| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4355060 = | 0 (0.000) | 268 (1.040) | 140/180 | NT | 100% | coding (1281/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | 4502861 = | NA (NA) | intergenic (+241/‑46) | intB/insC | integrase/IS2 insertion element repressor InsA | |||||
Only 100 of 630 total aligned reads displayed.
TTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354960‑4355160 | atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcaggaggccagtctag < 1:1064265‑M1/1‑1 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcg > 1:2590144‑M1/99‑100 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCg > 1:8216843‑M1/98‑101 (MQ=255) tcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCt < 1:9147916‑M1/6‑1 (MQ=255) tcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCt < 1:12368466‑M1/6‑1 (MQ=255) cTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:10349185‑M1/101‑1 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:7434055‑M1/101‑1 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG > 1:10144248‑M1/1‑101 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:5936955‑M1/101‑1 (MQ=255) tAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:3475541‑M1/101‑1 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctagcgatat > 1:4486787‑M1/95‑96 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg > 1:11325932‑M1/1‑100 (MQ=255) aaTTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGg < 1:1965170‑M1/101‑2 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt < 1:13130350‑M1/101‑5 (MQ=255) ttCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatt < 1:7296968‑M1/101‑5 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTg > 1:6659766‑M1/91‑101 (MQ=255) cGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttg > 1:7719595‑M1/1‑95 (MQ=255) gCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgc > 1:1679555‑M1/1‑94 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGc < 1:459371‑M1/16‑1 (MQ=255) cTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgccc > 1:1086315‑M1/1‑92 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCt > 1:1337169‑M1/85‑101 (MQ=255) ccGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccct < 1:4228826‑M1/101‑12 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCttt > 1:1883198‑M1/79‑101 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc < 1:6911069‑M1/24‑1 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTc < 1:9276071‑M1/24‑1 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAc > 1:10971052‑M1/76‑101 (MQ=255) agtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCAc > 1:219934‑M1/76‑101 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTg > 1:11164481‑M1/74‑101 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGt < 1:5811042‑M1/29‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGt > 1:12980029‑M1/73‑101 (MQ=255) cccTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccaga < 1:2772644‑M1/101‑23 (MQ=255) cTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagaca < 1:8995265‑M1/101‑25 (MQ=255) cTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagaca > 1:3733245‑M1/1‑77 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:7801343‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:12882423‑M1/1‑70 (MQ=255) cTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgtta > 1:6783976‑M1/1‑70 (MQ=255) tCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:8290920‑M1/101‑33 (MQ=255) tCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:8783914‑M1/101‑33 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAg < 1:3079937‑M1/39‑1 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGc > 1:5067413‑M1/62‑101 (MQ=255) cAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatca < 1:4816493‑M1/101‑35 (MQ=255) cAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:1052770‑M1/1‑67 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGt > 1:11986400‑M1/60‑101 (MQ=255) cgcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcactt < 1:11083201‑M1/101‑38 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTAt < 1:3919362‑M1/44‑1 (MQ=255) gcgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccacacatctgttatcactta > 1:521894‑M1/1‑63 (MQ=255) cgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa > 1:4300281‑M1/1‑62 (MQ=255) cgTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaa < 1:6426063‑M1/101‑40 (MQ=255) gTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGCCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac > 1:7960661‑M1/1‑61 (MQ=255) ttCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 1:1755856‑M1/101‑44 (MQ=255) atcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTa > 1:11574749‑M1/52‑101 (MQ=255) tCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 1:10720878‑M1/101‑45 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAAt < 1:6141374‑M1/53‑1 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATc < 1:12179972‑M1/54‑1 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCg < 1:6286492‑M1/55‑1 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCg < 1:761356‑M1/55‑1 (MQ=255) ttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCg > 1:10008595‑M1/47‑101 (MQ=255) tCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca > 1:7355142‑M1/1‑53 (MQ=255) cAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa < 1:1572321‑M1/101‑50 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTc > 1:8634377‑M1/44‑101 (MQ=255) gATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc > 1:3621084‑M1/1‑50 (MQ=255) gATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc < 1:9719050‑M1/101‑52 (MQ=255) ttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcg > 1:7028579‑M1/43‑101 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgc > 1:8897518‑M1/42‑101 (MQ=255) taagtgatattggtggtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCGGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgc > 1:11485785‑M1/42‑101 (MQ=255) ttCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCCCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg < 1:8478557‑M1/101‑55 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcg < 1:9400222‑M1/61‑1 (MQ=255) aagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTcgcg < 1:2423160‑M1/61‑1 (MQ=255) cccAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgct > 1:3188134‑M1/1‑45 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGt > 1:11751082‑M1/37‑101 (MQ=255) gatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGt < 1:5464975‑M1/65‑1 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGtt > 1:11866926‑M1/36‑101 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtataGCCTCTGTATGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGtt > 1:10234452‑M1/36‑101 (MQ=255) aaCGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc > 1:6572323‑M1/1‑42 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTa < 1:8433661‑M1/67‑1 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAAt > 1:4119561‑M1/33‑101 (MQ=255) 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tCACTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatttcaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccca < 1:2285392‑M1/101‑90 (MQ=255) gtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc > 1:11638658‑M1/6‑101 (MQ=255) gtctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAAc > 1:12634871‑M1/6‑101 (MQ=255) ctaGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCg > 1:11935509‑M1/4‑101 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc > 1:10804161‑M1/1‑10 (MQ=255) aCTGCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagc > 1:10427746‑M1/1‑10 (MQ=255) taGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg < 1:5601530‑M1/99‑1 (MQ=255) taGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCgg < 1:9614935‑M1/99‑1 (MQ=255) aGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGa < 1:7995359‑M1/100‑1 (MQ=255) gCCGCTGgatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgca < 1:5520384‑M1/101‑95 (MQ=255) | TTACGCTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGTCTGGCAGCTGGCTTTCACTGTTTAAAATCAGCGTATGGCCTAAATCGGTCGCGCGGTTAATCTTGCTGATTAAAAAACCAGCGATAACCGGAG > NC_007779/4354960‑4355160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |