| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 303 [0] | [0] 303 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 273 (1.090) | 142/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGC > NC_007779/3958022‑3958222 | cGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGt < 1:2563169‑M1/101‑2 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc < 1:1597239‑M1/101‑3 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtc > 1:7636037‑M1/1‑99 (MQ=255) gCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgt < 1:5501121‑M1/101‑5 (MQ=255) tGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttg > 1:6903281‑M1/1‑95 (MQ=255) tGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttg > 1:10657716‑M1/1‑95 (MQ=255) tGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttg < 1:2668938‑M1/101‑7 (MQ=255) cggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgcta < 1:4689804‑M1/101‑10 (MQ=255) ggcgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaa > 1:1310488‑M1/1‑91 (MQ=255) cgACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagt > 1:9812085‑M1/1‑89 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:4993000‑M1/1‑88 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:8950150‑M1/1‑88 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg < 1:3938109‑M1/101‑14 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg > 1:8381314‑M1/1‑88 (MQ=255) gACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtg < 1:8049252‑M1/101‑14 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg > 1:11590117‑M1/1‑86 (MQ=255) cGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtggg < 1:7585347‑M1/101‑16 (MQ=255) ctctctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtg > 1:4593584‑M1/1‑84 (MQ=255) tctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaa < 1:10370569‑M1/101‑21 (MQ=255) tctGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaa > 1:12745695‑M1/1‑81 (MQ=255) tGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaaga < 1:3449774‑M1/101‑23 (MQ=255) cGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaac > 1:11196428‑M1/1‑77 (MQ=255) gTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactg > 1:12253642‑M1/1‑75 (MQ=255) tGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgg > 1:2832260‑M1/1‑74 (MQ=255) gggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactgga > 1:10285070‑M1/1‑73 (MQ=255) ggCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggac > 1:3740753‑M1/1‑72 (MQ=255) cATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccac > 1:1190447‑M1/1‑69 (MQ=255) aTTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccaca > 1:8518061‑M1/1‑68 (MQ=255) tttGCCGGTAGCGTGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaa > 1:1106735‑M1/1‑67 (MQ=255) ttGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaa < 1:4352301‑M1/101‑36 (MQ=255) cGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaac > 1:2424337‑M1/1‑62 (MQ=255) gTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactg < 1:6673819‑M1/101‑42 (MQ=255) gagCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgg < 1:5357547‑M1/100‑43 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgga > 1:10464486‑M1/1‑58 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgga > 1:6255846‑M1/1‑58 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactgga < 1:12555278‑M1/101‑44 (MQ=255) aGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactagaccacaaaaaactgga < 1:5642212‑M1/101‑44 (MQ=255) gggTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacga < 1:9431824‑M1/101‑47 (MQ=255) ggTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgat > 1:7994202‑M1/1‑54 (MQ=255) ggTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgat < 1:662625‑M1/101‑48 (MQ=255) gTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggatcacaaaaaactggacgatg > 1:8217722‑M1/1‑53 (MQ=255) gTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatg > 1:12036865‑M1/1‑53 (MQ=255) tCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgt < 1:11259236‑M1/101‑50 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg < 1:12014335‑M1/101‑51 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg > 1:6804074‑M1/1‑51 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtg > 1:2123008‑M1/1‑51 (MQ=255) tGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgc > 1:8743837‑M1/1‑50 (MQ=255) gcTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaa > 1:2526457‑M1/1‑46 (MQ=255) cTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaat < 1:4105389‑M1/101‑57 (MQ=255) cTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaat > 1:9862236‑M1/1‑45 (MQ=255) gATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataa < 1:8871539‑M1/101‑59 (MQ=255) aTCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataat > 1:11507583‑M1/1‑42 (MQ=255) aTCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataat < 1:12363814‑M1/101‑60 (MQ=255) tCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatc < 1:1810504‑M1/101‑61 (MQ=255) cTCGGTATCGACCTCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgt < 1:11331280‑M1/101‑63 (MQ=255) cTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgt > 1:2376774‑M1/1‑39 (MQ=255) cGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgc < 1:4270362‑M1/101‑65 (MQ=255) ggTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcg > 1:6096491‑M1/1‑36 (MQ=255) gTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgc > 1:8611845‑M1/1‑35 (MQ=255) cGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccgga > 1:515158‑M1/1‑31 (MQ=255) cGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccgga > 1:12476146‑M1/1‑31 (MQ=255) gACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggat > 1:5686797‑M1/1‑30 (MQ=255) gACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggat < 1:3027642‑M1/101‑72 (MQ=255) aCCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatg < 1:1925813‑M1/101‑73 (MQ=255) aCCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatg < 1:5440096‑M1/101‑73 (MQ=255) aCCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatg > 1:9560386‑M1/1‑29 (MQ=255) ccGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatgg < 1:7388201‑M1/101‑74 (MQ=255) ccGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatgg > 1:4763599‑M1/1‑28 (MQ=255) ccGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatgg > 1:12864978‑M1/1‑28 (MQ=255) cGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggc < 1:7009580‑M1/101‑75 (MQ=255) cGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggc < 1:9315976‑M1/101‑75 (MQ=255) gCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggca < 1:5612262‑M1/101‑76 (MQ=255) gCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggca > 1:11752176‑M1/1‑26 (MQ=255) cTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaa > 1:4057799‑M1/1‑25 (MQ=255) tATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaac > 1:2955583‑M1/1‑22 (MQ=255) tATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaac < 1:1358614‑M1/101‑80 (MQ=255) tGTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgc < 1:5065849‑M1/101‑82 (MQ=255) gTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgca > 1:661295‑M1/1‑19 (MQ=255) gTCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggaaaaacgca > 1:4912642‑M1/1‑19 (MQ=255) tCAGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaagaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcac > 1:6030075‑M1/1‑18 (MQ=255) aGAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacga < 1:1002734‑M1/101‑86 (MQ=255) gAAGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaa > 1:4507986‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaat > 1:9712791‑M1/1‑14 (MQ=255) aGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaatt < 1:3393274‑M1/101‑89 (MQ=255) aGCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaatt > 1:1520095‑M1/1‑13 (MQ=255) gCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaatta < 1:10185376‑M1/101‑90 (MQ=255) gCTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaatta < 1:12922656‑M1/101‑90 (MQ=255) cTCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattat < 1:13030035‑M1/101‑91 (MQ=255) tCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatc > 1:3563229‑M1/1‑10 (MQ=255) tCGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatc > 1:3239552‑M1/1‑10 (MQ=255) cGTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcc > 1:2318925‑M1/1‑9 (MQ=255) gTGCGCTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcct > 1:6297240‑M1/1‑8 (MQ=255) gcgcTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctct < 1:11680408‑M1/101‑96 (MQ=255) cgcTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctctt < 1:7744983‑M1/101‑97 (MQ=255) cgcTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctctt < 1:12675576‑M1/101‑97 (MQ=255) cgcTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctctt < 1:6166131‑M1/101‑97 (MQ=255) cTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaa > 1:3348290‑M1/1‑3 (MQ=255) cTGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaa < 1:10103894‑M1/101‑99 (MQ=255) tGtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaat < 1:3300858‑M1/101‑100 (MQ=255) gtcgttgctaagtgggtgaaagaactggaccacaaaaaactggacgatgtgctgaataatcgtgcgccggatggcaaaacgcacgaattatcctcttaatc > 1:3849489‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGACTAACCTGGTCGGTAACGGCGTAGCGACCATTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGC > NC_007779/3958022‑3958222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |