1:10109390‑M2/49‑1 (MQ=255) ccaaatgggactataccgcgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACg < 1:4461627‑M2/50‑1 (MQ=255) caaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt > 1:11354874‑M2/51‑101 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt > 1:5917413/1‑101 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt < 1:515556/101‑1 (MQ=255) aaatgggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg > 1:3148440‑M2/50‑101 (MQ=255) cagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc > 1:5981462/1‑101 (MQ=255) ggactataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAt < 1:7050937‑M2/57‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGa > 1:10643024/1‑101 (MQ=255) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGa > 1:13170369/1‑101 (MQ=255) ctataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa > 1:7516119‑M2/42‑101 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt < 1:4161112/101‑1 (MQ=255) ataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt > 1:6072645‑M2/40‑101 (MQ=255) ataccgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt > 1:658586‑M2/40‑101 (MQ=255) accgtgatggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc > 1:6745316‑M2/38‑101 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActct > 1:9720746/1‑101 (MQ=255) aaGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACtctc > 1:4703114/1‑101 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCa < 1:9111111/101‑1 (MQ=255) ggggctggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGa < 1:852887‑M2/72‑1 (MQ=255) ccATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGa < 1:869506/101‑1 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAt < 1:5082011/101‑1 (MQ=255) tggcaatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTCCGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACt > 1:8922216‑M2/25‑101 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg < 1:10214102/101‑1 (MQ=255) taAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTgg > 1:2174745/1‑101 (MQ=255) caatgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGt < 1:11156524‑M2/80‑1 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTc < 1:12287262/101‑1 (MQ=255) tgaccggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAg > 1:9461252‑M2/19‑101 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAg < 1:3243828/101‑1 (MQ=40) aaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGc > 1:10369096/1‑101 (MQ=40) aaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGc > 1:11225622/1‑101 (MQ=40) aaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGc < 1:538445/101‑1 (MQ=40) cggggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAt < 1:1893144‑M2/87‑1 (MQ=255) ccGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAAt > 1:12186112/1‑101 (MQ=37) gggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTc > 1:1000435‑M2/13‑101 (MQ=255) gggttgttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTc < 1:12401705‑M2/89‑1 (MQ=255) ggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTg > 1:5772067/1‑101 (MQ=35) tAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGcc < 1:10884310/101‑1 (MQ=33) ttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc > 1:11840424‑M2/7‑101 (MQ=255) ttatccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc < 1:428889‑M2/95‑1 (MQ=255) ttCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCat > 1:10700691/1‑101 (MQ=11) atccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAGTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTGTGGCCCat > 1:2756634‑M2/5‑101 (MQ=255) tccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCata > 1:7626997‑M2/4‑101 (MQ=255) tccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCata > 1:4984493‑M2/4‑101 (MQ=255) ccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCatat > 1:11961695‑M2/3‑101 (MQ=255) ccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCatat < 1:5255717‑M2/99‑1 (MQ=255) ccCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCatat < 1:2979004‑M2/99‑1 (MQ=255) cCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAtt > 1:11039652‑M2/2‑101 (MQ=255) | CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > NC_007779/2519622‑2519821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |