| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 1,301,041 | Δ1,336 bp | 100% | insC–insD | insC, insD | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 1301041–1302367 | 1302376 | 10–1336 | 227 [0] | [0] 225 | insC–insD | insC, insD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1301040 | 0 (0.000) | 184 (0.840) | 110/166 | NT | 100% | intergenic (+218/‑90) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein |
| ? | NC_007779 | 1302377 = | 0 (0.000) | intergenic (+19/‑519) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT > NC_007779/1302277‑1302477 | gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattat < 1:6493424‑M2/1‑1 (MQ=255)gttagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattat < 1:5321780‑M2/1‑1 (MQ=255) tagttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattatta < 1:9853886‑M2/3‑1 (MQ=255) agttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTaa < 1:9846400‑M2/4‑1 (MQ=255) agttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTaa < 1:8106452‑M2/4‑1 (MQ=255) ttataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAAtt > 1:7574131‑M2/96‑101 (MQ=255) tataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTc > 1:6354488‑M2/95‑101 (MQ=255) ataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTcc < 1:8581360‑M2/8‑1 (MQ=255) ataaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTcc > 1:11867739‑M2/94‑101 (MQ=255) taaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCa < 1:7836448‑M2/9‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCAc < 1:10454342‑M2/10‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCAc < 1:3400097‑M2/10‑1 (MQ=255) aaggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCAc > 1:448964‑M2/92‑101 (MQ=255) aggatttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACt > 1:11762263‑M2/91‑101 (MQ=255) atttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGcc < 1:2270022‑M2/14‑1 (MQ=255) ttccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCtt > 1:2233667‑M2/86‑101 (MQ=255) tccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCttt < 1:6790419‑M2/17‑1 (MQ=255) ccttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTg < 1:11565628‑M2/18‑1 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTgg > 1:9717473‑M2/83‑101 (MQ=255) cttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTgg > 1:10610229‑M2/83‑101 (MQ=255) ttaactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGt < 1:8638686‑M2/20‑1 (MQ=255) taactgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTa < 1:2914865‑M2/21‑1 (MQ=255) ctgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTagag > 1:1828517‑M2/78‑101 (MQ=255) tgcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAgg > 1:8434793‑M2/77‑101 (MQ=255) gcttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGa < 1:7344527‑M2/26‑1 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGaa > 1:3119679‑M2/75‑101 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGaa > 1:6687847‑M2/75‑101 (MQ=255) cttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGaa > 1:7122380‑M2/75‑101 (MQ=255) ttctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGaaa > 1:3926793‑M2/74‑101 (MQ=255) ctcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGt < 1:8099351‑M2/30‑1 (MQ=255) tcctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTg < 1:7295667‑M2/31‑1 (MQ=255) cctcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGc < 1:10881965‑M2/32‑1 (MQ=255) tcaccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTa > 1:5315335‑M2/68‑101 (MQ=255) accatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTaaa < 1:2518210‑M2/36‑1 (MQ=255) ccatcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaat < 1:3350752‑M2/37‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaata < 1:4975542‑M2/38‑1 (MQ=255) catcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaata < 1:10251201‑M2/38‑1 (MQ=255) atcatgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataa > 1:9104772‑M2/63‑101 (MQ=255) catgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataata < 1:5973638‑M2/41‑1 (MQ=255) catgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataata < 1:358912‑M2/41‑1 (MQ=255) catgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataata < 1:3864942‑M2/41‑1 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa < 1:9531449‑M2/42‑1 (MQ=255) atgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataa > 1:4574889‑M2/60‑101 (MQ=255) tgttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAaataataat > 1:11092641‑M2/59‑101 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCa > 1:11887798‑M2/57‑101 (MQ=255) ttattttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCa > 1:5591155‑M2/57‑101 (MQ=255) attttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAt < 1:8789198‑M2/47‑1 (MQ=255) ttttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAtt < 1:9354525‑M2/48‑1 (MQ=255) ttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGt > 1:9240333‑M2/52‑101 (MQ=255) ttcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGt < 1:6138098‑M2/50‑1 (MQ=255) tcgccacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGtt > 1:732797‑M2/51‑101 (MQ=255) cacatcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAat < 1:1298545‑M2/55‑1 (MQ=255) catcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:4412028‑M2/57‑1 (MQ=255) atcataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:6189319‑M2/58‑1 (MQ=255) ataatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:10837097‑M2/41‑101 (MQ=255) taatcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:10294828‑M2/40‑101 (MQ=255) atcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa > 1:6652051‑M2/38‑101 (MQ=255) tcctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATtgttaaattattcttcag < 1:3269912‑M2/65‑7 (MQ=255) cctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:2374116‑M2/66‑1 (MQ=255) ctgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:8907403‑M2/35‑101 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc > 1:3448189‑M2/34‑101 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:9087524‑M2/68‑1 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc > 1:3743357‑M2/34‑101 (MQ=255) tgggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc > 1:3006634‑M2/34‑101 (MQ=255) gggcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:1586670‑M2/33‑101 (MQ=255) gcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCCTTTCact > 1:11162004‑M2/31‑101 (MQ=255) gcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact < 1:2457827‑M2/71‑1 (MQ=255) gcttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact < 1:1415‑M2/71‑1 (MQ=255) cttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCacta < 1:8731924‑M2/72‑1 (MQ=255) ttgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac < 1:3080795‑M2/73‑1 (MQ=255) tgctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:7917197‑M2/74‑1 (MQ=255) gctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:1632959‑M2/27‑101 (MQ=255) ctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 1:1951847‑M2/76‑1 (MQ=255) ctgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGAGCATTTCACTACTgg > 1:9576002‑M2/26‑101 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa > 1:4424595‑M2/25‑101 (MQ=255) tgaagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 1:6416943‑M2/77‑1 (MQ=255) aagaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc < 1:5187794‑M2/79‑1 (MQ=255) agaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:7440171‑M2/80‑1 (MQ=255) agaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:7245264‑M2/22‑101 (MQ=255) gaataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg < 1:11633400‑M2/81‑1 (MQ=255) aataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 1:3688575‑M2/82‑1 (MQ=255) ataattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa > 1:5075572‑M2/19‑101 (MQ=255) taattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa < 1:2506585‑M2/84‑1 (MQ=255) taattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:1549330‑M2/18‑101 (MQ=255) aattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:5844105‑M2/17‑101 (MQ=255) aattgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:4452496‑M2/85‑1 (MQ=255) ttgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCa < 1:9783534‑M2/87‑1 (MQ=255) tgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAg < 1:4195076‑M2/88‑1 (MQ=255) tgaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAg < 1:6612650‑M2/88‑1 (MQ=255) gaaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGa > 1:12074258‑M2/13‑101 (MQ=255) aaatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaa < 1:8233431‑M2/90‑1 (MQ=255) aatgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGaaa < 1:9003921‑M2/91‑1 (MQ=255) tgatattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAg > 1:7591395‑M2/9‑101 (MQ=255) tattaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATa < 1:4703961‑M2/96‑1 (MQ=255) attaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 1:3912781‑M2/97‑1 (MQ=255) attaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 1:8373234‑M2/97‑1 (MQ=255) attaTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAg < 1:7620416‑M2/97‑1 (MQ=255) aTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACa < 1:4125218‑M2/100‑1 (MQ=255) aTTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACa > 1:11062967‑M2/2‑101 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAt > 1:8517394/1‑101 (MQ=255) | GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAATCAGAAAAGATAGACAT > NC_007779/1302277‑1302477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |