| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1305037 | 13 (0.050) | 260 (1.060) | 129/172 | NT | 95.4% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
| ? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase | |||||
Only 100 of 361 total aligned reads displayed.
GCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/1304934‑1305037‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTG > NC_007779/2519723‑2519822 CGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCCTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATC < 1:13139288/101‑1 GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC > 1:4373650/1‑101 ATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCGAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATA < 1:13042856/101‑1 ATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATA > 1:3568128/1‑101 ATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATA < 1:513266/101‑1 ATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATA > 1:5618175/1‑101 TACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAA < 1:6822717/101‑1 CTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGC < 1:2000483/101‑1 GGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCT < 1:4643145/101‑1 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTA < 1:7588665/101‑1 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTA < 1:828707/101‑1 GTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTA < 1:5351174/101‑1 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GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG > 1:5911308/1‑101 GCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:1660675/101‑1 GGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT > 1:11967756/1‑101 GTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:9797/101‑1 GTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTG < 1:11282100/101‑1 TATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:7688226/1‑101 GCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:4309371/101‑1 GCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:12063053/101‑1 GCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA > 1:1151985/1‑101 CCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:8421934/101‑1 GCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 1:3777423/1‑101 CATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC < 1:12632074/101‑1 TAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTTCGCCTGA > 1:4580389/1‑101 TAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA > 1:2854297/1‑101 AAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 1:6076291/101‑1 AACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 1:10600513/101‑1 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AATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGC < 1:4205360/101‑1 TGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:890808/1‑101 TGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG < 1:11756759/101‑1 TGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG > 1:10024757/1‑101 GGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGAT > 1:8249776/1‑101 GACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG < 1:7974803/101‑1 GACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG > 1:9421957/1‑101 ACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 1:2549572/101‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |