Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,546,535 | T→A | 100% | intergenic (+296/‑182) | fimB → / → fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,546,535 | 0 | T→A | 100.0% | 1055.0 | 253 | intergenic (+296/‑182) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (124/129): ref base (0/0): total (124/129) |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 | tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:8946517/101‑1 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:7034849/101‑1 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:11670266/101‑1 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt > 1:10083781/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt > 1:8058085/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATAAAAAt < 1:12134459/101‑1 (MQ=255) ttAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAg < 1:8113134/101‑1 (MQ=255) aaaaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAt > 1:5933959/1‑101 (MQ=255) aaaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtg < 1:12669961/101‑1 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt > 1:7189203/1‑101 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg > 1:4969006/1‑101 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc > 1:1249870/1‑101 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc > 1:2065140/1‑101 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc > 1:6109119/1‑101 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc > 1:8291256/1‑101 (MQ=255) gTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACAt < 1:11886674/101‑1 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc < 1:4646302/101‑1 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc > 1:10577017/1‑101 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc < 1:9259540/101‑1 (MQ=255) tCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAg > 1:11800526/1‑101 (MQ=255) cGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTg < 1:3343210/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:3802103/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:9833136/101‑1 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGCAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat > 1:11380711/1‑101 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat > 1:9430343/1‑101 (MQ=255) cTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGatat < 1:5060407/101‑1 (MQ=255) cTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGatat < 1:11226274/101‑1 (MQ=255) ttttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatt > 1:3975285/1‑101 (MQ=255) ttttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatt < 1:12606598/101‑1 (MQ=255) ttttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatt < 1:8455840/101‑1 (MQ=255) tttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattt > 1:1375082/1‑101 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACCGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt < 1:7581711/101‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat > 1:2024831/1‑101 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt > 1:10802147/1‑101 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt > 1:5540995/1‑101 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt > 1:11815591/1‑101 (MQ=255) tCTTTATTTTATAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt < 1:6324574/101‑1 (MQ=255) cTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttattt > 1:11517601/1‑101 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt < 1:10293225/101‑1 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt < 1:12055940/101‑1 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTCATCCACTGCAGTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTAttttt > 1:6753036/1‑101 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTAttttt > 1:8650251/1‑101 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTAttttt < 1:10602903/101‑1 (MQ=255) tATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTg < 1:12693839/101‑1 (MQ=255) tATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTg > 1:2173857/1‑101 (MQ=255) ttttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTa < 1:9737875/101‑1 (MQ=255) ttttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTa < 1:7844514/101‑1 (MQ=255) tttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTAt < 1:9717238/101‑1 (MQ=255) tttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTAt > 1:7890041/1‑101 (MQ=255) tttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGa > 1:8560668/1‑101 (MQ=255) ttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGat < 1:6548251/101‑1 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:11030862/1‑101 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata < 1:1979556/101‑1 (MQ=255) aaGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGatat < 1:5439027/101‑1 (MQ=255) aGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAtt < 1:10021260/101‑1 (MQ=255) gCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAttt < 1:3539848/101‑1 (MQ=255) cAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTa < 1:693235/101‑1 (MQ=255) cAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTa > 1:9619705/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:5851910/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:1250366/1‑101 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:6035948/1‑101 (MQ=255) aCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt < 1:7743006/101‑1 (MQ=255) cTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATg > 1:4354692/1‑101 (MQ=255) cTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATg > 1:3140603/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa < 1:5703382/101‑1 (MQ=255) gAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTaa < 1:10205748/101‑1 (MQ=255) aaGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAt < 1:10732745/101‑1 (MQ=255) aaGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAt > 1:4692226/1‑101 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt > 1:7351141/1‑101 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAACAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:2897270/101‑1 (MQ=255) gTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTg < 1:1868058/101‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGa < 1:11588087/101‑1 (MQ=255) tAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGAc < 1:13101499/101‑1 (MQ=255) aaTCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATTAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACt > 1:9040088/1‑101 (MQ=255) tCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGa > 1:10883877/1‑101 (MQ=255) cACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa > 1:10171365/1‑101 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg < 1:10962566/101‑1 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGGAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGc > 1:9008520/1‑101 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGc > 1:13069041/1‑101 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGc > 1:11725032/1‑101 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCca < 1:1597555/101‑1 (MQ=255) cAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcac < 1:1296955/101‑1 (MQ=255) aaTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcaca > 1:2938401/1‑101 (MQ=255) tCTATTGTTATATTTAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:2664554/101‑1 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc > 1:5875972/1‑101 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:6268531/101‑1 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:7438927/101‑1 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc < 1:1780752/101‑1 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc < 1:8362807/101‑1 (MQ=255) tGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:4258170/1‑101 (MQ=255) ttATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCTCATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgt > 1:10459514/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg < 1:3987634/101‑1 (MQ=255) tatTGAATCAAAATAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 1:8671164/101‑1 (MQ=255) tatTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 1:10693604/101‑1 (MQ=255) atTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtgt < 1:10708895/101‑1 (MQ=255) ttGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg < 1:10769091/101‑1 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCGCTCCGTGTGTGGTTAt < 1:9501113/101‑1 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:7642916/1‑101 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:12362083/1‑101 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:7782783/1‑101 (MQ=255) | TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |